5-TAMRA SE

别名: 5TAMRA SE; 5 TAMRA SE; 5-TAMRA SE 5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯;5(6)-羧基四甲基羅丹明琥珀醯亞胺酯(混合物);5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯5-TAMRA SE;5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺脂;5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯(单一化合物);5-TAMRA, SE [5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯]
目录号: V20437 纯度: ≥98%
5-TAMRA-SE 是一种胺反应性荧光剂,其缀合物可产生明亮、pH 不敏感的橙红色荧光,具有良好的光稳定性。
5-TAMRA SE CAS号: 150810-68-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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100mg
250mg
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产品描述
5-TAMRA-SE 是一种胺反应性荧光剂,其偶联物可产生明亮、pH 值不敏感的橙红色荧光,且具有良好的光稳定性。
5-TAMRA SE(CAS 150810-68-7),又称 5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯或 5-TAMRA-NHS 酯,是一种纯化的单异构体四甲基罗丹明 (TAMRA) 衍生物,其表面修饰有 N-羟基琥珀酰亚胺 (NHS) 酯基团。它是一种胺反应性荧光剂,用于标记含有伯胺基团的肽、蛋白质和其他生物分子。其偶联物可产生明亮、pH 值不敏感的橙红色荧光,且具有良好的光稳定性。
生物活性&实验参考方法
靶点
5-TAMRA SE does not have a biological target in the traditional sense; it is a fluorescent labeling reagent rather than a drug. Its "target" is primary amine groups (-NH₂) on biomolecules such as peptides, proteins, and nucleic acids. The NHS ester group reacts with primary amines to form stable amide bonds, enabling covalent attachment of the fluorophore to the target molecule. Once conjugated, the TAMRA fluorophore provides a fluorescent label for detection, imaging, and tracking purposes.
体外研究 (In Vitro)
5-TAMRA SE 本身不具有生物活性,既不抑制也不刺激细胞活动。其用途在于其化学反应性和荧光特性。它是一种胺反应性探针,可产生明亮且不受 pH 值影响的橙红色荧光,其激发/发射波长最大值约为 545/580 nm(或 546/579 nm)。量子产率约为 0.1。它具有抗核酸酶性和核渗透性,因此适用于核酸标记和染色。
体内研究 (In Vivo)
5-TAMRA SE 本身不具有体内生物活性,因为它是一种标记试剂。其体内应用取决于与靶向分子(例如抗体、肽)的偶联,这些靶向分子能够将荧光探针引导至特定组织或细胞。偶联物的荧光可通过合适的成像系统进行检测,激发/发射波长约为 545/580 nm。这种 pH 值不敏感的荧光特性确保了在不同的生理环境下都能可靠地检测到信号。
酶活实验
由于 5-TAMRA SE 并非靶向生物受体的药物,因此目前尚无针对该化合物的酶/受体结合试验。然而,可以通过将该化合物与含胺分子(例如牛血清白蛋白、肽)孵育,并利用质谱、SDS-PAGE 或 HPLC 分析偶联效率,在体外评估其与伯胺的反应性。通过测量偶联物的荧光强度来确认标记是否成功,并确定标记程度。
细胞实验
在细胞标记实验中,将细胞与 5-TAMRA SE 偶联的探针(例如抗体、肽或核酸)孵育。该化合物本身也可用于直接标记含有伯胺的表面或细胞内蛋白质。标记后,固定细胞,并使用配备适用于 TAMRA 的滤光片组(激发波长约 545 nm,发射波长约 580 nm)的荧光显微镜进行成像。流式细胞术可用于定量荧光强度。pH 值不敏感的荧光特性确保了检测的可靠性。
动物实验
使用 5-TAMRA SE 进行体内成像研究需要将其与靶向分子(例如抗体、肽)偶联,该靶向分子能够结合特定的生物标志物。将偶联物通过静脉注射给药给动物(例如小鼠)。使用体内成像系统 (IVIS) 进行成像,并设置适合 TAMRA 荧光的激发/发射参数。通过测量目标组织或器官中的荧光信号来评估生物分布和靶点结合情况。
药代性质 (ADME/PK)
5-TAMRA SE 是一种小分子荧光染料,分子量为 527.53 g/mol。它通常以固体形式储存在 -20°C 的惰性气体保护下,并避光、防潮、防热。该化合物可溶于 DMSO、DMF 和其他有机溶剂。与蛋白质偶联后,所得荧光探针稳定,可用于各种生物学检测。由于它并非药物,因此尚无药代动力学数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
5-TAMRA SE 被视为研究试剂而非治疗药物,其毒性主要与操作和处置有关。作为一种荧光染料,通常应按照标准实验室安全预防措施进行操作,以避免吸入、摄入和皮肤接触。它可能对眼睛和皮肤有刺激性。该化合物对光、湿气和热敏感,应妥善储存。由于其并非设计用于体内给药,因此目前尚无全身毒性数据。
参考文献

[1]. 5′-Amino Pyrene Provides a Sensitive, Nonperturbing Fluorescent Probe of RNA Secondary and Tertiary Structure Formation. J Am Chem Soc (1993) 115:4985-4985.

[2]. Local Stoichiometries Determined by Counting Individual Molecules. Anal Chem (1996) 68:4397-4397.

其他信息
5-TAMRA SE(5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯)是一种胺反应性荧光标记试剂。它是TAMRA的单一异构体衍生物,带有NHS酯基团。主要用于标记肽和蛋白质。该偶联物产生明亮、pH不敏感的橙红色荧光,激发/发射波长约为545/580 nm。它具有抗核酸酶性和细胞核渗透性,适用于DNA/RNA染色。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H25N3O7
分子量
527.53
精确质量
527.169
CAS号
150810-68-7
PubChem CID
2762600
外观&性状
Pale purple to purple solid powder
LogP
3.188
tPSA
123.43
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
1140
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
VWFRSNKRTNUMET-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H25N3O7/c1-30(2)17-6-9-20-23(14-17)38-24-15-18(31(3)4)7-10-21(24)27(20)19-8-5-16(13-22(19)28(35)36)29(37)39-32-25(33)11-12-26(32)34/h5-10,13-15H,11-12H2,1-4H3
化学名
2-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]-5-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylbenzoate
别名
5TAMRA SE; 5 TAMRA SE; 5-TAMRA SE
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~5 mg/mL (~9.48 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (1.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMF 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8956 mL 9.4781 mL 18.9563 mL
5 mM 0.3791 mL 1.8956 mL 3.7913 mL
10 mM 0.1896 mL 0.9478 mL 1.8956 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们