3-Methylcytidine

目录号: V31636 纯度: ≥98%
3-甲基胞苷是一种尿苷,用作四种不同类型癌症(肺癌、胃癌、结肠癌和乳腺癌)的生物标志物。
3-Methylcytidine CAS号: 2140-64-9
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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100mg
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产品描述
3-甲基胞苷是一种尿苷,可用作四种不同类型癌症(肺癌、胃癌、结肠癌和乳腺癌)的生物标志物。
3-甲基胞苷(CAS 2140-64-9)是胞苷的甲基化衍生物,也是一种参与RNA结构和功能的修饰核苷。它是一种尿核苷,可用作四种不同类型癌症的生物标志物:肺癌、胃癌、结肠癌和乳腺癌。其分子式为C₁₀H₁₅N₃O₅,分子量为257.24。
生物活性&实验参考方法
靶点
3-Methylcytidine is a modified nucleoside that is incorporated into RNA. Its presence and levels can reflect RNA modification patterns and cellular metabolism. As a urinary nucleoside, its levels in urine can serve as a biomarker for cancer. Elevated levels of modified nucleosides in urine are associated with increased cell turnover and RNA metabolism in tumors.
体外研究 (In Vitro)
在体外,3-甲基胞苷被用作检测和定量修饰核苷的标准品。它用于研究RNA修饰及其对基因表达的影响。生物样品中3-甲基胞苷的含量可以通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)或其他分析技术进行测定。
体内研究 (In Vivo)
在体内,3-甲基胞苷是尿液中的一种正常代谢产物。某些癌症患者的3-甲基胞苷水平可能升高,使其成为早期检测和监测疾病的潜在生物标志物。其作为生物标志物的应用是目前的研究热点。
酶活实验
代谢物定量分析中,3-甲基胞苷可通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)或气相色谱-质谱联用(GC-MS)在尿液或其他生物样品中进行测定。样品经处理后,化合物在合适的色谱柱上分离,并通过质谱仪进行检测。定量分析可采用外标法或同位素标记内标法。
细胞实验
在细胞研究中,首先培养细胞,然后测量培养基或细胞裂解液中3-甲基胞苷的水平。也可以用影响RNA甲基化的化合物处理细胞,并测量由此引起的3-甲基胞苷水平的变化。
动物实验
在体内研究中,从动物模型或人体受试者采集尿液样本。采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)法测定3-甲基胞苷的水平。将其水平与疾病状态(例如肿瘤负荷)进行相关性分析,以评估其作为生物标志物的潜力。
药代性质 (ADME/PK)
由于3-甲基胞苷是内源性代谢物,因此其药代动力学数据不适用。其尿液浓度反映了其生成和清除率。它主要经尿液排泄。目前尚无关于其具体药代动力学参数的报道。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
3-甲基胞苷是一种正常代谢产物,在生理浓度下无毒。目前尚未有关于其急性毒性、器官特异性毒性或致突变性的报道。作为研究用化学品,应按照标准实验室安全规程进行操作。
参考文献

[1]. Urinary nucleosides as biomarkers of breast, colon, lung, and gastric cancer in Taiwanese. PLoS One. 2013 Dec 19;8(12):e81701.

其他信息
3-甲基胞苷是一种甲基胞苷。据报道,3-甲基胞苷存在于巴氏地钱(Geodia barretti)中,相关数据可供参考。
3-甲基胞苷(CAS 2140-64-9)是一种修饰核苷,也是肺癌、胃癌、结肠癌和乳腺癌的尿液生物标志物。其分子式为C₁₀H₁₅N₃O₅,分子量为257.24。它用于RNA修饰和癌症生物标志物的研究,仅供科研使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H15N3O5
分子量
257.2432
精确质量
257.101
CAS号
2140-64-9
PubChem CID
14237477
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.71g/cm3
沸点
471.9ºC at 760mmHg
闪点
239.2ºC
蒸汽压
6.88E-11mmHg at 25°C
折射率
1.701
LogP
-1.7
tPSA
120.7
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
399
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CN1C(=N)C=CN(C1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
InChi Key
RDPUKVRQKWBSPK-ZOQUXTDFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H15N3O5/c1-12-6(11)2-3-13(10(12)17)9-8(16)7(15)5(4-14)18-9/h2-3,5,7-9,11,14-16H,4H2,1H3/t5-,7-,8-,9-/m1/s1
化学名
1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-4-imino-3-methylpyrimidin-2-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~90 mg/mL (~349.87 mM)
DMSO : ~83.33 mg/mL (~323.94 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (8.09 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (8.09 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (8.09 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 100 mg/mL (388.74 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.8874 mL 19.4371 mL 38.8742 mL
5 mM 0.7775 mL 3.8874 mL 7.7748 mL
10 mM 0.3887 mL 1.9437 mL 3.8874 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们