| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5g |
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| 10g |
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| 25g |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
N4-Benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine does not have a specific biological target itself but serves as a protected cytidine building block for oligonucleotide synthesis. When incorporated into oligonucleotides, the resulting sequences can target various biological molecules. The DMT group provides 5'-hydroxyl protection for controlled chain elongation, while the benzoyl group protects the exocyclic amine of cytosine during synthesis. The compound has been used in the synthesis of oligodeoxynucleotides containing a 3'-S-phosphorothiolate (3'-PS) linkage.
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| 体外研究 (In Vitro) |
通过N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷作为寡核苷酸合成结构单元的用途，评估其体外活性。通过监测偶联效率，评估其在固相合成过程中掺入不断增长的寡核苷酸链的效率。采用高效液相色谱法(HPLC)分析评估该化合物的纯度（最低99.0%）及其在自动化DNA合成中的适用性。利用热熔解(Tm)分析评估所得寡核苷酸与互补序列的杂交能力。该化合物可用于探测DNA中酶催化的切割过程。
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| 体内研究 (In Vivo) |
N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷的体内研究通常是使用以该结构单元合成的寡核苷酸进行，而不是直接使用受保护的核苷本身。这些寡核苷酸在动物模型中用于评估其药代动力学特性、生物分布以及在反义疗法或核酸疗法等应用中的治疗效果。该化合物已被用作抗病毒和抗癌研究的工具。在寡核苷酸的合成和脱保护过程中，保护基团会被去除。
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| 酶活实验 |
寡核苷酸合成中，N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷转化为相应的亚磷酰胺，并采用标准固相合成方案将其掺入寡核苷酸中。在每个合成循环中，通过三苯甲基阳离子释放量来监测偶联效率。合成后，将寡核苷酸从固相载体上切割下来，并使用合适的试剂进行脱保护。最终的寡核苷酸通过高效液相色谱(HPLC)或聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)纯化，并通过质谱进行表征。HPLC纯度至少为99.0%。
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| 细胞实验 |
在细胞研究中，培养的细胞用以N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷为结构单元合成的寡核苷酸处理。细胞与寡核苷酸孵育24-72小时后，使用荧光显微镜或流式细胞术，通过荧光标记的寡核苷酸评估细胞摄取情况。对于反义应用，基因敲低效率通过qRT-PCR或Western blot进行评估。对于抗病毒和抗癌研究，使用适当的检测方法来评估疗效。细胞毒性采用MTT或CellTiter-Glo检测进行评估。
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| 动物实验 |
为了对使用 N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷合成的寡核苷酸进行体内评价，通过多种途径将寡核苷酸给药于小鼠或大鼠。利用基于杂交的检测方法或液相色谱-质谱联用（LC-MS）测定血浆和组织中寡核苷酸的浓度，从而确定包括半衰期、清除率和组织分布在内的药代动力学参数。对于治疗应用，在合适的疾病模型（例如，用于抗癌研究的肿瘤异种移植模型）中评估疗效。通过监测体重、器官组织病理学和血清化学指标来评估毒性。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
本文对含有N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷的寡核苷酸（而非受保护的核苷本身）的药代动力学性质进行了表征。该化合物通常为白色至类白色粉末或结晶固体。经高效液相色谱法(HPLC)测定，纯度不低于99.0%。详细的药代动力学参数取决于具体的寡核苷酸序列、长度和骨架化学性质。建议在惰性气体保护下于-20°C保存。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷是一种仅供实验室使用的研究化合物，未获准用于人体治疗。作为胞苷核苷衍生物，它可用作寡核苷酸合成的结构单元。该化合物已被用作抗病毒和抗癌研究的工具。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。纯度最低为99.0%（HPLC法）。建议在惰性气体保护下于-20°C储存。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
N4-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧胞苷是一种胞苷核苷衍生物，分子式为C37H35N3O7，HPLC纯度≥99.0%。它是寡脱氧核苷酸合成的结构单元，其特点是在胞嘧啶的5'位进行DMT保护，N4位进行苯甲酰基保护。该化合物用于抗病毒和抗癌研究，以及用于探测DNA酶促裂解。本品仅供研究使用，尚未获准用于临床。HPLC纯度≥99.0%。建议在-20℃惰性气体保护下储存。
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| 分子式 |
C37H35N3O7
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|---|---|
| 分子量 |
633.69
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| 精确质量 |
633.248
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| CAS号 |
67219-55-0
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| PubChem CID |
2724490
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.27 g/cm3
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| 熔点 |
119 °C
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| 折射率 |
58 ° (C=1, MeOH)
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| LogP |
5.242
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| tPSA |
121.14
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
7
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| 可旋转键数目(RBC) |
11
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| 重原子数目 |
47
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| 分子复杂度/Complexity |
1080
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
COC1=CC=C(C=C1)C(C2=CC=CC=C2)(C3=CC=C(C=C3)OC)OC[C@@H]4[C@H](C[C@@H](O4)N5C=CC(=NC5=O)NC(=O)C6=CC=CC=C6)O
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| InChi Key |
MYSNCIZBPUPZMQ-VOTWKOMSSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C37H35N3O7/c1-44-29-17-13-27(14-18-29)37(26-11-7-4-8-12-26,28-15-19-30(45-2)20-16-28)46-24-32-31(41)23-34(47-32)40-22-21-33(39-36(40)43)38-35(42)25-9-5-3-6-10-25/h3-22,31-32,34,41H,23-24H2,1-2H3,(H,38,39,42,43)/t31-,32+,34+/m0/s1
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| 化学名 |
N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : 100 mg/mL (157.81 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (3.95 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.5781 mL | 7.8903 mL | 15.7806 mL | |
| 5 mM | 0.3156 mL | 1.5781 mL | 3.1561 mL | |
| 10 mM | 0.1578 mL | 0.7890 mL | 1.5781 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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