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DMT-2'fluoro-da(bz) amidite

别名: DMT-2'fluoro-da(bz) amidite 2'-F-N6-Bz-dA 亚磷酰胺单体;N-苯甲酰基-5'-O-[二(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-脱氧-2'-氟腺苷 3'-[2-氰基乙基 N,N-二异丙基氨基亚磷酸酯]
目录号: V52940 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Dmt-2'氟-da(bz) amidite 是一种均质修饰的 2'-脱氧-2'-氟硫代磷酸酯寡核苷酸，是一种针对 RNA 的有效的抗核酸酶反义化合物。
DMT-2'fluoro-da(bz) amidite CAS号: 136834-22-5
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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250mg
500mg
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产品描述
DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺是一种均一修饰的2'-脱氧-2'-氟硫代磷酸酯寡核苷酸，是一种强效的抗核酸酶反义化合物，靶向RNA。DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺也是合成5'-DMT-3'-亚磷酰胺的必要步骤。
DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺（CAS号：136834-22-5）是一种均一修饰的2'-脱氧-2'-氟硫代磷酸酯寡核苷酸结构单元。其分子式为C47H51FN7O7P，分子量为875.92，是一种强效的抗核酸酶反义化合物，靶向RNA。它也是合成5'-DMT-3'-亚磷酰胺的中间体。 2'-氟修饰赋予了RNA靶标高亲和力和特异性。
生物活性&实验参考方法
靶点
DMT-2'fluoro-da(bz) amidite targets RNA. As a 2'-deoxy-2'-fluorophosphorothioate oligonucleotide, it is designed to bind to complementary RNA sequences with high affinity and specificity. The 2'-fluoro modification enhances nuclease resistance, making it a potent antisense compound. The phosphorothioate backbone further increases stability against enzymatic degradation. Its mechanism involves binding to target RNA and inhibiting its function, such as translation or splicing.
体外研究 (In Vitro)
DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺的体外活性通过其作为反义寡核苷酸构建单元的实用性进行评估。所得2'-氟修饰的寡核苷酸与互补RNA靶标的结合亲和力通过热熔解(Tm)分析进行评估。核酸酶抗性通过与多种核酸酶孵育进行评估。该化合物高效掺入寡核苷酸的能力也是衡量其实用性的关键指标。
体内研究 (In Vivo)
DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺的体内研究是使用该结构单元而非亚酰胺本身合成的反义寡核苷酸进行的。这些寡核苷酸在动物模型中评估其药代动力学特性、生物分布以及在基因沉默或反义治疗等应用中的治疗效果。2'-氟修饰增强了代谢稳定性，可能提高其体内性能。
酶活实验
在寡核苷酸合成中，DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺是标准固相合成方案中的一种化合物。该化合物溶解于无水乙腈中，并与正在延伸的寡核苷酸链偶联。偶联效率通过三苯甲基阳离子释放量来监测。合成后，将寡核苷酸从固相载体上切割下来并脱保护。最终的修饰寡核苷酸通过高效液相色谱（HPLC）或聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）纯化，并用质谱法进行表征。
细胞实验
在细胞研究中，培养的细胞用DMT-2'-氟-da(bz)亚酰胺合成的反义寡核苷酸处理。细胞与寡核苷酸孵育24-72小时后，使用荧光显微镜或流式细胞术，通过荧光标记的寡核苷酸评估细胞摄取情况。基因敲低效率通过qRT-PCR或Western blot检测反义活性。细胞毒性则使用MTT或CellTiter-Glo法进行评估。
动物实验
为了在体内评估反义寡核苷酸，可通过多种途径将寡核苷酸给药于小鼠或大鼠。利用基于杂交的检测方法或液相色谱-质谱联用（LC-MS）测定血浆和组织中的寡核苷酸浓度，从而确定包括半衰期、清除率和组织分布在内的药代动力学参数。对于治疗应用，则在合适的疾病模型中评估疗效，并监测疾病生物标志物或生存期随时间的变化。
药代性质 (ADME/PK)
本文对含有DMT-2'氟-da(bz)酰胺的结构单元的反义寡核苷酸的药代动力学性质进行了表征。该化合物的分子量为875.92，HPLC纯度为98%。通常以固体形式处理，并在惰性气体保护下于0-10°C储存以保持其稳定性。详细的药代动力学参数取决于具体的寡核苷酸序列和骨架化学性质。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
所提供的资料中并未明确列出DMT-2'氟-da(bz)亚磷酰胺的毒性特征。作为一种化学试剂，操作时应遵循标准的实验室安全操作规程。该化合物仅供研究使用，不得用于人体治疗。其安全性评估应以最终寡核苷酸产物为依据，而非亚磷酰胺本身。
参考文献

[1]. Uniformly modified 2'-deoxy-2'-fluoro phosphorothioate oligonucleotides as nuclease-resistant antisense compounds with high affinity and specificity for RNA targets. J Med Chem. 1993 Apr 2;36(7):831-41.
其他信息
DMT-2'-氟-da(bz)酰胺是一种2'-脱氧-2'-氟硫代磷酸酯寡核苷酸构建单元，分子式为C47H51FN7O7P。它是一种强效的抗核酸酶反义化合物，能够以高亲和力和特异性靶向RNA。该研究化合物仅供实验室使用，尚未获准用于临床应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C47H51FN7O7P
分子量
875.92
精确质量
875.357
CAS号
136834-22-5
PubChem CID
12042896
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
10.49
tPSA
155
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
13
可旋转键数目(RBC)
19
重原子数目
63
分子复杂度/Complexity
1420
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@@H]1[C@H](O[C@H]([C@@H]1F)N2C=NC3=C(N=CN=C32)NC(=O)C4=CC=CC=C4)COC(C5=CC=CC=C5)(C6=CC=C(C=C6)OC)C7=CC=C(C=C7)OC
InChi Key
VCCMVPDSLHFCBB-MSIRFHFKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C47H51FN7O7P/c1-31(2)55(32(3)4)63(60-27-13-26-49)62-42-39(61-46(40(42)48)54-30-52-41-43(50-29-51-44(41)54)53-45(56)33-14-9-7-10-15-33)28-59-47(34-16-11-8-12-17-34,35-18-22-37(57-5)23-19-35)36-20-24-38(58-6)25-21-36/h7-12,14-25,29-32,39-40,42,46H,13,27-28H2,1-6H3,(H,50,51,53,56)/t39-,40-,42-,46-,63?/m1/s1
化学名
N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-3-fluorooxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
别名
DMT-2'fluoro-da(bz) amidite
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~114.2 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.85 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中，混合均匀。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1417 mL 5.7083 mL 11.4166 mL
5 mM 0.2283 mL 1.1417 mL 2.2833 mL
10 mM 0.1142 mL 0.5708 mL 1.1417 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
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计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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电话: 020-31522723 传真: 463611831 邮箱: sales@invivochem.cn
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