| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
DMT-dA(PAc) Phosphoramidite does not have a specific biological target itself but serves as a building block for oligonucleotide synthesis. When incorporated into oligonucleotides, the resulting sequences can target various biological molecules including mRNA (for antisense applications), DNA (for PCR and sequencing), or proteins (for aptamer applications). The DMT group provides 5'-hydroxyl protection for controlled chain elongation, while the PAc group protects the exocyclic amine of adenine during synthesis. The compound has been used in the synthesis of cyclic dinucleotide prodrugs as STING agonists.
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
通过评估DMT-dA(PAc)亚磷酰胺作为寡核苷酸合成构建单元的实用性，来评价其体外活性。通过监测三苯甲基阳离子释放量来评估固相合成过程中该化合物掺入不断增长的寡核苷酸链的效率。采用高效液相色谱(HPLC)分析来评估该化合物的纯度及其在自动化DNA合成中的适用性。利用热熔解(Tm)分析评估所得寡核苷酸与互补序列的杂交能力，并根据具体应用，在各种检测方法中评估其生物活性。
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| 体内研究 (In Vivo) |
DMT-dA(PAc)亚磷酰胺的体内研究通常使用以该结构单元合成的寡核苷酸进行，而非直接使用亚磷酰胺本身。这些寡核苷酸在动物模型中用于评估其药代动力学特性、生物分布以及在反义疗法、siRNA或STING激动剂开发等应用中的治疗效果。在寡核苷酸的合成和脱保护过程中，保护基团（DMT和PAc）会被去除，因此最终的寡核苷酸含有天然的脱氧腺苷核苷。
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| 酶活实验 |
寡核苷酸合成中，DMT-dA(PAc)亚磷酰胺溶于无水乙腈，并采用标准固相合成方案将其偶联到正在延伸的寡核苷酸链上。在每个合成循环中，通过三苯甲基阳离子释放量来监测偶联效率。合成后，将寡核苷酸从固相载体上切割下来，并使用氢氧化铵或其他合适的试剂进行脱保护。PAc基团在温和条件下去除，从而实现高效脱保护。最终的寡核苷酸通过高效液相色谱(HPLC)或聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)纯化，并通过质谱分析进行表征。
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| 细胞实验 |
在细胞研究中，培养的细胞用以DMT-dA(PAc)亚磷酰胺为结构单元合成的寡核苷酸处理。细胞与寡核苷酸孵育24-72小时后，使用荧光标记的寡核苷酸，通过荧光显微镜或流式细胞术评估细胞摄取情况。对于反义寡核苷酸应用，基因敲低效率通过qRT-PCR或Western blot进行评估。对于STING激动剂应用，STING激活通过测量干扰素-β的产生或STING通路激活标志物进行评估。细胞毒性则使用MTT或CellTiter-Glo检测进行评估。
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| 动物实验 |
为了对使用DMT-dA(PAc)亚磷酰胺合成的寡核苷酸进行体内评估，通过各种途径将寡核苷酸给药小鼠或大鼠。利用基于杂交的检测方法或液相色谱-质谱联用（LC-MS）测定血浆和组织中的寡核苷酸浓度，从而确定包括半衰期、清除率和组织分布在内的药代动力学参数。对于治疗应用，则在合适的疾病模型中评估其疗效。对于STING激动剂，通过肿瘤生长抑制和免疫激活标志物来评估其在癌症模型中的疗效。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
DMT-dA(PAc)亚磷酰胺的药代动力学性质是针对含有该结构单元的寡核苷酸而非亚磷酰胺本身进行表征的。该化合物的分子量为887.96，通常以固体形式处理。PAc保护基团允许在较为温和的条件下进行脱保护，这对于敏感的寡核苷酸序列尤为有利。详细的药代动力学参数取决于具体的寡核苷酸序列、长度和骨架化学性质。建议在惰性气体保护下于-20°C保存。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
DMT-dA(PAc)亚磷酰胺是一种仅供实验室使用的研究化合物，未获准用于人体治疗。作为一种亚磷酰胺结构单元，它可用于DNA和RNA寡核苷酸的合成，并应用于多种研究领域。该化合物含有DMT和PAc保护基团。操作此化合物时应遵循标准的实验室安全操作规程。建议在惰性气体保护下于-20°C保存。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
DMT-dA(PAc)亚磷酰胺是一种核苷亚磷酰胺结构单元，分子式为C48H54N7O8P，分子量为887.96。它用于固相DNA和RNA合成，其特点是5'-羟基被DMT保护，腺嘌呤环外胺被PAc保护。该化合物已被用于合成环状二核苷酸前药，作为STING激动剂。它仅供研究使用，尚未获准用于临床应用。建议在惰性气体保护下于-20°C保存。
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| 分子式 |
C48H54N7O8P
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|---|---|
| 分子量 |
887.96
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| 精确质量 |
887.377
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| CAS号 |
110543-74-3
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| PubChem CID |
13888020
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
8.891
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| tPSA |
177.93
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
13
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| 可旋转键数目(RBC) |
21
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| 重原子数目 |
64
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| 分子复杂度/Complexity |
1420
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1COC(C2=CC=CC=C2)(C3=CC=C(C=C3)OC)C4=CC=C(C=C4)OC)N5C=NC6=C(N=CN=C65)NC(=O)COC7=CC=CC=C7
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| InChi Key |
INUFZOANRLMUCW-SDNJGBRXSA-
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| InChi Code |
InChI=1S/C48H54N7O8P/c1-33(2)55(34(3)4)64(61-27-13-26-49)63-41-28-44(54-32-52-45-46(50-31-51-47(45)54)53-43(56)30-59-40-16-11-8-12-17-40)62-42(41)29-60-48(35-14-9-7-10-15-35,36-18-22-38(57-5)23-19-36)37-20-24-39(58-6)25-21-37/h7-12,14-25,31-34,41-42,44H,13,27-30H2,1-6H3,(H,50,51,53,56)/t41-,42+,44+,64?/m0/s1
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| 化学名 |
N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]purin-6-yl]-2-phenoxyacetamide
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| 别名 |
DMT-dA(PAc) Phosphoramidite
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~112.6 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (2.82 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.82 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.1262 mL | 5.6309 mL | 11.2618 mL | |
| 5 mM | 0.2252 mL | 1.1262 mL | 2.2524 mL | |
| 10 mM | 0.1126 mL | 0.5631 mL | 1.1262 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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