3'-Azido-3'-deoxy-5-fluorocytidine

别名: 3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷
目录号: V31755 纯度: ≥98%
3'-Azido-3'-deoxy-5-氟胞苷(化合物 12)是胞苷类似物。
3'-Azido-3'-deoxy-5-fluorocytidine CAS号: 2095417-18-6
产品类别: New2
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产品描述
3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷(化合物12)是胞苷类似物。3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷是一种点击化学试剂。它含有叠氮基(N3)部分,可以与带有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可以与带有BCN或DBCO基团的化合物发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷(化合物12)是一种胞苷衍生物。其分子式为C₉H11FN₆O4,分子量为286.22 g/mol。该化合物的特征在于3'位被叠氮基取代并脱去一个羟基,同时在5'位引入一个氟原子。该化合物是一种核苷类似物,可用作点击化学试剂。它含有叠氮基(N3),能够与含有炔基的化合物发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary targets of 3'-Azido-3'-deoxy-5-fluorocytidine are not well-defined as specific receptors or enzymes, as it is primarily used as a chemical reagent rather than a therapeutic agent. However, the compound is described as a potent antiviral medication, primarily used in the treatment of HIV/AIDS, by suppressing viral replication through inhibition of reverse transcriptase. As a cytidine derivative, it may be incorporated into viral DNA during replication, causing chain termination and inhibiting viral proliferation. Its azide moiety also allows for bioorthogonal conjugation reactions, enabling the labeling and functionalization of biomolecules.
体外研究 (In Vitro)
3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷的体外研究主要集中于其作为点击化学试剂和核苷类似物合成的结构单元的应用。该化合物的叠氮基团可与含炔烃的化合物发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。这使其可用于标记核苷、核苷酸和寡核苷酸,引入荧光标签、生物素或其他功能基团。该化合物还可能具有抗病毒活性,因为它被认为是一种用于治疗HIV/AIDS的强效抗病毒药物。其在点击化学中的应用使其成为化学生物学和分子生物学研究的重要工具。
体内研究 (In Vivo)
3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷的体内研究有限,因为它主要用作化学试剂而非治疗药物。然而,该化合物被描述为一种用于治疗HIV/AIDS的抗病毒药物,这表明其具有体内应用潜力。作为一种抑制逆转录酶的核苷类似物,它可用于HIV感染或其他病毒性疾病的动物模型研究。需要进一步研究以评估其体内药代动力学特性、生物利用度和疗效。如果存在合适的炔基探针,该化合物的叠氮基团也可用于体内生物正交标记。
酶活实验
在体外酶/受体结合试验中,3'-叠氮-3'-脱氧-5-氟胞苷可作为逆转录酶或其他核酸聚合酶的底物或抑制剂进行评估。将该化合物与酶、模板和核苷酸在不同浓度下孵育。通过测量核酸合成量来定量酶活性。IC₅0值可由剂量反应曲线确定。该化合物与病毒酶的结合可使用生物物理方法进行评估。其叠氮基团可用于后续的检测或通过点击化学进行偶联。标准试验条件包括合适的缓冲体系和辅助因子。
细胞实验
在体外细胞实验中,可使用3'-叠氮-3'-脱氧-5-氟胞苷在病毒感染细胞中进行测试,以评估其抗病毒活性。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的化合物处理。通过qPCR、噬斑试验或其他检测方法测量病毒复制情况。监测化合物对细胞活力的影响。可使用标记或荧光衍生物评估其细胞摄取和代谢情况。该化合物的叠氮基团可用于通过点击化学反应,利用炔基荧光探针检测其掺入核酸的情况。
动物实验
在体内动物实验中,3'-叠氮-3'-脱氧-5-氟胞苷可根据其溶解度和药代动力学特性,通过多种途径给药,包括灌胃、静脉注射或腹腔注射。其作为抗病毒药物的疗效可在病毒感染动物模型中进行评估。典型的给药方案为每日或间歇给药,剂量范围为1至50 mg/kg。评估指标包括病毒载量、存活率和免疫反应。测定的药代动力学参数包括Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率。动物实验应遵循相应的伦理准则。
药代性质 (ADME/PK)
文献中对3'-叠氮-3'-脱氧-5-氟胞苷的药代动力学性质描述尚不充分。作为一种分子量为286.22 g/mol的核苷类似物,其口服生物利用度可能有限,且清除迅速。全身给药后,该化合物很可能通过核苷激酶和其他酶进行代谢。其在循环中的半衰期取决于其稳定性和清除机制。叠氮基和氟基的存在可能影响其代谢稳定性。需要进一步的药代动力学研究来全面表征其吸收、分布、代谢和排泄情况。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷主要用作化学试剂,因此其毒理学数据有限。作为一种核苷类似物,其毒性取决于其掺入核酸的情况以及对细胞代谢的影响。含叠氮化合物在高浓度下可能具有毒性,因此应采取适当的安全预防措施。该化合物作为抗病毒剂的潜力表明其可能具有良好的治疗指数,但仍需进行全面的毒理学研究。与所有研究用化学品一样,在处理该化合物时应采取适当的安全预防措施。
参考文献

[1]. Synthesis of 3'-Azido-D/L-nucleosides. Chinese Journal of Organic Chemistry, 2018, 38(1): 138-147.

其他信息
3'-叠氮基-3'-脱氧-5-氟胞苷是一种研究用化合物,用作点击化学试剂和核苷类似物合成的结构单元。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管批准报道。它仅供研究用途,可从多家化学品供应商处获得。该化合物是胞苷衍生物,带有叠氮基(N3)部分,可与含炔烃的化合物发生CuAAc反应。它也被描述为一种用于治疗HIV/AIDS的强效抗病毒药物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H11FN6O4
分子量
286.21984410286
精确质量
286.082
CAS号
2095417-18-6
PubChem CID
137628662
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-1.3
tPSA
123
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
531
定义原子立体中心数目
4
SMILES
FC1C(N)=NC(N(C=1)[C@H]1[C@@H]([C@@H]([C@@H](CO)O1)N=[N+]=[N-])O)=O
InChi Key
MOEHIWUXKDQZBL-UAKXSSHOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H11FN6O4/c10-3-1-16(9(19)13-7(3)11)8-6(18)5(14-15-12)4(2-17)20-8/h1,4-6,8,17-18H,2H2,(H2,11,13,19)/t4-,5-,6-,8-/m1/s1
化学名
4-amino-1-[(2R,3R,4S,5S)-4-azido-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-fluoropyrimidin-2-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~140 mg/mL (~489.13 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.33 mg/mL (8.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 23.3 mg/mL的澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中并混合均匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.33 mg/mL (8.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 23.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.33 mg/mL (8.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 23.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.4938 mL 17.4691 mL 34.9382 mL
5 mM 0.6988 mL 3.4938 mL 6.9876 mL
10 mM 0.3494 mL 1.7469 mL 3.4938 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们