| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Human 2-oxoglutarate (2OG) dependent oxygenases (inhibitor) [1]
. - Specifically inhibits: aspartate/asparagine-β-hydroxylase (AspH), JmjC lysine-specific N-demethylase 4E (KDM4E), factor inhibiting HIF (FIH), ribosomal oxygenase 2 (RIOX2/MINA53) [1] . - IC50 values against specific enzymes are detailed in the "In Vitro" section [1] . |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
AspH 抑制：在采用肽底物 (hFX-EGFDI86-124-4Ser) 的固相萃取-质谱联用 (SPE-MS) 检测中，2,4-PDCA 对人 AspH 的抑制 IC50 值约为 0.03 μM [1]
。 - KDM4E 抑制：在监测组蛋白 3 肽 (H3K9me3) 去甲基化的 SPE-MS 检测中，2,4-PDCA 对人 KDM4E 的抑制 IC50 值约为 0.29 μM [1] 。 - FIH 抑制：在 SPE-MS 检测中，2,4-PDCA 对人 FIH 的抑制 IC50 值约为 4.7 μM [1] 。 - RIOX2 抑制： 2,4-PDCA在以RPL27A31-49为底物的SPE-MS分析中，对人RIOX2的抑制IC50约为4.0 μM [1] 。 - F-和CF3-取代的影响：2,4-PDCA的F-和CF3-取代衍生物（化合物7、8、13、14）对所测试的2OG加氧酶的抑制活性通常低于2,4-PDCA本身，但也有以下例外和观察结果： - C5位F-取代衍生物(8)对AspH的抑制活性(IC50 ~0.05 μM)与2,4-PDCA(IC50 ~0.03 μM)相似[1] 。 - C3和C5位F-取代与 2,4-PDCA 相比，衍生物 (7 和 8) 对 KDM4E 的抑制活性大约低四倍（IC50 分别为 ~1.12 μM 和 1.30 μM）[1]。 - CF3 取代的衍生物 (13 和 14) 对 AspH 和 KDM4E 的抑制活性显著降低，对 AspH 的 IC50 值 >10 μM，对 KDM4E 的 IC50 值 >20 μM [1]。 - 在所测试的浓度下，所有 F 或 CF3 取代的衍生物 (7、8、13、14) 均未显示出对 FIH 或 RIOX2 的显著抑制作用（FIH 的 IC50 >100 μM；RIOX2 的 IC50 >100 μM）[1]。 - 选择性分析：在……处引入 F 或 CF3 取代基与未取代的2,4-PDCA相比，C5位取代的2,4-PDCA（化合物8和14）对AspH的选择性显著提高，而对KDM4E的选择性则显著降低。C5位氟取代衍生物（8）的这种差异尤为显著，它保留了对AspH的强效抑制作用（IC50 0.05 μM），而对KDM4E的抑制作用则显著减弱（IC50 1.30 μM）[1]。晶体学研究：AspH与氟取代衍生物（7和8）复合物的X射线晶体学分析揭示了它们的结合模式。它们通过其氮原子和2-羧酸根与活性位点金属（晶体结构中的Mn）配位，类似于未取代的2,4-PDCA。 F-取代基指向活性位点入口（C3-F）或由Tyr391、Tyr406和Lys409残基形成的口袋（C5-F），这解释了观察到的效力和选择性的差异[1] 。 |
| 酶活实验 |
通用SPE-MS抑制活性测定：采用固相萃取-质谱联用（SPE-MS）法测定2,4-PDCA及其衍生物对人2OG加氧酶（AspH、FIH、KDM4E、RIOX2）的抑制活性。该方法直接监测酶催化引起的肽底物质量变化：AspH、FIH和RIOX2的羟基化反应（+16 Da），以及KDM4E的去甲基化反应（-14 Da和-28 Da）。实验在384孔板中进行。使用声波分液器将化合物（溶于DMSO）分装，制备3倍稀释、11个浓度点的系列溶液（最高浓度为100 μM）。DMSO的最终浓度保持在0.5%。将酶混合物（含重组人2OG加氧酶的缓冲液）加入孔板中并进行孵育。然后，加入底物混合物（包含肽底物、2OG、L-抗坏血酸和硫酸亚铁铵）以启动反应。孵育后，用甲酸终止反应。使用与Q-TOF质谱仪联用的超高通量进样机器人分析反应板。将样品上样至C4固相萃取柱，洗涤后洗脱进行质谱分析。对底物和产物肽的峰面积进行积分，并计算转化率。使用GraphPad Prism [1]拟合归一化剂量反应曲线来确定IC50值。
- RIOX2特异性检测详情：对于RIOX2，酶混合物包含0.3 μM His-RIOX2-465，溶于反应缓冲液（50 mM HEPES，50 mM NaCl，pH 7.5）。与抑制剂孵育 15 分钟后，加入含有 10 μM RPL27A31-49 底物肽、200 μM L-抗坏血酸、20 μM 2OG 和 20 μM 硫酸亚铁铵的反应缓冲液中的底物混合物。30 分钟后，用 10% 甲酸水溶液终止反应。底物和羟基化产物肽的 m/z +4 电荷态用于定量分析 [1]。 - 检测质量：检测质量高，Z' 因子 >0.5。2,4-PDCA 及其活性衍生物的抑制曲线的 Hill 斜率接近理论值 -1，这与 2OG 竞争结合活性位点相符 [1]。 |
| 药代性质 (ADME/PK) |
文中提及了潜在的应用，但并未提供关于ADME性质的实验数据。文中指出，2,4-PDCA骨架上的疏水性F或CF3取代基可能提高细胞壁渗透性。此外，文中还提到，2,4-PDCA二甲酯已用于细胞和体内研究，这表明酯化是增强细胞渗透性的策略[1]。文中还建议，F取代的衍生物可用作19F NMR探针，并且可能开发放射性标记的18F类似物用于正电子发射断层扫描（PET）研究[1]。
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| 参考文献 |
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| 其他信息 |
鲁替丁酸是一种吡啶二羧酸，其2位和4位均带有羧基。它是鲁替丁酸(1-)的共轭酸。
背景和作用：2,4-PDCA（吡啶-2,4-二羧酸）是一种众所周知的广谱2-氧戊二酸(2OG)依赖性加氧酶抑制剂。它的作用机制是与辅底物2OG竞争结合活性位点Fe(II) [1] 。 -选择性特征：尽管2,4-PDCA是一种广谱抑制剂，但它表现出独特的选择性特征。它能有效抑制AspH和一些JmjC激酶衍生的酶（如KDM4E），但对PHD和FIH的抑制作用较弱[1]。 - 提高选择性的衍生物：本研究探索了在C3和C5位引入F和CF3取代的2,4-PDCA衍生物，以提高抑制剂的选择性。结果表明，在C5位引入取代基，特别是氟原子，可以显著提高对AspH相对于KDM4E的选择性，同时保持对AspH的抑制活性。与之前对 C3 位点进行修饰的尝试相比，这是一个显著的改进[1]。 - 衍生物的潜在应用：F 取代的 2,4-PDCA 衍生物有望具有以下应用： - 验证 AspH 作为癌症治疗靶点的工具（AspH 在某些癌细胞中表达上调）[1]。 - 用作亲核芳香取代反应的缺电子底物，以标记某些 2OG 加氧酶（例如 TET 酶）中的活性位点半胱氨酸残基[1]。 - 用作蛋白质结合研究的 19F NMR 探针[1]。 - 开发 18F 标记的正电子发射断层扫描 (PET) 示踪剂的潜在支架[1]。 |
| 分子式 |
C7H5NO4
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|---|---|
| 分子量 |
167.12
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| 精确质量 |
167.021
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| CAS号 |
499-80-9
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| PubChem CID |
10365
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| 外观&性状 |
Off-white to light yellow solid powder
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| 密度 |
1.6±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
574.8±35.0 °C at 760 mmHg
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| 熔点 |
243-246 °C
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| 闪点 |
301.4±25.9 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.7 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.628
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| LogP |
-0.19
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| tPSA |
87.49
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
2
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| 重原子数目 |
12
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| 分子复杂度/Complexity |
204
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
MJIVRKPEXXHNJT-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C7H5NO4/c9-6(10)4-1-2-8-5(3-4)7(11)12/h1-3H,(H,9,10)(H,11,12)
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| 化学名 |
pyridine-2,4-dicarboxylic acid
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| 别名 |
2,4-PDCA 2,4PDCA 2,4 PDCA
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~598.37 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (14.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (14.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (14.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 5.9837 mL | 29.9186 mL | 59.8372 mL | |
| 5 mM | 1.1967 mL | 5.9837 mL | 11.9674 mL | |
| 10 mM | 0.5984 mL | 2.9919 mL | 5.9837 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
| NCT Number | Recruitment | interventions | Conditions | Sponsor/Collaborators | Start Date | Phases |
| NCT05830383 | ACTIVE, NOT RECRUITING | Behavioral: PDCA circular management | PDCA Circular Management | Sun Yat-Sen Memorial Hospital of Sun Yat-Sen University | 2022-03-09 | Not Applicable |
| NCT02675777 | COMPLETED | Other: Quality Improvement Intervention |
Alcohol Use Disorder Alcohol, Drinking |
Kaiser Permanente | 2016-02 | Not Applicable |
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