| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-Adenosine does not have a specific biological target itself but serves as a protected adenosine building block for oligonucleotide synthesis. When incorporated into oligonucleotides, the resulting sequences can target various biological molecules. The multiple protecting groups (DMT at 5'-position, TBDMS at 2'-position, benzoyl at N6-position) allow for selective deprotection and controlled synthesis of modified oligonucleotides. The TBDMS group at the 2'-position is commonly used in RNA synthesis to differentiate the 2'-hydroxyl from the 3'-hydroxyl.
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| 体外研究 (In Vitro) |
通过评估 5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷在寡核苷酸合成中的应用，评价其体外活性。通过监测三苯甲基阳离子释放量来评估固相合成过程中该化合物掺入不断增长的寡核苷酸链的效率。采用高效液相色谱（HPLC）分析评估该化合物的纯度及其在自动化寡核苷酸合成中的适用性。利用热熔解（Tm）分析评估所得寡核苷酸与互补序列的杂交能力。
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| 体内研究 (In Vivo) |
针对 5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷的体内研究通常使用以该结构单元合成的寡核苷酸，而非受保护的核苷本身。这些寡核苷酸在动物模型中用于评估其药代动力学特性、生物分布以及在反义疗法或 RNA 疗法等应用中的治疗效果。在寡核苷酸的合成和脱保护过程中，保护基团会被去除，因此最终的寡核苷酸含有天然的腺苷核苷。
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| 酶活实验 |
在寡核苷酸合成中，5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷转化为相应的亚磷酰胺，并使用标准固相合成方案将其掺入寡核苷酸中。该化合物溶解于无水乙腈中，并与正在延伸的寡核苷酸链偶联。在每个合成循环中，通过三苯甲基阳离子释放量来监测偶联效率。合成后，将寡核苷酸从固相载体上切割下来，并使用合适的试剂进行脱保护。通常使用含氟试剂（例如TBAF）去除TBDMS基团。最终的寡核苷酸通过高效液相色谱（HPLC）或聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）纯化，并通过质谱进行表征。
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| 细胞实验 |
在细胞研究中，培养的细胞用以5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷为结构单元合成的寡核苷酸处理。细胞与寡核苷酸孵育24-72小时后，使用荧光显微镜或流式细胞术，通过荧光标记的寡核苷酸评估细胞摄取情况。对于反义寡核苷酸应用，基因敲低效率通过qRT-PCR或Western blot进行评估。对于适体应用，与靶蛋白的结合通过表面等离子共振或ELISA进行评估。细胞毒性则使用MTT或CellTiter-Glo法进行评估。
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| 动物实验 |
为了对使用 5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷合成的寡核苷酸进行体内评估，通过各种途径将寡核苷酸给药于小鼠或大鼠。利用基于杂交的检测方法或液相色谱-质谱联用（LC-MS）测定血浆和组织中寡核苷酸的浓度，从而确定包括半衰期、清除率和组织分布在内的药代动力学参数。对于治疗应用，在合适的疾病模型（例如，用于反义疗法的肿瘤异种移植模型）中评估疗效，并随时间监测肿瘤体积或疾病生物标志物的变化。通过监测体重、器官组织病理学和血清化学指标来评估毒性。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
本文对含有 5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷的寡核苷酸（而非受保护的核苷本身）的药代动力学性质进行了表征。该化合物的分子量为 787.97，通常以固体形式处理。TBDMS 保护基团通过保护 2'-羟基，实现了选择性 RNA 合成。详细的药代动力学参数取决于具体的寡核苷酸序列、长度和骨架化学性质。建议在惰性气体保护下于 -20°C 保存。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷是一种仅供实验室使用的研究化合物，未获准用于人体治疗。作为腺苷衍生物，它可用作寡核苷酸合成的中间体。该化合物含有DMT、TBDMS和苯甲酰基保护基。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全操作规程。建议在惰性气体保护下于-20°C储存。
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| 其他信息 |
5'-O-DMT-2'-O-TBDMS-N-Bz-腺苷是一种腺苷衍生物，分子式为C44H49N5O7Si，分子量为787.97。它是一种寡核苷酸合成中间体，其5'位被DMT保护，2'位被TBDMS保护（用于RNA合成），腺嘌呤的N6位被苯甲酰基保护。该化合物仅供研究使用，尚未获准用于临床。建议在惰性气体保护下于-20°C保存。
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| 分子式 |
C44H49N5O7SI
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|---|---|
| 分子量 |
787.97
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| 精确质量 |
787.34
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| CAS号 |
81265-93-2
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| PubChem CID |
13871229
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
7.826
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| tPSA |
139.08
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
14
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| 重原子数目 |
57
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| 分子复杂度/Complexity |
1250
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| 定义原子立体中心数目 |
4
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| SMILES |
CC(C)(C)[Si](C)(C)O[C@@H]1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=NC3=C(N=CN=C32)NC(=O)C4=CC=CC=C4)COC(C5=CC=CC=C5)(C6=CC=C(C=C6)OC)C7=CC=C(C=C7)OC)O
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| InChi Key |
DAZIGOPASNJPCJ-GNECSJIWSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C44H49N5O7Si/c1-43(2,3)57(6,7)56-38-37(50)35(55-42(38)49-28-47-36-39(45-27-46-40(36)49)48-41(51)29-14-10-8-11-15-29)26-54-44(30-16-12-9-13-17-30,31-18-22-33(52-4)23-19-31)32-20-24-34(53-5)25-21-32/h8-25,27-28,35,37-38,42,50H,26H2,1-7H3,(H,45,46,48,51)/t35-,37-,38-,42-/m1/s1
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| 化学名 |
N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。 (2). 该产品在溶液状态不稳定，请现配现用。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : 50 mg/mL (63.45 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (3.17 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2691 mL | 6.3454 mL | 12.6908 mL | |
| 5 mM | 0.2538 mL | 1.2691 mL | 2.5382 mL | |
| 10 mM | 0.1269 mL | 0.6345 mL | 1.2691 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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