3-Phenylbutyric acid

别名: 3Phenylbutyric acid; 3 Phenylbutyric acid ( /-)-3-苯基丁酸;3-苯基丁酸;(±)-3-苯基丁酸;(±)-β-甲基氢化肉桂酸
目录号: V38844 纯度: ≥98%
3-苯基丁酸通过苯环的初始氧化和侧链的初始氧化进行代谢,可用于从堆肥土壤中分离红红球菌PB1。
3-Phenylbutyric acid CAS号: 4593-90-2
产品类别: New2
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产品描述
3-苯基丁酸的代谢途径包括苯环的初始氧化和侧链的初始氧化,可用于从堆肥土壤中分离红球菌PB1。
3-苯基丁酸(CAS 4593-90-2)是一种单羧酸,是丁酸在3位被苯基取代的产物。由于C-3位的手性中心,它以(R)-和(S)-对映异构体的外消旋混合物形式存在。作为一种已知的细菌异源代谢产物,它是一种有用的研究化学品。它具有抗菌活性,并因其在不对称合成中作为手性砌块的作用而闻名。重要的是,它是苯乙酸的结构类似物,并且已被研究其在调节代谢途径中的潜在作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
3-Phenylbutyric acid is often cited as a histone deacetylase (HDAC) inhibitor, a function it shares with its isomer, 4-phenylbutyric acid (4-PBA). However, it is crucial to distinguish between the two, as 4-PBA is a markedly more potent HDAC inhibitor than 3-PBA. While some sources list it as an HDAC inhibitor, others classify it primarily as an endogenous metabolite. Its effects may also involve other receptors such as VDR and PPARγ.
体外研究 (In Vitro)
3-苯基丁酸具有抗菌活性,对幽门螺杆菌和大肠杆菌具有特异性抑制作用。重要的是,它不影响双歧杆菌和乳杆菌等有益菌的生长。此外,它对人U937细胞的细胞毒性较低,CC50大于2 mM。它对人U937细胞的抗增殖活性也较低,CC50大于2,000,000 nM。其生物学特性受手性影响,只有(R)-对映体能够促进红球菌PB1的生长。
体内研究 (In Vivo)
已知3-苯基丁酸在体内代谢主要通过涉及其苯环和侧链的初始氧化过程进行。研究表明,该化合物可作为从堆肥土壤中分离红球菌PB1的有效试剂。研究还将其用作该细菌的选择性底物。其作为细菌异源代谢产物的作用表明,环境中的微生物可以对其进行代谢。
酶活实验
对于非细胞检测,可使用标准肉汤微量稀释法评估该化合物的抗菌活性,以确定其对幽门螺杆菌等病原体的最低抑菌浓度 (MIC)。可使用重组 HDAC 酶和荧光底物进行体外酶活性测定,评估其作为 HDAC 抑制剂的潜在作用。该化合物本身可作为底物,用于研究红球菌 PB1 等细菌的对映选择性代谢。
细胞实验
体外细胞试验可在人U937细胞等细胞系中进行,以评估细胞毒性和抗增殖作用。将细胞置于不同浓度的化合物溶液中处理,并在设定的处理时间后,使用MTT或CellTiter-Glo等标准方法检测细胞活力。化合物的抗菌活性则采用标准肉汤微量稀释法进行评估,以确定其对幽门螺杆菌和大肠杆菌等病原体的最低抑菌浓度(MIC)。
动物实验
为了研究该化合物的代谢和生物效应,已开展了体内实验。一项研究通过向从石油污染沉积物中分离出的酵母菌 Trichosporon asahii B1 施用该化合物,研究了其代谢情况。另有研究利用 3-PBA 作为选择性底物,从堆肥土壤中分离出细菌 Rhodococcus rhodochrous PB1。在这些研究中,研究人员探讨了该化合物的代谢过程,包括苯环和侧链的初始氧化。
药代性质 (ADME/PK)
3-苯基丁酸是一种前药,主要在肝脏和肾脏代谢。它首先转化为苯基丁酰辅酶A,然后通过线粒体β-氧化代谢为活性形式苯乙酸。苯乙酸随后与谷氨酰胺结合形成苯乙酰谷氨酰胺,后者经尿液排出。在体内制剂中,它可以溶解于诸如10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween 80 + 45%生理盐水等溶剂中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
该化合物被归类为皮肤刺激剂 (H315)、眼刺激剂 (H319),并可能引起呼吸道刺激 (H335)。它还被归类为具有急性毒性 (H302)。处理该化合物前应查阅预防措施说明和安全数据表。该化合物的细胞毒性较低,在人 U937 细胞中的 CC50 值大于 2 mM。
参考文献

[1]. Enantioselective Metabolism of Chiral 3-Phenylbutyric Acid, an Intermediate of Linear Alkylbenzene Degradation, by Rhodococcus rhodochrous PB1. Appl Environ Microbiol. 1996 Mar;62(3):749-55.

[2]. Degradation of 3-phenylbutyric acid by Pseudomonas sp. J Bacteriol. 1982 Oct;152(1):411-21.

其他信息
3-苯乙酸是一种单羧酸,由丁酸3位被苯基取代而形成。它具有抗菌活性,是细菌的异生代谢产物。它属于苯类化合物,是一种单羧酸。其功能与3-苯基丙酸类似。3-苯基丁酸是4-苯基丁酸(4-PBA)的位置异构体,两者不能互换。4-PBA是一种比3-PBA活性显著更高的HDAC抑制剂。3-PBA本身可用作手性砌块,用于不对称合成(-)-马林戈利德和β-甲基苯丙氨酸的立体异构体等化合物。它也被称为(±)-β-甲基氢化肉桂酸。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₁₀H₁₂O₂
分子量
164.20
精确质量
164.083
CAS号
4593-90-2
PubChem CID
20724
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
288.0±0.0 °C at 760 mmHg
熔点
35-38 °C(lit.)
闪点
170.2±13.9 °C
蒸汽压
0.0±0.6 mmHg at 25°C
折射率
1.531
LogP
2.19
tPSA
37.3
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
12
分子复杂度/Complexity
148
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
ZZEWMYILWXCRHZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H12O2/c1-8(7-10(11)12)9-5-3-2-4-6-9/h2-6,8H,7H2,1H3,(H,11,12)
化学名
3-phenylbutanoic acid
别名
3Phenylbutyric acid; 3 Phenylbutyric acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~609.01 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (15.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (15.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (15.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.0901 mL 30.4507 mL 60.9013 mL
5 mM 1.2180 mL 6.0901 mL 12.1803 mL
10 mM 0.6090 mL 3.0451 mL 6.0901 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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