Bofutrelvir (FB2001)

别名: Bofutrelvir; 2103278-86-8; Mpro inhibitor 11A; T5UX5SKK2S; MPI-10; 博福特韦 (FB-2001); MPro Inhibitor 11a
目录号: V52330 纯度: ≥98%
Bofutrelvir (FB2001) 是 SARS-CoV-2 主要蛋白酶 Mpro 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂),IC50 为 53 nM,EC50 为 0.53 μM。
Bofutrelvir (FB2001) CAS号: 2103278-86-8
产品类别: SARS-CoV
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1mg
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产品描述
Bofutrelvir (FB2001) 是 SARS-CoV-2 主要蛋白酶 Mpro 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂),IC50 为 53 nM,EC50 为 0.53 μM。 Bofutrelvir 对多种 SARS-CoV-2 变体具有抗病毒作用,EC50 为 0.26-0.42 μM。 Bofutrelvir 与 Remdesivir 联合使用具有附加的抗病毒作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Mpro (IC50 = 53 nM)[1]
FB2001 (also known as compound 11a) is a drug candidate that targets the main protease (Mpro, also called 3CL protease) of SARS-CoV-2. It inhibits Mpro by covalently binding to cysteine 145 (Cys145). The IC50 value of FB2001 against SARS-CoV-2 Mpro is 0.053 ± 0.005 μM. [2]
体外研究 (In Vitro)
Bofutrelvir(24 小时)展示了针对 SARS-CoV-2 及其变异体的体外作用,对 SARS-CoV-2、SARS-CoV-2(Alpha)、SARS-CoV-2(Beta)、SARS-CoV 的 EC50 值-2 (Delta) 和 SARS-CoV-2 (Omicron) 分别为 0.42、0.39、0.28、0.27 和 0.26 μM[2]。在 vero E6 细胞中,当存在人血时 (1.1–2.4 μM),bofutrelvir 甚至可以在 EC50 值下抑制 SARS-CoV-2 复制[2]。在体外,bofutrelvir 和 remdesivi 联合治疗显示出针对 SARS-CoV-2 的附加作用[2]。
FB2001在Vero E6细胞中对多种SARS-CoV-2变异株表现出强效的抗病毒活性(通过病毒拷贝数减少测定)。其EC50值分别为:B.1.1.7 (Alpha) 0.39 ± 0.01 μM,B.1.351 (Beta) 0.28 ± 0.11 μM,B.1.617.2 (Delta) 0.27 ± 0.05 μM,B.1.1.529 (Omicron) 0.26 ± 0.06 μM。相应的EC90值分别为:Alpha 0.75 ± 0.01 μM,Beta 0.57 ± 0.21 μM,Delta 0.81 ± 0.20 μM。选择性指数(SI50)分别为704、980、1016和933。[2]
在P-糖蛋白抑制剂CP-100356存在下,FB2001对Omicron变异株的抑制活性显著增强,EC50为0.042 ± 0.007 μM,CC50为142.4 μM,表明FB2001可能是P-糖蛋白的底物。[2]
时间添加实验显示,FB2001(2 μM、10 μM和1 μM + P-糖蛋白抑制剂)在所有测试条件下均表现出强效抗病毒活性,特别是在进入后阶段和全程给药阶段,与其作为主蛋白酶抑制剂的作用机制一致。它对病毒进入过程也表现出抑制作用。[2]
可逆性研究表明,FB2001是一种可逆的Mpro抑制剂。将SARS-CoV-2 Mpro与2 μM FB2001孵育60分钟,随后进行50倍和200倍稀释后,Mpro活性恢复,与可逆抑制剂PF-07321332相似,但与不可逆抑制剂N3不同。FB2001与Mpro的解离比PF-07321332更困难。[2]
对野生型和变异株(Alpha、Beta、Delta、Omicron)Mpro的序列比对发现了两个突变:Beta株的K90R和Omicron株的P132H。X射线晶体结构分析表明,这些突变位于FB2001配体结合位点的远处,表明它们不会影响其抑制活性。[2]
在高浓度人血清存在下,FB2001仍能保持强效的抗SARS-CoV-2活性。EC50值从1.10 μM(10%血清)增加到2.40 μM(50%血清),表明人血清对其体外抑制活性无显著影响。[2]
与瑞德西韦的联合用药研究显示,两者对SARS-CoV-2具有相加作用。通过零相互作用 potency 模型计算的协同作用得分为6.947,表明为相加作用(得分在-10到10之间)。[2]
体内研究 (In Vivo)
bofutrelvir(100 和 200 mg/kg;第 0 天每天一次,第 1、2 和 3 天每天两次,连续 4 天腹膜内注射)可有效对抗 SARS-CoV-2 δ 变异体感染[2]。
在感染SARS-CoV-2 Delta变异株的K18-hACE2小鼠模型中,腹腔注射FB2001 100 mg/kg和200 mg/kg(每日两次,持续4天)以剂量依赖性方式显著降低了病毒载量和滴度。[2]
感染后第2天,与溶媒对照组相比,200 mg/kg组肺部病毒滴度降低了3.57 log10 PFU/g。第4天,200 mg/kg组肺部和脑部的病毒滴度均低于检测下限。[2]
肺部病毒RNA载量方面,100 mg/kg和200 mg/kg组在第2天分别降低了1.02和1.60 log10拷贝/克,第4天分别降低了0.67和1.14 log10拷贝/克。脑部病毒RNA载量在第4天分别显著降低了2.37和5.26 log10拷贝/克(100 mg/kg和200 mg/kg组)。[2]
组织病理学分析显示,FB2001治疗显著改善了肺部和脑部病理变化。在肺部,它减少了间质炎性细胞浸润、肺泡间隔增厚和血管周围浸润。在脑部,它减少了神经元变性、细胞浸润,并保护脑组织免受病毒诱导的损伤。针对病毒核蛋白的免疫组织化学染色证实,肺和脑组织中的病毒抗原呈剂量依赖性减少。[2]
酶活实验
Mpro酶活性测定: 将SARS-CoV-2 Mpro与2 μM的FB2001、可逆抑制剂PF-07321332或不可逆抑制剂N3孵育60分钟。然后将孵育混合物稀释50倍和200倍,并监测Mpro活性。与N3孵育后,抑制活性未恢复,而与FB2001和PF-07321332孵育后,Mpro活性恢复,表明FB2001是一种可逆的Mpro抑制剂。[2]
X射线晶体学: SARS-CoV-2 Mpro与FB2001复合物的晶体结构分析显示,FB2001的醛基与Mpro的Cys145形成共价键。该结构还显示,变异株中发现的K90R和P132H突变位于配体结合位点的远处。[2]
细胞实验
Vero E6细胞抗病毒活性测定: Vero E6细胞接种于48孔板中。次日,将细胞与系列稀释的FB2001预孵育1小时,然后以0.01或0.005的感染复数感染SARS-CoV-2变异株1小时。感染后,洗涤细胞并加入含或不含P-糖蛋白抑制剂CP-100356的新鲜化合物。感染后24小时收集上清液,提取病毒RNA,通过实时荧光定量PCR测定拷贝数。从抑制曲线计算EC50值。[2]
细胞毒性测定: Vero E6细胞接种于96孔板中,与系列稀释的FB2001孵育24小时。使用CCK8试剂盒测定细胞活力,并计算CC50值。[2]
人血清蛋白结合效应测定: Vero E6细胞以感染复数0.01感染SARS-CoV-2 1小时,然后洗涤并与含10%、20%、30%、40%或50%人血清的不同浓度FB2001孵育。24小时后收集上清液,提取病毒RNA,通过RT-qPCR测定拷贝数。计算每种血清浓度下的EC50值。[2]
联合用药研究的免疫荧光测定: Vero E6细胞接种于96孔板中。细胞与FB2001和瑞德西韦的组合预孵育1小时,然后以感染复数0.01感染SARS-CoV-2。感染后24小时,固定细胞,透化,并用抗SARS-CoV-2核蛋白一抗和荧光二抗染色。测量荧光强度,计算抑制率。使用ZIP模型计算协同作用得分。[2]
动物实验
动物/疾病模型:感染SARS-CoV-2 delta变异株的K18-hACE2小鼠[2]
剂量:100和200 mg/kg
给药途径:腹腔注射;第0天每日一次,每次100和200 mg/kg;第1、2和3天每日两次,持续4天
实验结果:显示出对肺部病毒滴度的剂量依赖性疗效。有效降低肺部病毒载量。对SARS-CoV-2 delta变异株表现出剂量依赖性的抗病毒活性,并显著降低小鼠肺部和脑部的病毒载量。
动物:使用7-8周龄的K18-hACE2转基因小鼠。 [2]
病毒攻击:小鼠于第0天经鼻内滴注感染1 × 10³ PFU的SARS-CoV-2 Delta变异株。[2]
药物制备:注射用FB2001的制备方法为:将FB2001溶于0.9%无菌生理盐水中,摇匀至完全溶解,并用0.22 μm滤膜过滤。浓度分别为11.5 mg/mL(100 mg/kg剂量)和23 mg/mL(200 mg/kg剂量)。溶剂对照组为0.9%无菌生理盐水。[2]
给药方案:小鼠分为三组(每组n=7):溶剂对照组、FB2001 100 mg/kg组和FB2001 200 mg/kg组。给药方式为腹腔注射,每只小鼠注射0.2 mL,注射量根据平均体重(23 g)计算。第0天(感染后2小时)给药一次,第1、2、3天每天给药两次(间隔9小时)。[2]
样本采集:每组4只小鼠于第2天处死,每组3只小鼠于第4天处死。采集肺和脑组织。右肺组织在DMEM培养基中匀浆,用于病毒RNA提取和滴度测定。左肺组织用4%多聚甲醛固定,用于组织病理学检查和免疫组织化学染色。[2]
病毒载量测定:提取肺和脑组织中的病毒RNA,进行逆转录,并通过实时定量PCR定量病毒RNA的绝对拷贝数。病毒滴度通过噬斑试验(PFU/g)测定。 [2]
组织病理学和免疫组织化学:将固定的肺和脑组织包埋于石蜡中,切片,并用苏木精-伊红染色进行组织病理学分析。采用针对SARS-CoV-2核衣壳蛋白的抗体进行免疫组织化学染色,以检测病毒抗原。[2]
参考文献

[1]. The SARS-CoV-2 main protease as drug target. Bioorg Med Chem Lett. 2020 Sep 1;30(17):127377.

[2]. In vitro and in vivo evaluation of the main protease inhibitor FB2001 against SARS-CoV-2. Antiviral Res. 2022 Dec;208:105450.

其他信息
N-[(2S)-3-环己基-1-氧代-1-({(2S)-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基)丙-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺是一种仲甲酰胺,由1H-吲哚-2-羧酸的羧基与3-环己基-N-{(2S)-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-L-丙氨酰胺的伯氨基缩合而成。它是SARS冠状病毒主蛋白酶的抑制剂,并能抑制细胞培养中SARS-CoV-2的复制(EC50 = 0.53 μM)。它是一种EC 3.4.22.69(SARS冠状病毒主蛋白酶)抑制剂和抗冠状病毒药物。它是一种吲哚甲酰胺类化合物,属于吡咯烷-2-酮类化合物,同时也是一种醛类化合物、仲甲酰胺类化合物和寡肽类化合物。
博夫特雷韦是一种小分子抑制剂,可抑制严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 的主蛋白酶(Mpro;3C样蛋白酶;3CL蛋白酶;3CLpro;nsp5蛋白酶),具有潜在的抗SARS-CoV-2病毒活性。静脉注射或吸入肺部后,博夫特雷韦可选择性地靶向、结合并抑制SARS-CoV-2 Mpro的活性。该药物抑制病毒多聚蛋白的蛋白水解切割,从而抑制包括解旋酶、单链RNA结合蛋白、RNA依赖性RNA聚合酶、20-O-核糖甲基转移酶、核糖核酸内切酶和核糖核酸外切酶在内的多种病毒蛋白的形成。这可阻止病毒的转录和复制。博福瑞韦可能具有脑部抗病毒活性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H32N4O4
分子量
452.55
精确质量
452.242
元素分析
C, 66.35; H, 7.13; N, 12.38; O, 14.14
CAS号
2103278-86-8
PubChem CID
145343771
外观&性状
White to light yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
836.8±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
459.9±31.5 °C
蒸汽压
0.0±3.1 mmHg at 25°C
折射率
1.592
LogP
2.7
tPSA
120
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
723
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C1CCC(CC1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C[C@@H]2CCNC2=O)C=O)NC(=O)C3=CC4=CC=CC=C4N3
InChi Key
HPKJGHVHQWJOOT-ZJOUEHCJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H32N4O4/c30-15-19(13-18-10-11-26-23(18)31)27-24(32)21(12-16-6-2-1-3-7-16)29-25(33)22-14-17-8-4-5-9-20(17)28-22/h4-5,8-9,14-16,18-19,21,28H,1-3,6-7,10-13H2,(H,26,31)(H,27,32)(H,29,33)/t18-,19-,21-/m0/s1
化学名
N-[(2S)-3-cyclohexyl-1-oxo-1-[[(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide
别名
Bofutrelvir; 2103278-86-8; Mpro inhibitor 11A; T5UX5SKK2S; MPI-10;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (220.97 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.52 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2097 mL 11.0485 mL 22.0970 mL
5 mM 0.4419 mL 2.2097 mL 4.4194 mL
10 mM 0.2210 mL 1.1049 mL 2.2097 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Evaluate the Efficacy and Safety of FB2001 for Inhalation in Patients With Mild to Moderate COVID-19
CTID: NCT05675072
Phase: Phase 2/Phase 3
Status: Unknown status
Date: 2023-01-09
Evaluate the Efficacy and Safety of FB2001 in Hospitalized Patients With Moderate to Severe COVID-19 (BRIGHT Study)
CTID: NCT05445934
Phase: Phase 2/Phase 3
Status: Unknown status
Date: 2023-01-05
The Safety and Efficacy of FB2001 in Healthy Subjects and Patients With COVID-19 Infection
CTID: NCT04766931
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2022-11-28
A Bridging Study of FB2001 in Healthy Subjects
CTID: NCT05197179
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2022-07-06
Exploratory Study of Aerosol Inhalation of FB2001 for Post-exposure Prophylaxis of COVID-19 Close Contacts
CTID: NCT05415241
Phase: Phase 1/Phase 2
Status: Unknown status
Date: 2022-06-13
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