| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The primary target of 6-ROX is not a biological receptor or enzyme, but rather the oligonucleotide or biomolecule to which it is conjugated for detection purposes. As a fluorescent labeling reagent, 6-ROX is used to label nucleotides and oligonucleotides for DNA sequencing and FRET imaging applications. The carboxy group on the compound can be activated to form reactive esters that react with amines on nucleotides or other biomolecules. The labeled oligonucleotides can then be used as probes in various fluorescence-based assays, including FRET imaging, where 6-ROX acts as an acceptor molecule coupled to 5-FAM as the donor.
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| 体外研究 (In Vitro) |
在体外，6-ROX 可用作寡核苷酸和核苷酸的荧光标记物。它主要用于标记核苷酸和进行 DNA 测序。该化合物的激发/发射波长为 570/591 nm。在 FRET 成像中，它作为受体分子与 5-FAM（供体）偶联。标记的寡核苷酸可用作各种基于荧光的检测方法的探针，包括 DNA 测序、PCR 和杂交检测。该化合物的荧光特性使其能够灵敏地检测复杂生物样品中的目标核酸。
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| 体内研究 (In Vivo) |
由于6-ROX主要用作体外研究试剂进行标记和检测，因此对其体内研究有限。然而，像6-ROX这样的荧光染料可用于动物模型成像应用，例如在体内追踪寡核苷酸或细胞。在这些研究中，将标记的寡核苷酸注射到动物体内，并通过荧光成像监测其分布和代谢情况。该化合物的荧光特性使其能够灵敏地检测生物样品。目前尚未有关于其广泛的体内药理学或毒理学研究报道。
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| 酶活实验 |
为了进行荧光表征，将 6-ROX 溶解于合适的溶剂（例如 DMSO、甲醇或水性缓冲液）中，并分别使用紫外-可见分光光度计和荧光光谱仪测量其吸收光谱和发射光谱。确定激发波长和发射波长最大值（Ex=570 nm，Em=591 nm）。对于标记反应，使用 EDC 和 NHS 将 6-ROX 的羧基活化为 NHS 酯。然后将活化的酯与含有伯胺基的目标寡核苷酸或核苷酸在 pH 7.0-8.5 的缓冲液中于室温下反应 1-2 小时。标记产物通过 HPLC 或其他方法纯化。通过测量标记产物的吸光度或荧光强度来评估标记效率。
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| 细胞实验 |
在细胞研究中，使用 6-ROX 标记的寡核苷酸或探针来染色细胞或检测细胞中特定的核酸序列。细胞经培养和固定后，与标记探针孵育。洗涤后，使用合适的滤光片组，在 570 nm 激发和 591 nm 发射波长下，通过荧光显微镜或流式细胞仪分析细胞。在 FRET 成像中，将 6-ROX 标记的探针与 5-FAM 标记的探针联用，以研究分子相互作用。
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| 动物实验 |
在体内成像研究中，将6-ROX标记的寡核苷酸通过静脉或腹腔注射给药给动物。使用配备相应激发和发射滤光片的体内成像系统监测标记分子的分布和代谢情况。可在不同时间点收集组织和器官，用于离体荧光成像或匀浆处理以进行荧光分析。然而，此类研究并非该化合物的典型应用。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
由于6-ROX仅用作研究试剂而非治疗药物，因此目前尚无其药代动力学数据。若用于体内，预计该化合物会分布于多种组织。然而，目前尚未有专门针对该化合物的ADME研究报道。该化合物主要用于体外研究，不适用于体内药代动力学表征。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于 6-ROX 仅用作研究试剂，因此其毒理学数据有限。通常认为，在用于标记和染色应用的浓度下，该化合物毒性较低。目前尚未有关于其急性毒性、致突变性或致癌性的报道。与所有化学试剂一样，处理 6-ROX 时应采取适当的安全预防措施，包括使用个人防护装备并在通风良好的区域操作。
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| 其他信息 |
6-ROX（CAS 194785-18-7），又称6-羧基-X-罗丹明，是一种荧光寡核苷酸标记物，用作FRET成像中的受体。其分子式为C₃₃H₃₀N₂O₅，分子量为534.60。该化合物用于标记核苷酸和DNA测序。其激发/发射波长为570/591 nm。在FRET成像中，6-ROX作为受体与5-FAM（供体）偶联。该化合物属于罗丹明类荧光染料。本品仅供科研使用。
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| 分子式 |
C33H30N2O5
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|---|---|
| 分子量 |
534.601699999999
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| 精确质量 |
534.215
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| CAS号 |
194785-18-7
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| 相关CAS号 |
6-ROX hydrochloride;1689512-96-6
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| PubChem CID |
2762612
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| 外观&性状 |
Brown to black solid powder
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| LogP |
5.123
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| tPSA |
97.05
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
2
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| 重原子数目 |
40
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| 分子复杂度/Complexity |
1200
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
WQZIDRAQTRIQDX-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C33H30N2O5/c36-32(37)20-9-10-21(33(38)39)24(17-20)27-25-15-18-5-1-11-34-13-3-7-22(28(18)34)30(25)40-31-23-8-4-14-35-12-2-6-19(29(23)35)16-26(27)31/h9-10,15-17H,1-8,11-14H2,(H-,36,37,38,39)
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| 化学名 |
4-carboxy-3-(3-oxa-23-aza-9-azoniaheptacyclo[17.7.1.15,9.02,17.04,15.023,27.013,28]octacosa-1(27),2(17),4,9(28),13,15,18-heptaen-16-yl)benzoate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~25 mg/mL (~46.76 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (1.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (1.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8706 mL | 9.3528 mL | 18.7056 mL | |
| 5 mM | 0.3741 mL | 1.8706 mL | 3.7411 mL | |
| 10 mM | 0.1871 mL | 0.9353 mL | 1.8706 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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