DMT-dI (5'-O-DMT-dI; 2'-Deoxy-5'-O-DMT-inosine)

别名: DMT-2'-脱氧肌苷;2''-脱氧-5''-O-DMT-肌苷;2'-脱氧-5'-O-DMT-肌苷;5’-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2’-脱氧肌苷;5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧肌苷;5'-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-脱氧肌苷;DMT-2''-脱氧肌苷;DMT-2-脱氧肌苷;DMT保护性脱氧肌苷;保护脱氧肌苷
目录号: V52888
DMT-dI (5'-O-DMT-dI) 是一种脱氧尿苷,可用于制备可转换的核苷类似物。
DMT-dI (5'-O-DMT-dI; 2'-Deoxy-5'-O-DMT-inosine) CAS号: 93778-57-5
产品类别: Nucleoside Antimetabolite/Analog
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
DMT-dI (5'-O-DMT-dI) 是一种脱氧尿苷,可用于制备可转化核苷类似物。
DMT-dI (CAS 93778-57-5),也称为 5'-O-DMT-dI 或 2'-脱氧-5'-O-DMT-肌苷,是一种脱氧尿苷衍生物,可用于制备可转化核苷类似物。它是一种 DMT 保护的核苷,可用作寡核苷酸合成的结构单元。该化合物是合成用于研究应用的修饰核酸和核苷类似物的关键中间体。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary targets of DMT-dI are not traditional biological targets but rather the chemical synthesis of oligonucleotides. As a DMT-protected nucleoside, it is used as a building block in solid-phase oligonucleotide synthesis. The compound is incorporated into oligonucleotide sequences during synthesis and can be converted to other nucleoside analogues through subsequent chemical modifications. It does not have direct enzymatic or receptor targets but serves as a synthetic intermediate.
体外研究 (In Vitro)
在体外,DMT-dI 的作用更像是化学结构单元,而非生物活性化合物。它可用于通过标准寡核苷酸合成方案制备可转化的核苷衍生物。DMT(二甲氧基三苯甲基)保护基团允许在固相合成过程中进行选择性脱保护和偶联反应。该化合物本身不具有直接的生物活性,但可用于合成具有潜在治疗应用价值的修饰核酸。
体内研究 (In Vivo)
DMT-dI 的体内活性不适用,因为该化合物是寡核苷酸合成的合成中间体,而非治疗药物。任何体内活性都与由该结构单元合成的最终寡核苷酸或核苷类似物有关。该化合物不适用于直接体内给药,仅用于研究和合成目的。
酶活实验
由于DMT-dI是一种化学结构单元而非生物活性化合物,因此体外酶/受体结合试验不适用于它。该化合物的质量控制检测通常包括高效液相色谱(HPLC)分析,以验证其纯度(≥98%)和结构。核磁共振(NMR)光谱和质谱分析用于确认其化学结构。此外,还需测试该化合物在标准储存条件下的溶解度和稳定性。
细胞实验
由于DMT-dI是寡核苷酸合成中使用的化学结构单元,而非生物活性化合物,因此体外细胞试验并不适用于它。该化合物未在细胞模型中进行生物活性测试。相反,其应用价值是通过其在寡核苷酸合成反应中的性能来评估的,包括偶联效率和所得寡核苷酸产物的纯度。
动物实验
由于DMT-dI是一种用于寡核苷酸合成的化学结构单元,而非治疗药物,因此不适用于体内动物研究。该化合物并非用于直接体内给药,仅用于研究和合成目的。任何体内研究都将使用由该结构单元合成的最终寡核苷酸或核苷类似物进行。
药代性质 (ADME/PK)
DMT-dI 的药代动力学性质并不重要,因为它是一种化学结构单元而非治疗药物。该化合物的分子量为 554.59,分子式为 C₃₁H₃₀N₄O₆。它为固体粉末,纯度≥98%。该化合物在推荐的储存条件下稳定,可用作寡核苷酸合成的合成中间体。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DMT-dI 的毒性特征尚未得到充分阐明,因为它是一种化学结构单元而非治疗药物。实验室操作和使用的标准安全数据适用。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. Convertible nucleoside derivatives. WO2008045535A2.

其他信息
DMT-dI(CAS 93778-57-5)的分子式为C₃₁H₃₀N₄O₆,分子量为554.59。该化合物为白色至黄色固体,纯度≥98%。它是一种DMT保护的脱氧肌苷衍生物,可用作寡核苷酸合成的结构单元。该化合物仅供研究使用,未获准用于临床。它用于制备可转化核苷类似物和修饰核酸,以用于研究应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H30N4O6
分子量
554.59
精确质量
554.217
CAS号
93778-57-5
PubChem CID
136192437
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
4.206
tPSA
120.98
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
41
分子复杂度/Complexity
875
定义原子立体中心数目
3
SMILES
COC1=CC=C(C=C1)C(C2=CC=CC=C2)(C3=CC=C(C=C3)OC)OC[C@@H]4[C@H](C[C@@H](O4)N5C=NC6=C5N=CNC6=O)O
InChi Key
IYNGMVFRUKBGNM-OYUWMTPXSA-N
InChi Code
InChI=1S/C31H30N4O6/c1-38-23-12-8-21(9-13-23)31(20-6-4-3-5-7-20,22-10-14-24(39-2)15-11-22)40-17-26-25(36)16-27(41-26)35-19-34-28-29(35)32-18-33-30(28)37/h3-15,18-19,25-27,36H,16-17H2,1-2H3,(H,32,33,37)/t25-,26+,27+/m0/s1
化学名
9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 125 mg/mL (225.39 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.75 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.75 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.75 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8031 mL 9.0157 mL 18.0313 mL
5 mM 0.3606 mL 1.8031 mL 3.6063 mL
10 mM 0.1803 mL 0.9016 mL 1.8031 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们