1M7

别名: 1M 7 1M-7 1M7
目录号: V9270 纯度: ≥98%
1M6是一种用于RNA结构化学检测的试剂。
1M7 CAS号: 4693-01-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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纯度: ≥98%

产品描述
1M6 是一种用于 RNA 结构化学检测的试剂。
1M7(1-甲基-7-亚硝基异靛酸酐,CAS 4693-01-0)是一种广泛用于通过 SHAPE(选择性 2'-羟基酰化引物延伸分析)分析来探测 RNA 结构的试剂。它是一种亲电试剂,可选择性地与柔性 RNA 核苷酸的 2'-羟基反应,从而有助于研究 RNA 的构象和相互作用。该化合物对核苷酸的偏好性较低,常用于分子生物学和遗传学研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
1M7 does not have a specific pharmacological target. It is a chemical reagent used for RNA structural analysis rather than a therapeutic agent. The compound reacts with the 2'-hydroxyl group of RNA nucleotides, with the reactivity being dependent on the local flexibility and dynamics of the RNA structure. Flexible regions of RNA react more readily with 1M7, while rigid or structured regions show reduced reactivity. This property enables the determination of RNA secondary and tertiary structures.
体外研究 (In Vitro)
在体外,1M7 用于对 RNA 分子进行化学修饰,以进行结构探测研究。该化合物选择性地酰化柔性 RNA 核苷酸的 2'-羟基。然后通过引物延伸或高通量测序分析修饰后的 RNA,以确定修饰位点。反应谱提供了有关 RNA 二级结构、三级相互作用和构象变化的信息。1M7 已被验证为一种稳健可靠的 SHAPE 试剂,且核苷酸偏好性低。
体内研究 (In Vivo)
1M7 的体内应用受到限制,因为该化合物不适用于修饰细胞内 RNA。它主要用于体外 RNA 结构探测研究。该化合物无法穿透细胞膜,因此只能用于无细胞体系或纯化的 RNA 样品。体内 RNA 结构探测通常需要不同的试剂或递送方法。
酶活实验
使用 1M7 进行 SHAPE 分析的一般流程包括以下步骤:将 RNA 在 95°C 下变性 2 分钟,然后在 37°C 下用折叠缓冲液(100 mM HEPES pH 8.0、100 mM NaCl、10 mM MgCl2)复性 20 分钟。将 1M7 溶解于 DMSO 中,浓度为 100 mM,然后加入到 RNA 中,使其最终浓度为 5-10 mM。反应在 37°C 下孵育 2-5 分钟。反应通过乙醇沉淀或离心柱纯化终止。将修饰后的 RNA 与荧光标记的引物进行引物延伸,然后进行毛细管电泳或测序。每个核苷酸的反应活性根据峰强度计算。
细胞实验
基于细胞的RNA结构分析的一般流程包括将目标RNA转染细胞或从质粒表达该RNA。然而,1M7不适用于细胞内RNA修饰。对于体内应用,则使用能够穿透细胞膜的替代SHAPE试剂(例如,NAI、2-甲基烟酸咪唑化物)。对于体外研究,首先从细胞中纯化RNA或在体外合成RNA,然后按照上述方法进行1M7修饰。修饰后的RNA可通过引物延伸、毛细管电泳或下一代测序进行分析。
动物实验
由于1M7无法穿透细胞膜,因此体内RNA结构探测的通用方案通常不使用1M7。取而代之的是使用细胞可渗透的SHAPE试剂,例如NAI(2-甲基烟酸咪唑化物)。在这些研究中,将细胞用试剂(50-200 mM)在37°C下处理5-30分钟。然后提取RNA,并通过引物延伸或测序来鉴定修饰位点。利用反应谱推断RNA在其天然细胞环境中的结构。1M7仍然是体外SHAPE分析的首选试剂。
药代性质 (ADME/PK)
1M7 是一种化学试剂,而非药物。其分子量为 222.15 g/mol。该化合物通常以固体形式在室温下储存,使用前立即溶解于 DMSO 或无水 DMSO 中。其溶液稳定性有限,每次实验均需配制新鲜溶液。该化合物的理化性质已得到充分表征,可用作 SHAPE 试剂。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1M7 是一种化学试剂,应按照标准实验室安全防护措施进行操作。接触后可能引起皮肤和眼睛刺激。应避免吸入粉尘或蒸汽。该化合物应在通风良好的通风橱内使用,并佩戴适当的个人防护装备(手套、护目镜、实验服)。1M7 的毒性数据有限,但通常认为,在正确操作的情况下,其在研究实验室中使用是安全的。
参考文献
Roston TM, Dewar L, Franciosi S, Hathaway J, Bartels K, Cunningham T, Gibbs KA, Sheps S, Laksman ZWM, Sanatani S, Krahn AD. The accessibility and utilization of genetic testing for inherited heart rhythm disorders: a Canadian cross-sectional survey study. J Community Genet. 2017 Nov 23. doi: 10.1007/s12687-017-0348-y. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 29170972.
其他信息
1M7(1-甲基-7-亚硝基异靛酸酐)是一种广泛用于RNA结构探测的SHAPE试剂。它是一种化学工具,而非药物。该化合物核苷酸偏好性低,是该领域最常用的SHAPE试剂之一。它不适用于修饰细胞内RNA。1M7已在众多研究中得到验证,被认为是体外RNA结构探测的金标准。它没有治疗适应症,也未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H7N2O5
分子量
223.164
精确质量
222.028
CAS号
4693-01-0
相关CAS号
4693-01-0
PubChem CID
78414
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.551g/cm3
沸点
392.4ºC at 760mmHg
闪点
191.1ºC
折射率
1.623
LogP
0.923
tPSA
98.03
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
16
分子复杂度/Complexity
350
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(N(C)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C12)OC2=O
InChi Key
FJSZPPSFHYCQHQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H6N2O5/c1-10-5-3-2-4-6(11(14)15)7(5)8(12)16-9(10)13/h2-4H,1H3
化学名
1-methyl-5-nitro-2H-benzo[d][1,3]oxazine-2,4(1H)-dione
别名
1M 7 1M-7 1M7
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~450.15 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (11.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (11.25 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.4811 mL 22.4054 mL 44.8109 mL
5 mM 0.8962 mL 4.4811 mL 8.9622 mL
10 mM 0.4481 mL 2.2405 mL 4.4811 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT05462145 RECRUITING Device: Globe Pulsed Field System Paroxysmal Atrial Fibrillation
Persistent Atrial Fibrillation
Kardium Inc. 2023-03-09 Not Applicable
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