5'-O-DMT-Bz-rA

别名: 5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷; 5''-O-(4,4''-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷; 5-O-(4,4-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷; 5`-O-(4,4`-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷
目录号: V52939 纯度: ≥98%
5'-O-DMT-Bz-rA 是环状二核苷酸化合物制备/合成的中间体。
5'-O-DMT-Bz-rA CAS号: 81246-82-4
产品类别: Nucleoside Antimetabolite/Analog
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
5'-O-DMT-Bz-rA 是环状二核苷酸化合物制备/合成的中间体。
5'-O-DMT-Bz-rA(CAS号:81246-82-4)是一种核苷中间体,用于环状二核苷酸化合物的制备和合成。其分子式为C38H35N5O7,分子量为673.71。该化合物由一个核糖连接到一个腺嘌呤碱基上构成,核糖的N6位带有苯甲酰基保护基,5'位带有二甲氧基三苯甲基(DMT)保护基。它是合成环状二核苷酸的关键结构单元,而环状二核苷酸是重要的信号分子。
生物活性&实验参考方法
靶点
5'-O-DMT-Bz-rA does not have a specific biological target itself but serves as a chemical intermediate for the synthesis of cyclic dinucleotide compounds. Cyclic dinucleotides are important second messengers in both prokaryotic and eukaryotic cells, involved in various signaling pathways, including the STING pathway in innate immunity. As a protected nucleoside, the compound enables the controlled synthesis of these bioactive molecules.
体外研究 (In Vitro)
5'-O-DMT-Bz-rA 的体外活性通过其作为环状二核苷酸合成结构单元的实用性来评估。其掺入环状二核苷酸结构的效率和最终产物的纯度是衡量其实用性的关键指标。该化合物本身不具有生物活性,但可作为合成生物活性分子的前体。
体内研究 (In Vivo)
针对 5'-O-DMT-Bz-rA 的体内研究,并非直接使用中间体本身,而是使用该结构单元合成的环状二核苷酸。这些环状二核苷酸在动物模型中用于评估其药代动力学特性、生物分布以及在癌症免疫疗法(STING 激动剂)等应用中的治疗效果。合成过程中会去除保护基团,最终得到的环状二核苷酸含有天然腺苷核苷。
酶活实验
环状二核苷酸的合成以5'-O-DMT-Bz-rA为起始原料,经多步化学合成。该化合物通常先转化为相应的亚磷酰胺,然后用于标准的亚磷酰胺化学反应合成环状二核苷酸。合成进程通过高效液相色谱(HPLC)监测,最终产物则通过质谱和核磁共振(NMR)进行表征。
细胞实验
在细胞研究中,使用 5'-O-DMT-Bz-rA 合成的环状二核苷酸在基于细胞的检测中进行测试。用环状二核苷酸处理细胞,并通过测量下游信号通路(例如 STING 通路)的激活情况来评估其生物活性。评估化合物诱导干扰素产生或其他免疫反应的能力。
动物实验
为了对环状二核苷酸进行体内评价,研究人员通过各种途径给小鼠或大鼠给药。测定包括半衰期、清除率和组织分布在内的药代动力学参数。对于治疗应用,则在合适的疾病模型中评估其疗效,例如用于癌症免疫疗法的肿瘤异种移植模型,并监测肿瘤体积或疾病生物标志物的变化。
药代性质 (ADME/PK)
5'-O-DMT-Bz-rA 的药代动力学性质是针对包含该结构单元的环状二核苷酸而非中间体本身进行表征的。该化合物的分子量为 673.71,纯度为 95%。通常以固体形式处理,并在推荐条件下储存以保持其稳定性。详细的药代动力学参数取决于所合成的具体环状二核苷酸。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
所提供的资料中并未明确列出 5'-O-DMT-Bz-rA 的毒性特征。作为一种化学中间体,处理时应遵循标准的实验室安全操作规程。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。其安全性评估应以最终的环状二核苷酸产物为依据,而非以中间体本身为依据。
参考文献

[1]. Cyclic di-nucleotide compounds and methods of use. Patent WO2017161349.

其他信息
5'-O-DMT-Bz-rA 是一种用于合成环状二核苷酸的核苷中间体。其分子式为 C38H35N5O7,分子量为 673.71,腺嘌呤的 N6 位带有苯甲酰基保护基,5' 位带有 DMT 保护基。该化合物仅供实验室使用,尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C38H35N5O7
分子量
673.71
精确质量
673.254
CAS号
81246-82-4
PubChem CID
14282135
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.36
LogP
4.796
tPSA
150.08
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
50
分子复杂度/Complexity
1050
定义原子立体中心数目
4
SMILES
COC1=CC=C(C=C1)C(C2=CC=CC=C2)(C3=CC=C(C=C3)OC)OC[C@@H]4[C@H]([C@H]([C@@H](O4)N5C=NC6=C(N=CN=C65)NC(=O)C7=CC=CC=C7)O)O
InChi Key
QPHBEJADZCSKCY-GONXPTGJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C38H35N5O7/c1-47-28-17-13-26(14-18-28)38(25-11-7-4-8-12-25,27-15-19-29(48-2)20-16-27)49-21-30-32(44)33(45)37(50-30)43-23-41-31-34(39-22-40-35(31)43)42-36(46)24-9-5-3-6-10-24/h3-20,22-23,30,32-33,37,44-45H,21H2,1-2H3,(H,39,40,42,46)/t30-,32-,33-,37-/m1/s1
化学名
N-[9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (148.43 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 13.16 mg/mL (19.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 131.6 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.71 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4843 mL 7.4216 mL 14.8432 mL
5 mM 0.2969 mL 1.4843 mL 2.9686 mL
10 mM 0.1484 mL 0.7422 mL 1.4843 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们