3-Oxopentanedioic acid

别名: 1,3-丙酮二羧酸; 丙酮1,3-二羧酸; 1,3-丙酮-2-羧酸; 3-氧化戊二酸; 1,3-丙酮二羧酸(冷藏); 1-3-丙酮二羧酸; 丙酮二羧酸; 1,3-Acetonedicarboxylic Acid 丙酮二羧酸; 3-戊酮二酸;3-氧代戊二酸;2-側氧戊二酸;3-酮戊二酸;Β-酮戊二酸;1,3-丙酮二羧酸​
目录号: V30220 纯度: ≥98%
3-氧代戊二酸是一种简单的二羧酸,可用作有机化学合成的中间体。
3-Oxopentanedioic acid CAS号: 542-05-2
产品类别: New1
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产品描述
3-氧代戊二酸是一种简单的二羧酸,可用作有机化学合成的中间体。
3-氧代戊二酸(CAS号:542-05-2),又称1,3-丙酮二羧酸或3-氧代戊二酸,是一种分子式为C5H6O5的简单二羧酸。它是一种beta-酮二羧酸,是重要的有机化学合成中间体。该化合物为白色至类白色粉末,熔点为133℃(分解)。它也被称为beta-酮戊二酸,是合成多种药物化合物的结构单元。
生物活性&实验参考方法
靶点
3-Oxopentanedioic acid does not have a well-defined pharmacological target in the traditional sense of a drug target. As a metabolic intermediate, it is involved in various biochemical pathways, including the synthesis of tropinone and the tricarboxylic acid (TCA) cycle. It is known to be anaplerotic, meaning it can refill the pool of TCA cycle intermediates. Research indicates that the compound can inhibit enzymes involved in cellular processes, particularly TET2, which is crucial for DNA demethylation and gene regulation. Its mechanism in biological systems often involves decarboxylation to succinic semialdehyde.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,3-氧代戊二酸能够抑制参与细胞过程的酶,特别是TET2酶,后者在DNA去甲基化和基因调控中起着关键作用。研究人员利用该化合物研究酶的机制,特别是脱羧酶和转移酶的机制。作为一种代谢中间体,其生物活性主要与其在中间代谢中的作用相关,而非直接的药理作用。该化合物还可用作酶促反应的底物,用于研究脱羧和缩合反应。
体内研究 (In Vivo)
在体内,3-氧代戊二酸作为代谢中间体参与三羧酸循环和氮代谢。它在氮代谢中至关重要,是谷氨酸和谷氨酰胺的前体。在生物医学研究中,人们关注其抗氧化特性、抗衰老潜力和代谢调节作用。该化合物的补充代谢作用使其能够补充三羧酸循环中间体,从而支持细胞能量代谢。它还可用于营养补充剂和与线粒体功能相关的生化分析。
酶活实验
3-氧戊二酸的体外酶活性测定通常涉及研究以该化合物为底物的脱羧酶或转移酶。该测定方法是在适宜的缓冲体系中,于最佳pH值和温度下,将酶与3-氧戊二酸(通常为0.1-10 mM)孵育。通过分光光度法、荧光法或色谱法监测产物的生成(例如,脱羧酶释放CO2或转移酶生成产物),从而监测反应进程。对于TET2抑制研究,将该化合物与TET2酶和DNA底物孵育,并通过质谱法或基于ELISA的方法测定DNA去甲基化的程度。
细胞实验
体外细胞实验通常使用细胞系来研究3-氧代戊二酸的代谢效应和酶抑制作用。细胞用不同浓度的化合物(通常为0.1-10 mM)处理24-72小时。使用Seahorse或类似的代谢分析仪,通过测量三羧酸循环中间体、ATP水平和耗氧率(OCR)来评估细胞代谢。对于TET2抑制研究,采用亚硫酸氢盐测序或甲基化特异性PCR来测量DNA甲基化水平。使用MTT或类似方法监测细胞活力,以确保观察到的代谢效应并非由细胞毒性引起。基因表达变化通过qPCR或RNA-seq进行分析。
动物实验
3-氧代戊二酸的体内动物研究通常采用啮齿动物给药,以研究其代谢效应。该化合物可通过口服、腹腔注射或静脉注射给药,剂量范围为10-200 mg/kg。代谢参数,包括血糖、胰岛素、血脂谱和三羧酸循环中间体,均在血浆和组织中进行测定。通过测定ATP水平和酶活性来评估肝脏和肌肉等组织中的线粒体功能。该化合物对体重、食物摄入量和代谢率的影响也可进行监测。通过测定血浆和组织中的氨基酸水平,可以研究其在氮代谢中的作用以及作为谷氨酸和谷氨酰胺前体的作用。
药代性质 (ADME/PK)
3-氧代戊二酸的药代动力学性质具有小分子二羧酸的特征。该化合物的分子量为132.07 (C5H6O5),呈白色至类白色粉末状。其熔点为133℃(分解),密度为400 kg/m3。作为一种极性水溶性化合物,预计其具有良好的水溶性和有限的膜渗透性。该化合物可能在三羧酸循环中快速代谢,并以CO2和水的形式排出体外。现有文献中关于其ADME(吸收、分布、代谢和排泄)参数(如半衰期、生物利用度和蛋白结合率)的详细记录尚不充分。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
3-氧代戊二酸的毒理学特性通常被认为较低,因为它是一种参与正常细胞代谢的内源性代谢物。作为一种二羧酸,高剂量可能引起局部刺激和代谢紊乱。该化合物可用作有机化学合成的中间体和研究工具,也用于营养补充剂和生化分析。现有文献中尚未报道其具体的LD50值或详细的毒性特征。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备。
参考文献

[1]. Carbon dioxide evolution in a Belousov-Zhabotinsky type oscillating reaction with acetonedicarboxylic acid. J Phys Chem A. 2007 Oct 11;111(40):10050-4.

其他信息
3-酮戊二酸是一种酮羧酸。
3-氧代戊二酸(CAS 542-05-2)又名1,3-丙酮二羧酸、3-氧代戊二酸和β-酮戊二酸。它是一种简单的二羧酸,是构建1,5-苯二氮卓类核心结构所必需的β-酮二羧酸,而1,5-苯二氮卓类核心结构是抗焦虑/抗惊厥候选药物的必要组成部分。该化合物既是内源性代谢产物,也是微生物代谢产物。它参与托品酮的合成,并具有补充作用,能够补充三羧酸循环中间体的含量。此外,它还可用于营养补充剂和与线粒体功能相关的生化分析。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C5H6O5
分子量
146.09814
精确质量
146.021
CAS号
542-05-2
PubChem CID
68328
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
沸点
408.4±30.0 °C at 760 mmHg
熔点
133 °C (dec.)(lit.)
闪点
214.9±21.1 °C
蒸汽压
0.0±2.0 mmHg at 25°C
折射率
1.494
LogP
-1.13
tPSA
91.67
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
10
分子复杂度/Complexity
153
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
OXTNCQMOKLOUAM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C5H6O5/c6-3(1-4(7)8)2-5(9)10/h1-2H2,(H,7,8)(H,9,10)
化学名
3-oxopentanedioic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 该产品在溶液状态不稳定,请现配现用。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~120 mg/mL (~821.36 mM)
H2O : < 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 3 mg/mL (20.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 30.0 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 3 mg/mL (20.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 30.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 3 mg/mL (20.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 30.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.8446 mL 34.2231 mL 68.4463 mL
5 mM 1.3689 mL 6.8446 mL 13.6893 mL
10 mM 0.6845 mL 3.4223 mL 6.8446 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们