6-Amino-5-azacytidine

别名: QS4CCV9ZS5 6-氨基-5-氮杂胞苷
目录号: V34039 纯度: ≥98%
6-Amino-5-azacytidine 是 Azacytidine 的胺化衍生物,能够抑制大肠杆菌的生长。
6-Amino-5-azacytidine CAS号: 105331-00-8
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
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产品描述

描述:6-氨基-5-氮杂胞苷是氮杂胞苷的氨基化衍生物,能够抑制大肠杆菌的生长。氮杂胞苷曾被用作抗肿瘤药物。它是一种嘧啶核苷类似物,能够抑制DNA甲基转移酶,从而损害DNA甲基化。它也是胞苷的抗代谢物,主要掺入RNA中。


6-氨基-5-氮杂胞苷 (I) 是5-氮杂胞苷的取代同系物,通过异氰酸酯法制备。其分子构象类似于嘌呤核苷,在C(5′)-C(4′)键周围具有明显的g+旋转异构体偏好,并且以S型核糖环构象为主。

该化合物对大肠杆菌具有抗菌活性,并能抑制某些人类白血病细胞系的生长,但在测试浓度下未显示抗病毒作用。[1]
生物活性&实验参考方法
靶点
Anti-bacteria (E. coli)
体外研究 (In Vitro)
6-氨基-5-氮杂胞苷对CCRF-CEM细胞的ID50为33.9 μM,在100 μM浓度下可抑制WI-L2细胞生长39%[1]。
- 6-氨基-5-氮杂胞苷在100 μg/ml浓度下可抑制大肠杆菌B的生长46%。相比之下,6-氧代衍生物(VI)和6-甲氧基-5-氮杂胞苷(VIII)在相同浓度下完全没有活性。[1]

- 6-氨基-5-氮杂胞苷的抗菌活性可被低浓度的天然嘌呤碱基和/或核苷逆转,而天然嘧啶碱基和胸苷则完全不能逆转其抑制作用。高剂量尿苷和胞苷仅能部分逆转肿瘤细胞的增殖。[1]

- 体外抗肿瘤细胞系活性:6-氨基-5-氮杂胞苷对CCRF-CEM(T淋巴母细胞白血病)细胞的ID50为33-9 μM。在100 μM浓度下,它对WI-L2(人B淋巴母细胞白血病)细胞的抑制率为39%。在≤100 μM浓度下,它不抑制L1210小鼠淋巴细胞白血病细胞或LoVo/L人结肠癌细胞的生长。[1]

- 6-氨基-5-氮杂胞苷在≤1 μM浓度下,对单纯疱疹病毒、腺病毒、鼻病毒、流感病毒和副流感病毒均无体外抗病毒活性。[1]
细胞实验
抗菌活性测试:将大肠杆菌B菌株在含葡萄糖的矿物培养基中于37℃静置培养。接种前加入测试化合物,16小时后测量细菌生长情况。[1]

- 肿瘤细胞生长抑制:使用了四种细胞系——L1210小鼠淋巴细胞白血病细胞、WI-L2人B淋巴母细胞白血病细胞、CCRF-CEM T淋巴母细胞白血病细胞和LoVo/L人结肠癌细胞。在体外测试了化合物抑制细胞生长的能力,但未提供详细的实验方案(例如,细胞接种密度、孵育时间、细胞活力检测方法)。报告了ID50(CCRF-CEM为33-9 μM)和抑制率(WI-L2在100 μM时为39%),而L1210和LoVo/L在≤100 μM浓度下未观察到抑制作用。 [1]
参考文献

[1]. Synthesis, molecular conformation and biological activity of 6-amino-5-azacytidine. Collect. Czech. Chem. Commun. 1989, 54, 2502-2512.

其他信息
通过 1H NMR 测定了 6-氨基-5-氮杂胞苷的分子构象:核糖环的构象 (Keq = 2.12) 更类似于腺苷 (Keq = 1.78) 而非胞苷 (Keq = 0.69),表明其构象与嘌呤核苷相似。C(5′)‑C(4′) 键周围的 g+ 旋转异构体的比例为 80%。C‑N 糖苷键周围的反式构象更占优势。[1]

- 三嗪环 6 位上的氨基可能使 6-氨基-5-氮杂胞苷能够像胞嘧啶一样通过三个氢键与鸟嘌呤结合,或者像腺嘌呤一样通过三个氢键与互补的嘧啶(尿嘧啶或胸腺嘧啶)结合。这使得该化合物在掺入寡核苷酸后能够发挥“通用”碱基的作用。[1]

- 生化研究(本文引用但未详细阐述)表明,6-氨基-5-氮杂胞苷干扰嘌呤代谢而非嘧啶代谢,因此被认为是嘌呤抗代谢物。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C8H13N5O5
分子量
259.219321012497
精确质量
259.091
CAS号
105331-00-8
PubChem CID
13630026
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
-2.8
tPSA
167
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
424
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C([C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)N2C(=NC(=NC2=O)N)N)O)O)O
InChi Key
HHBIDXKTBPRKSK-TXICZTDVSA-N
InChi Code
InChI=1S/C8H13N5O5/c9-6-11-7(10)13(8(17)12-6)5-4(16)3(15)2(1-14)18-5/h2-5,14-16H,1H2,(H4,9,10,11,12,17)/t2-,3-,4-,5-/m1/s1
化学名
4,6-diamino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1,3,5-triazin-2-one
别名
QS4CCV9ZS5
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~14.71 mg/mL (~56.75 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 8.33 mg/mL (32.13 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。 (<60°C).

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.8577 mL 19.2886 mL 38.5773 mL
5 mM 0.7715 mL 3.8577 mL 7.7155 mL
10 mM 0.3858 mL 1.9289 mL 3.8577 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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