Nucleoside-Analog-2

目录号: V41087 纯度: ≥98%
Nucleoside-Analog-2 是一种 4'-叠氮胞苷类似物,针对 HCV(丙型肝炎病毒)复制。
Nucleoside-Analog-2 CAS号: 876708-01-9
产品类别: Nucleoside Antimetabolite/Analog
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
核苷类似物-2 是一种 4'-叠氮胞苷类似物,可靶向抑制丙型肝炎病毒 (HCV) 的复制。核苷类似物-2 是一种点击化学试剂。它含有叠氮基 (N3),可与含有炔基的化合物发生 CuAAc 反应(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可能与含有 BCN 或 DBCO 基团的化合物发生 SPAAC 反应(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
核苷类似物-2 是一种 4'-叠氮胞苷类似物,靶向抑制丙型肝炎病毒 (HCV) 的复制。这种合成核苷类似物旨在通过掺入新生 RNA 链来干扰病毒 RNA 的合成。此外,该化合物含有叠氮官能团,使其成为一种可用于生物偶联的点击化学试剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
HCV RNA polymerase / Viral replication machinery.
体外研究 (In Vitro)
为了防止丙型肝炎病毒(HCV)的复制,核苷类似物-2 是一种 4'-叠氮胞苷类似物。物质 12 的引用[1]。
该化合物通过作为链终止核苷类似物发挥抗HCV活性。作为一种4'-叠氮胞苷类似物,它很可能被病毒RNA依赖性RNA聚合酶(NS5B)掺入到正在延伸的RNA链中,导致链提前终止并抑制病毒RNA复制。标准数据集未提供详细的效力(EC50)值和耐药性谱。
体内研究 (In Vivo)
细胞:携带HCV复制子的细胞(例如,含有亚基因组或全长HCV复制子的Huh-7细胞)。实验方案:将细胞用不同浓度的核苷类似物-2处理48-72小时。通过实时RT-PCR定量HCV RNA水平或通过Western blot或免疫荧光检测HCV蛋白(例如NS3、NS5A)来评估抗病毒活性。同时,采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞毒性。
酶活实验
未找到具体的体内数据;请参考一般 HCV 药物特性:在 HCV 感染的小鼠模型(例如,具有人源化肝脏的 uPA-SCID 嵌合小鼠)中,核苷类似物通常以 10-100 mg/kg/天的剂量口服或腹腔注射,持续 2-4 周,可显著降低血清 HCV RNA 水平,通常降低 2-4 个对数单位,且耐受性良好。
细胞实验
检测方法:体外RNA依赖性RNA聚合酶(NS5B)抑制试验。方案:将重组HCV NS5B聚合酶与RNA模板、NTP底物以及不同浓度的核苷类似物-2(以5'-三磷酸形式存在)孵育。通过掺入放射性标记的NTP(3H-UTP)或荧光检测法定量RNA产物的生成。IC50定义为抑制50%聚合酶活性的浓度。
动物实验
未找到具体的体内实验方案;请参考通用核苷类似物实验方案:在HCV小鼠模型中进行疗效研究时,将化合物配制于PBS或合适的溶剂(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45%生理盐水)中,并以10-100 mg/kg的剂量,每日一次或两次,经口服(PO)或腹腔注射(IP)给药。采集血液和肝组织进行药代动力学分析和HCV RNA定量。
药代性质 (ADME/PK)
未找到具体数据;请参考核苷类似物的一般特性:由于核苷转运蛋白的作用,核苷类似物通常具有良好的口服生物利用度(30-80%)。通过有机阴离子转运多肽(OATP)主动摄取进入肝脏的情况很常见。该化合物经细胞内磷酸化代谢活化为5'-三磷酸活性形式。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
未找到具体数据;请参考核苷类似物的一般特性:线粒体毒性是某些核苷类似物已知的潜在问题,通常通过测量处理细胞中的乳酸水平和线粒体DNA含量来评估。骨髓抑制和胃肠道紊乱也是潜在的类效应,但因化合物结构不同而存在显著差异。
参考文献

[1]. The design, synthesis, and antiviral activity of 4'-azidocytidine analogues against hepatitis C virus replication: the discovery of 4'-azidoarabinocytidine. J Med Chem. 2009 Jan 8;52(1):219-23.

其他信息
核苷类似物-2由于其叠氮基团,也被归类为点击化学试剂,该叠氮基团可与含炔烃分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。这种双重功能使其在探针标记和药物递送应用方面具有潜在用途。该化合物尚未获得FDA批准,仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H11N5O6
分子量
285.213541269302
精确质量
285.07
CAS号
876708-01-9
PubChem CID
25185460
外观&性状
Light brown to gray solid powder
LogP
-1.5
tPSA
134
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
517
定义原子立体中心数目
4
SMILES
N([C@]1([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](N2C=CC(=O)NC2=O)O1)CO)=[N+]=[N-]
InChi Key
FHPJZSIIXUQGQE-XZMZPDFPSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H11N5O6/c10-13-12-9(3-15)6(18)5(17)7(20-9)14-2-1-4(16)11-8(14)19/h1-2,5-7,15,17-18H,3H2,(H,11,16,19)/t5-,6-,7+,9+/m0/s1
化学名
1-[(2R,3S,4S,5R)-5-azido-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 33.33 mg/mL (116.86 mM)
H2O : 20 mg/mL (70.12 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.77 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.77 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.77 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 16.67 mg/mL (58.45 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶 (<60°C).

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5062 mL 17.5309 mL 35.0619 mL
5 mM 0.7012 mL 3.5062 mL 7.0124 mL
10 mM 0.3506 mL 1.7531 mL 3.5062 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们