DMT-dU-CE Phosphoramidite

别名: DMT-dU-CE Phosphoramidite 5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧尿苷-3'-O-[O-(2-氰基乙基)-N,N'-二异丙基亚磷酰胺];DU 亚磷酰胺单体
目录号: V52172 纯度: ≥98%
DMT-dU-CE 亚磷酰胺是一种核苷分子,可用于 DNA 合成和 DNA 测序。
DMT-dU-CE Phosphoramidite CAS号: 109389-30-2
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
DMT-dU-CE 亚磷酰胺是一种核苷分子,可用于 DNA 合成和 DNA 测序。
DMT-dU-CE 亚磷酰胺是天然脱氧核苷脱氧尿苷的化学修饰衍生物,用于 DNA 合成和 DNA 测序。这些修饰对于其在 DNA 序列的受控逐步合成中发挥作用至关重要。该化合物的分子式为 C39H47N4O8P,分子量为 730.79。它是一种常用的核苷分子,用于 DNA 的合成和测序。
生物活性&实验参考方法
靶点
DMT-dU-CE Phosphoramidite is a nucleoside molecule used in DNA synthesis and DNA sequencing. The compound contains a 5'-O-dimethoxytrityl (DMT) protecting group, a 2'-deoxyuridine nucleoside, and a 3'-O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite group. The DMT group protects the 5'-hydroxyl group during DNA synthesis, while the phosphoramidite group allows for the coupling of the nucleoside to the growing DNA chain. The compound is used as a building block in the solid-phase synthesis of DNA oligonucleotides.
体外研究 (In Vitro)
DMT-dU-CE DNA合成和测序均可受益于亚磷酰胺的使用[1]。
在体外,DMT-dU-CE亚磷酰胺可用作DNA合成和DNA测序的构建模块。该化合物是一种核苷分子,在固相DNA合成过程中被掺入DNA寡核苷酸中。每次偶联步骤后,DMT保护基团都会被移除,以便添加下一个核苷酸。该化合物对于DNA序列的可控、逐步合成至关重要。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未发表关于DMT-dU-CE亚磷酰胺的详细体内活性数据。该化合物是一种用于DNA合成和测序的研究试剂,不适用于治疗用途。其活性仅限于作为DNA寡核苷酸合成的构建模块。
酶活实验
DMT-dU-CE亚磷酰胺的纯度和特性可通过多种分析技术进行评估。典型的分析方法是利用高效液相色谱(HPLC)、核磁共振波谱(NMR)和质谱(MS)对该化合物进行表征。其纯度通常≥98%。该化合物作为亚磷酰胺在DNA合成中的功能,可通过将其应用于标准固相DNA合成方案,并利用HPLC或质谱分析所得寡核苷酸来验证。
细胞实验
DMT-dU-CE亚磷酰胺用于DNA合成反应。在典型的固相DNA合成方案中,该化合物溶解于无水乙腈中,并与固定在固相载体上的正在延伸的DNA链的5'-羟基偶联。该偶联反应由弱酸催化,例如四唑或5-乙硫基-1H-四唑。每次偶联步骤后,去除DMT保护基团,并重复该循环以构建所需的DNA序列。
动物实验
目前尚未发表关于DMT-dU-CE亚磷酰胺的详细体内动物模型数据。该化合物是一种用于DNA合成的研究试剂,不适用于体内应用。它通常在实验室中用于合成DNA寡核苷酸,以用于研究目的。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未公布DMT-dU-CE亚磷酰胺的详细药代动力学数据。该化合物的分子量为730.79,分子式为C39H47N4O8P。通常储存于-20°C,并避光防潮。该化合物可溶于无水乙腈,而无水乙腈是DNA合成中常用的溶剂。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未公布DMT-dU-CE亚磷酰胺的详细毒性数据。该化合物是一种用于DNA合成的研究试剂,不适用于治疗用途。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。该化合物不可用于人类食用或治疗用途。
参考文献

[1]. Synthesis of a protected ribonucleoside phosphoramidite-linked spin label via an alkynyl chain at the 5′ position of uridine. Synthetic Communications. 2019; 49(1).

其他信息
DMT-dU-CE亚磷酰胺(CAS号:109389-30-2)是一种化学修饰的脱氧尿苷衍生物,用于DNA合成和DNA测序。它是一种核苷分子,包含DMT保护基团、2'-脱氧尿苷核苷和亚磷酰胺基团。该化合物可用作DNA寡核苷酸固相合成的结构单元。其分子式为C39H47N4O8P,分子量为730.79,纯度≥98%。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C39H47N4O8P
分子量
730.79
精确质量
730.313
CAS号
109389-30-2
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
7.5
tPSA
150.86
别名
DMT-dU-CE Phosphoramidite
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~136.8 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3684 mL 6.8419 mL 13.6838 mL
5 mM 0.2737 mL 1.3684 mL 2.7368 mL
10 mM 0.1368 mL 0.6842 mL 1.3684 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们