| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
5'-O-TBDMS-dT does not have a specific biological target as a therapeutic agent but serves as a protected nucleoside building block for DNA synthesis. The TBDMS protecting group at the 5'-position allows for selective deprotection and chain elongation during solid-phase oligonucleotide synthesis. When incorporated into oligonucleotides, the protected nucleoside contributes to the DNA sequence and structure. The compound is used as an intermediate in the synthesis of modified oligonucleotides for various research applications including antisense therapy and nucleic acid structural studies.
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| 体外研究 (In Vitro) |
通过评估 5'-O-TBDMS-dT 作为寡核苷酸合成构建单元的体外活性来评价其活性。通过监测三苯甲基阳离子释放量来评估固相合成过程中该化合物掺入不断增长的寡核苷酸链的效率。采用高效液相色谱 (HPLC) 分析评估该化合物的纯度及其对自动化 DNA 合成的适用性。利用热熔解 (Tm) 分析评估所得寡核苷酸与互补序列的杂交能力，并根据具体应用，在各种检测方法中评估其生物活性。
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| 体内研究 (In Vivo) |
针对 5'-O-TBDMS-dT 的体内研究通常使用以该结构单元合成的寡核苷酸，而非受保护的核苷本身。这些寡核苷酸在动物模型中用于评估其药代动力学特性、生物分布以及在反义疗法或核酸疗法等应用中的治疗效果。TBDMS 保护基团在寡核苷酸合成和脱保护过程中被去除，因此最终的寡核苷酸含有天然胸苷核苷，而没有保护基团。
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| 酶活实验 |
在寡核苷酸合成中，5'-O-TBDMS-dT 被转化为相应的亚磷酰胺，并使用标准的固相合成方案将其掺入寡核苷酸中。该化合物溶解于无水乙腈中，并使用标准偶联化学方法与正在增长的寡核苷酸链偶联。在每个合成循环中，通过三苯甲基阳离子释放量来监测偶联效率。合成后，寡核苷酸从固相载体上切割下来，并使用氢氧化铵或其他合适的试剂进行脱保护。最终的寡核苷酸通过高效液相色谱（HPLC）或聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）纯化，并通过质谱进行表征。
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| 细胞实验 |
在细胞研究中，培养的细胞用以5'-O-TBDMS-dT为构建单元合成的寡核苷酸处理。细胞与寡核苷酸孵育24-72小时后，使用荧光显微镜或流式细胞术，通过荧光标记的寡核苷酸评估细胞摄取情况。对于反义应用，基因敲低效率通过qRT-PCR或Western blot进行评估。对于适配体应用，与靶蛋白的结合通过表面等离子共振或ELISA进行评估。使用MTT或CellTiter-Glo检测评估细胞毒性，以确保寡核苷酸对细胞无毒性。
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| 动物实验 |
为了对使用 5'-O-TBDMS-dT 合成的寡核苷酸进行体内评估，将寡核苷酸通过静脉注射、皮下注射或腹腔注射给药于小鼠或大鼠。利用基于杂交的检测方法或液相色谱-质谱联用（LC-MS）测定血浆和组织中寡核苷酸的浓度，从而确定包括半衰期、清除率和组织分布在内的药代动力学参数。对于治疗应用，在合适的疾病模型（例如，用于反义疗法的肿瘤异种移植模型）中评估疗效，并随时间监测肿瘤体积或疾病生物标志物。通过监测体重、器官组织病理学和血清化学指标来评估毒性。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
本研究对含有5'-O-TBDMS-dT核苷的寡核苷酸（而非受保护的单体本身）的药代动力学性质进行了表征。该化合物在DMSO中的溶解度为100 mg/mL (280.51 mM)。在寡核苷酸脱保护过程中，TBDMS保护基团被去除，因此最终的寡核苷酸含有天然的胸苷核苷。该化合物通常储存在-20°C以保持稳定性。详细的药代动力学参数取决于具体的寡核苷酸序列、长度和骨架化学性质。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
5'-O-TBDMS-dT 是一种仅供实验室使用的研究化合物，未获准用于人体治疗。作为一种受保护的核苷，它可用作寡核苷酸合成的中间体，用于包括药物开发、分子诊断和核酸结构研究在内的多种研究应用。该化合物应按照标准的实验室安全预防措施进行操作。毒性研究通常针对完整的寡核苷酸进行，而非受保护的核苷单体。该化合物在按推荐方法储存时稳定。
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| 其他信息 |
5'-O-TBDMS-dT 是一种胸苷衍生物，其伯羟基 5'-被叔丁基二甲基硅基 (TBDMS) 醚保护，分子式为 C16H28N2O5Si，分子量为 356.49。它可用作寡核苷酸合成中的保护性核苷构建单元，用于药物开发、分子诊断和核酸结构研究。该化合物在 DMSO 中的溶解度为 100 mg/mL。仅供研究使用，尚未获准用于临床应用。建议储存于 -20°C。
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| 分子式 |
C16H28N2O5SI
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|---|---|
| 分子量 |
356.49
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| 精确质量 |
356.177
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| CAS号 |
40733-28-6
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| PubChem CID |
10251259
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.25g/cm3
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| 沸点 |
497.4ºC at 760mmHg
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| 熔点 |
198ºC
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| 闪点 |
254.6ºC
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| LogP |
1.515
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| tPSA |
93.55
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
24
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| 分子复杂度/Complexity |
555
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)CO[Si](C)(C)C(C)(C)C)O
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| InChi Key |
IJWIJLIIOKZJMS-YNEHKIRRSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C16H28N2O5Si/c1-10-8-18(15(21)17-14(10)20)13-7-11(19)12(23-13)9-22-24(5,6)16(2,3)4/h8,11-13,19H,7,9H2,1-6H3,(H,17,20,21)/t11-,12+,13+/m0/s1
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| 化学名 |
1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : 100 mg/mL (280.51 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.01 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.01 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.01 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8051 mL | 14.0256 mL | 28.0513 mL | |
| 5 mM | 0.5610 mL | 2.8051 mL | 5.6103 mL | |
| 10 mM | 0.2805 mL | 1.4026 mL | 2.8051 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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