1-Pyrenebutyric acid

别名: 1-芘丁酸;1-Pyrenebutyric Acid 1-芘丁酸;1-芘丁酸N-苄基马来酰亚胺;1-芘基丁酸; 4-(3-芘基)丁酸;4-(1-芘基)丁酸
目录号: V45930 纯度: ≥98%
1-芘丁酸是一种荧光探针,可用于DNA的荧光测量。
1-Pyrenebutyric acid CAS号: 3443-45-6
产品类别: New3
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产品描述
1-芘丁酸是一种可用于DNA荧光测量的荧光探针。1-芘丁酸可用作生物分子的连接剂,在石墨烯上形成自组装单层。
1-芘丁酸(CAS 3443-45-6),又称4-(1-芘基)丁酸,是一种多环芳烃衍生物,属于芘类荧光团。其分子式为C20H16O2,分子量为288.34 g/mol。它由一个芘基团和一个丁酸链连接而成,具有强荧光、长寿命和用于生物偶联的反应性羧酸基团。该化合物具有明亮的蓝色发射和强π-π堆积作用,使其成为制备荧光探针、聚合物标记和微环境传感的理想材料。
生物活性&实验参考方法
靶点
1-Pyrenebutyric acid does not have a specific biological target as a drug. Its primary role is as a fluorescent probe for studying proteins, lipids, nucleic acids, and other biological systems. Its mechanism of action is based on its fluorescence properties: the pyrene chromophore absorbs light and emits fluorescence, the lifetime and intensity of which are sensitive to local environmental factors such as oxygen concentration, free radical concentration, and polarity. This sensitivity makes it a valuable tool for sensing and reporting on the microenvironment in biological and chemical systems.
体外研究 (In Vitro)
在体外,1-芘丁酸可用作荧光标记剂,用于检测和追踪生物分子。它广泛应用于荧光光谱学以及各种应用中的分子探针。其强荧光性和形成π-π堆积聚集体的能力使其可用于研究膜动力学、蛋白质构象和核酸相互作用。该化合物的活性羧酸基团可被活化并与蛋白质或其他生物分子上的胺基偶联,从而构建用于多种检测的荧光标记探针。
体内研究 (In Vivo)
1-芘丁酸的体内活性通常不进行研究,因为它是一种荧光探针而非生物活性药物。然而,芘衍生物因其在光动力疗法和成像剂方面的潜力而备受关注。该化合物的荧光可用于追踪动物模型中偶联分子的分布。例如,可以将标记有1-芘丁酸的抗体注射到小鼠体内,并通过检测组织中芘的荧光来监测其生物分布。
酶活实验
体外酶/受体结合(非细胞)实验通常使用1-芘丁酸作为荧光标记物或探针。蛋白质标记的标准方案如下:首先,1-芘丁酸与碳二亚胺(例如EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)反应,生成琥珀酰亚胺酯,从而活化该化合物。然后,将活化的酯与蛋白质溶液在pH 7-8的条件下于室温孵育2小时。标记后的蛋白质通过透析或尺寸排阻色谱法纯化。标记程度通过测量342 nm(芘)和280 nm(蛋白质)处的吸光度来确定。该标记蛋白质可用于结合实验,以研究蛋白质-蛋白质或蛋白质-配体相互作用。
细胞实验
体外细胞检测1-芘丁酸的方法通常包括使用该化合物或其缀合物来标记和可视化细胞结构。细胞标记的标准流程如下:将细胞培养在盖玻片上,并在37°C下用1-芘丁酸缀合物(例如,标记的抗体或肽)处理1-2小时。然后用PBS洗涤细胞以去除未结合的探针,并用多聚甲醛固定。将盖玻片安装在载玻片上,并使用配备适当激发(例如,340 nm)和发射(例如,380 nm)滤光片的荧光显微镜进行观察。芘的激基缔合物的形成也可用于研究膜流动性和聚集。
动物实验
1-芘丁酸本身通常不进行体内动物实验。然而,对于1-芘丁酸缀合物,例如标记抗体或纳米颗粒,生物分布研究的标准方案是:将荧光标记的缀合物静脉注射到小鼠体内。在不同时间点(例如注射后1、6、24小时),处死动物,并收集器官(肝脏、脾脏、肾脏、心脏、肺脏、脑)。将组织匀浆,并使用荧光计测量芘标记的荧光强度,以确定缀合物的分布。或者,也可以制备组织切片进行荧光显微镜观察。
药代性质 (ADME/PK)
1-芘丁酸的药代动力学性质尚未得到充分表征。该化合物的计算XLogP3-AA值为5.1,表明其具有高亲脂性。它部分溶于水,可溶于DMSO和甲醇等有机溶剂。熔点为184-186℃。由于其分子量较小(288.34 g/mol),口服给药后可能被吸收,但其高亲脂性可能导致广泛的组织分布和蛋白结合。羧酸基团可能发生结合或代谢。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1-芘丁酸的毒性数据显示其具有刺激性。危险代码 Xi(刺激物)和风险说明 R36/37/38 表明其对眼睛、呼吸系统和皮肤有刺激性。安全说明建议接触后穿戴合适的防护服 (S36),并用大量清水冲洗眼睛,同时就医 (S26)。该化合物是一种多环芳烃衍生物,虽然未被列为致癌物,但仍应谨慎操作。应在通风良好的区域,佩戴适当的个人防护装备进行处理。
参考文献

[1]. Fluorescence determination of DNA with 1-pyrenebutyric acid nanoparticles coated with beta-cyclodextrin as a fluorescence probe. Spectrochim Acta A Mol Biomol Spectrosc. 2005 Apr;61(6):1201-5.

[2]. On Monolayer Formation of Pyrenebutyric Acid on Graphene. Langmuir. 2017 Apr 18;33(15):3588-3593.

其他信息
1-芘丁酸是一种用途广泛的芘类荧光染料,具有明亮的蓝色荧光和强π-π堆积作用。它是制备荧光探针、聚合物标记和微环境传感的理想材料。该化合物中活性羧酸基团使其能够与蛋白质、肽和其他含胺分子进行生物偶联。其荧光寿命取决于局部氧气和自由基的浓度。它广泛应用于荧光光谱和分子探针领域。该化合物并非药物,目前没有临床应用或获批。它仅供科研用途,可从化学品供应商处购买。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H16O2
分子量
288.3398
精确质量
288.115
CAS号
3443-45-6
PubChem CID
76977
外观&性状
Light yellow to light brown solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
515.9±19.0 °C at 760 mmHg
熔点
184-186 °C(lit.)
闪点
412.3±16.6 °C
蒸汽压
0.0±1.4 mmHg at 25°C
折射率
1.775
LogP
5.37
tPSA
37.3
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
418
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
QXYRRCOJHNZVDJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H16O2/c21-18(22)6-2-3-13-7-8-16-10-9-14-4-1-5-15-11-12-17(13)20(16)19(14)15/h1,4-5,7-12H,2-3,6H2,(H,21,22)
化学名
4-pyren-1-ylbutanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~346.81 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.67 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.4681 mL 17.3406 mL 34.6813 mL
5 mM 0.6936 mL 3.4681 mL 6.9363 mL
10 mM 0.3468 mL 1.7341 mL 3.4681 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们