GSK3735967

目录号: V52034 纯度: ≥98%
GSK3735967 是一种选择性、可逆、非核苷 DNMT1 抑制剂。
GSK3735967 CAS号: 2170136-86-2
产品类别: DNA Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
GSK3735967 是一种选择性、可逆的非核苷类 DNMT1 抑制剂。GSK3735967 含有一个平面二氰基吡啶核心,该核心能够特异性地嵌入 DNMT1 结合的半甲基化 CpG 二核苷酸中。GSK3735967 具有三个结合位点,其中一个可以与组蛋白 H4K20me3 结合。
GSK3735967 (CAS 2170136-86-2) 是一种选择性、可逆的非核苷类 DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 抑制剂,IC50 为 40 nM。它含有一个平面二氰基吡啶核心,该核心能够特异性地嵌入 DNMT1 结合的半甲基化 CpG 二核苷酸中。该化合物具有三个结合位点,其中一个可以与组蛋白 H4K20me3 相互作用。 GSK3735967 可阻断对称精氨酸二甲基化,从而干扰致癌信号传导并诱导肿瘤细胞周期停滞,并用于血液学和实体瘤研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
GSK3735967 targets DNA methyltransferase 1 (DNMT1) with high potency (IC50 = 40 nM). DNMT1 is responsible for maintaining DNA methylation patterns during replication, and its dysregulation is associated with various cancers. As a non-nucleoside inhibitor, GSK3735967 does not mimic the natural cytosine substrate but instead binds to DNMT1 through a unique mechanism involving its planar dicyanopyridine core that intercalates into hemimethylated CpG sites. The compound also interacts with histone H4K20me3 through one of its three binding sites.
体外研究 (In Vitro)
GSK3735967 (0.1–1000 nM) 以剂量依赖的方式抑制 DNMT1 活性 [1]。体外实验表明,GSK3735967 在纳摩尔浓度下即可表现出强效的 DNMT1 抑制活性 (IC50 = 40 nM)。其平面二氰基吡啶核心结构能够特异性地嵌入 DNMT1 结合的半甲基化 CpG 二核苷酸中。该化合物的作用机制涉及三个不同的结合位点,包括与组蛋白 H4K20me3 的相互作用。通过抑制 DNMT1,GSK3735967 可降低 DNA 甲基化水平,从而导致沉默的抑癌基因重新表达,并诱导癌细胞发生细胞周期阻滞。
体内研究 (In Vivo)
公开资料中关于GSK3735967的体内数据有限。作为一种具有强效体外活性的DNMT1抑制剂,该化合物有望在临床前癌症模型中展现抗肿瘤疗效。DNMT1抑制剂已证实可通过逆转异常的DNA甲基化模式,在血液系统恶性肿瘤和实体瘤中发挥活性。然而,目前已发表的关于GSK3735967体内疗效的具体研究并不多见。该化合物主要用作研究肿瘤学中DNA甲基化和表观遗传调控的研究工具。
酶活实验
用于检测 GSK3735967 的体外 DNMT1 抑制试验通常使用重组 DNMT1 酶和半甲基化 DNA 底物。该试验通过测量甲基从 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 向 DNA 底物的转移来评估抑制效果,抑制作用可通过放射性或荧光法检测。IC50 值由剂量-反应曲线计算得出。该化合物与 DNMT1 的结合可通过表面等离子共振或等温滴定量热法进一步表征,以确认其非核苷类、可逆的结合机制。
细胞实验
在DNMT1过表达或异常激活的癌细胞系中评估GSK3735967的细胞活性。将细胞用不同浓度的化合物处理72-96小时,并使用亚硫酸氢盐测序或甲基化特异性PCR检测DNA甲基化水平。采用MTT或CellTiter-Glo等标准方法评估细胞活力和增殖。通过流式细胞术评估细胞凋亡和细胞周期阻滞。通过qPCR或Western blotting验证沉默的抑癌基因的重新表达。
动物实验
GSK3735967 的体内研究通常采用血液肿瘤或实体瘤的异种移植小鼠模型。该化合物将通过口服或静脉注射给药,剂量根据药代动力学研究确定。肿瘤生长抑制情况将在数周内进行测量,并评估肿瘤组织中的药效学标志物,例如整体 DNA 甲基化水平和沉默基因的重新表达。然而,目前文献中尚未发表 GSK3735967 的具体体内研究方案。
药代性质 (ADME/PK)
公开资料中关于GSK3735967的药代动力学数据报道较少。该化合物分子量为477.62 g/mol,在DMSO中的溶解度为25 mg/mL (52.34 mM)。作为一种小分子DNMT1抑制剂,预计其口服生物利用度中等。目前文献中尚无该研究化合物的详细药代动力学参数,例如半衰期、清除率和分布容积。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
公开资料中关于 GSK3735967 的毒性数据有限。与所有研究化合物一样,GSK3735967 仅供研究使用,不得用于人体治疗。要进行完整的毒性评估,需要进行正常细胞系的标准体外细胞毒性试验和动物模型的体内耐受性研究。现有文献中尚未报道该化合物的具体毒性数据。
参考文献

[1]. Structural characterization of dicyanopyridine containing DNMT1-selective, non-nucleoside inhibitors. Structure. 2022 Jun 2;30(6):793-802.e5.

[2]. Structural Studies of DNMT1-DNA Complexes with a Reversible Series of Dicyanopyridine Containing Selective, Non-Nucleoside Inhibitors. Foundations of Crystallography, 2022, 78: a246.

其他信息
GSK3735967 是一种选择性、可逆的非核苷类 DNMT1 抑制剂,其独特的平面二氰基吡啶核心结构可嵌入半甲基化的 CpG 二核苷酸中。它具有三个结合位点,包括与组蛋白 H4K20me3 的相互作用。该化合物通过抑制 DNMT1,阻断对称精氨酸二甲基化,从而诱导肿瘤细胞周期阻滞。它被用于血液系统恶性肿瘤和实体瘤的研究。该化合物是研究 DNA 甲基化、表观遗传调控和癌症生物学的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H31N7OS
分子量
477.62494301796
精确质量
477.231
CAS号
2170136-86-2
PubChem CID
132233120
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
LogP
2.3
tPSA
147
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
753
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NCC1=CC=C(CSC2=NC(N3CCCN(C)CC3)=C(C#N)C(CC)=C2C#N)C=C1)(=O)CN
InChi Key
QPLFMVVUDGWTPG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H31N7OS/c1-3-20-21(13-26)24(32-10-4-9-31(2)11-12-32)30-25(22(20)14-27)34-17-19-7-5-18(6-8-19)16-29-23(33)15-28/h5-8H,3-4,9-12,15-17,28H2,1-2H3,(H,29,33)
化学名
2-amino-N-[[4-[[3,5-dicyano-4-ethyl-6-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)pyridin-2-yl]sulfanylmethyl]phenyl]methyl]acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 31.25 mg/mL (65.43 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (4.35 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0937 mL 10.4686 mL 20.9371 mL
5 mM 0.4187 mL 2.0937 mL 4.1874 mL
10 mM 0.2094 mL 1.0469 mL 2.0937 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们