SGC-CK2-1

别名: SGC-CK2 1
目录号: V36627 纯度: ≥98%
SGC-CK2-1 是一种高效、ATP 竞争性 CK2 化学探针,对两种人类 CK2 亚型 CK2α 和 CK2α' 具有选择性,IC50 分别为 36 和 16 nM。
SGC-CK2-1 CAS号: 2470424-39-4
产品类别: Casein Kinase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
SGC-CK2-1 是一种高效的 ATP 竞争性 CK2 化学探针,对两种人 CK2 亚型 CK2α 和 CK2α' 具有选择性,IC50 值分别为 36 nM 和 16 nM。SGC-CK2-1 可用于神经退行性疾病的研究。
SGC-CK2-1(化合物 24)是一种高效且具有细胞活性的 CK2(酪蛋白激酶 2)化学探针,对两种人 CK2 亚型(CK2α 和 CK2α')均具有特异性选择性。它是一种吡唑并嘧啶衍生物,属于 I 型 ATP 竞争性抑制剂。与临床 CK2 抑制剂 CX-4945 相比,该探针展现出更优异的激酶组选择性,其 S10(1 μM) 评分为 0.007(在 1 μM 浓度下仅对 3 种激酶的抑制率 >90%)。尽管 CK2 与癌细胞增殖长期相关,但 SGC-CK2-1 在 140 多种癌细胞系中,对超过 90% 的细胞系均未表现出广泛的抗增殖活性,这挑战了 CK2 作为普遍癌症驱动因子的传统观点。[1]
生物活性&实验参考方法
靶点
CK2α 36 nM (IC50) CK2α' 16 nM (IC50)
SGC-CK2-1 targets CK2α (CSNK2A1) with enzymatic IC50 = 4.2 nM (radiometric assay at Km ATP) and cellular nanoBRET IC50 = 36 nM in HEK-293 cells; targets CK2α' (CSNK2A2) with enzymatic IC50 = 2.3 nM and cellular nanoBRET IC50 = 16 nM.
Off-target inhibition: DYRK2 enzymatic IC50 = 440 nM, DYRK2 cellular nanoBRET IC50 = 3.7 μM; HIPK2 enzymatic IC50 = 3400 nM; HIPK1 enzymatic IC50 = 3700 nM; HIPK3 enzymatic IC50 = 8100 nM; PLK4 enzymatic IC50 >10,000 nM; DRAK1 enzymatic IC50 >10,000 nM; MEK5 shows 0% inhibition at 1 μM. [1]
体外研究 (In Vitro)
SGC-CK2-1抑制CSNK2A2和CSNK2A1的IC50值分别为2.3 nM和4.2 nM[1]。SGC-CK2-1抑制DYRK2的IC50值为3.7 μM[1]。MV4-11、MOLM-13、OCI-LY19、OCI-AML5和血液U-937细胞均能被SGC-CK2-1抑制,其IC50值分别为120 nM、690 nM、750 nM、760 nM和810 nM。SGC-CK2-1抑制Detroit562头颈细胞的IC50值为550 nM。SGC-CK2-1抑制肺癌NCI-H2286细胞的IC50值为550 nM。 SGC-CK2-1抑制脑SK-N-MC细胞所需的IC50为730 nM。SGC-CK2-1抑制乳腺BT-20细胞所需的浓度为810 nM。SGC-CK2-1抑制皮肤A375细胞的IC50为830 nM。SGC-CK2-1抑制胃SNU-1细胞所需的IC50为860 nM。SGC-CK2-1抑制十二指肠Hutu 80细胞所需的IC50为920 nM[1]。
SGC-CK2-1抗增殖活性:在HCT-116结直肠癌细胞中,浓度高达10 μM时未观察到抗增殖活性(GI50 >10 μM)。在 U-87 MG 胶质母细胞瘤细胞中,浓度高达 10 μM 时未观察到抗增殖活性。在 140 种癌细胞系中,仅 U-937(前单核细胞型人组织细胞淋巴瘤)的 IC50 低于 500 nM(未具体说明 IC50 值)。在 NCI60 细胞系中,浓度为 10 μM 时,SGC-CK2-1 对 A498、HS 578T、RXF 393 和 SNB-75 细胞的致死率较低(8-22%);在HL-60、MCF7、MDA-MB-468和T-47D细胞中,SGC-CK2-1对细胞生长的抑制率超过90%(IC50值为1.2-2.8 μM)。
Caspase 3/7激活:在U-87 MG细胞中,浓度高达10 μM的SGC-CK2-1在多个时间点均未激活caspase 3/7。
Western blot(AKT S129磷酸化):在用SGC-CK2-1处理HCT-116细胞3小时或24小时后,观察到AKT S129磷酸化水平呈剂量依赖性下降;10 μM浓度下抑制作用显著,0.01 μM浓度下抑制作用极小。 GAPDH 内参。
蛋白质印迹(EIF2S2 pS2):在表达四环素诱导型野生型 CK2α-HA 的 U2OS 细胞中,SGC-CK2-1(0.5-10 μM,24 小时)呈剂量依赖性地抑制 EIF2S2 pS2 的磷酸化。在表达抑制剂抗性双突变体 (DM, V66A/I174A) CK2α-HA 的细胞中,SGC-CK2-1 对 EIF2S2 pS2 没有影响。CX-4945 对两者均有抑制作用。SGC-CK2-1 在比 CX-4945 低 10 倍的浓度下即可表现出显著的抑制作用。[1]
酶活实验
scanMAX激酶结合分析:在1 μM化合物浓度下,对403种野生型人激酶进行分析。测定抑制率。对于SGC-CK2-1,仅有3种激酶在1 μM浓度下显示出>90%的抑制率。
放射性激酶谱分析(Eurofins):在ATP的Km值下,对CK2α和CK2α'进行剂量反应(9点曲线,重复两次)分析。所用肽底物为RRRDDDSDDD。计算IC50值。对于SGC-CK2-1,CK2α的IC50 = 4.2 nM,CK2α'的IC50 = 2.3 nM。在ATP的Km值下测试了脱靶激酶(DYRK2、HIPK1、HIPK2、HIPK3、PLK4、DRAK1)。报告的 IC50 值。
LANCE 检测:用于 MEK5,单一浓度 (10 μM),重复两次。SGC-CK2-1 在 1 μM 时显示 0% 抑制。[1]
细胞实验
NanoBRET 细胞靶标结合实验:使用瞬时表达 Nanoluciferase (Nluc) 标记的 CK2α 或 CK2α' 的 HEK-293 细胞。将细胞用 NanoBRET Tracer K5 (1.0 μM) 和不同浓度的 SGC-CK2-1 处理 2 小时。加入 NanoBRET NanoGlo 底物和细胞外 NanoLuc 抑制剂后测量 BRET 信号。IC50 值由剂量反应曲线计算得出。CK2α 的 IC50 值为 36 nM;CK2α' 的 IC50 值为 16 nM。
AlamarBlue 细胞增殖实验:将 HCT-116 或 U-87 MG 细胞以 2500 个细胞/孔的密度接种于 96 孔板中,过夜培养后,用 10 个浓度梯度的 SGC-CK2-1 (0.01-10 μM) 处理 72 小时。加入 AlamarBlue 试剂,孵育 4 小时,在 535/590 nm 处测量荧光强度。GI50 的计算以星形孢菌素 (10 μM) 为最小值,DMSO 为最大值。
大规模抗增殖试验(140 种细胞系):将细胞接种于白色平底透明底多孔板中,过夜孵育。使用 Tecan 分液器,将 SGC-CK2-1 以 3 μM 至 0.9 nM(最终 DMSO 浓度为 0.1%)的 8 个浓度点进行 3 倍稀释。孵育 72 小时后,加入 CellTiter-Glo 试剂,测量发光值。 IC50 使用 GraphPad Prism 软件,采用可变斜率 S 型响应模型计算(下限为 0% 细胞活力,上限为 100% 细胞活力)。
NCI60 细胞系:SGC-CK2-1 以 10 μM 的单剂量针对 59 种癌细胞系进行测试。报告处理组细胞相对于对照组和零时点的生长百分比,从而检测生长抑制(0-100)和致死性(<0)。
Caspase-Glo 3/7 检测:用浓度高达 10 μM 的 SGC-CK2-1 处理 U-87 MG 细胞;检测按照制造商说明进行。未观察到激活。
Western blot (HCT-116):将细胞以每孔 200,000 个的密度接种于 6 孔板中,用 SGC-CK2-1 (0.01-10 μM) 处理 3 小时或 24 小时。裂解细胞,用 BCA 法定量蛋白,在 4-12% Bis-Tris 梯度凝胶上进行分离,然后转移至 PVDF 膜。用 5% BSA 封闭,依次与抗 pAKT S129、抗 AKT1 和抗 GAPDH 抗体孵育,再与 HRP 标记的二抗孵育,最后用 ECL 底物显色。定量分析条带强度。
Western blot (U2OS):FT-U2OS 细胞表达四环素诱导型野生型或 DM (V66A/I174A) CK2α-HA。用四环素 (1 μg/mL) 诱导 48 小时,然后用 SGC-CK2-1 (0.5-10 μM) 处理 24 小时。进行 EIF2S2 pS2、总 EIF2S2 和 GAPDH 的免疫印迹分析。使用红外染料标记的二抗,并在 LiCor Odyssey 系统上进行定量分析。残余 CK2 活性以 DMSO 对照组的百分比计算。[1]
参考文献

[1]. Development of a potent and selective chemical probe for the pleiotropic kinase CK2. Cell Chem Biol. 2021 Apr 15;28(4):546-558.e10.

[2]. A New Chemical Probe Challenges the Broad Cancer Essentiality of CK2. Trends Pharmacol Sci. 2021 May;42(5):313-315.

其他信息
SGC-CK2-1 是一种吡唑并嘧啶化合物,具体而言,它是吡唑并[1,5-a]嘧啶的衍生物,其 3、5 和 7 位分别被氰基、(4-甲基-3-丙酰胺基苯基)亚硝基和环丙基亚硝基取代。它是一种高效且选择性的化学探针,可用于检测多效性激酶 CK2。它是一种 EC 2.7.11.1(非特异性丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶)抑制剂。 SGC-CK2-1 属于吡唑并嘧啶类、腈类、仲氨基类、取代苯胺类、环丙烷类和仲羧酰胺类化合物。
SGC-CK2-1 是一种吡唑并嘧啶衍生物(化合物 24),其设计基于阿斯利康的先导化合物 17。它在 3 位具有丙酰胺基团,这使其选择性优于含有乙酰胺或环丙烷羧酰胺基团的类似物。阴性对照化合物 SGC-CK2-1N(化合物 32)是通过氮原子的全局甲基化生成的,破坏了关键的氢键和空间位阻,导致 CK2 结合丧失(CK2α' nanoBRET IC50 >10 μM,无酶活性)。 CK2α 与 SGC-CK2-1 复合物的 X 射线晶体结构(PDB 代码 6Z83)显示其为 I 型 ATP 竞争性结合模式,关键氢键与铰链区 H115-V116 结合,并与 DWG 基序和 αC 螺旋相互作用。酶活性测定表明,SGC-CK2-1 对 CK2 的选择性比其最有效的非靶标 DYRK2 高 100 倍(CK2 IC50 为 4.2 nM,DYRK2 IC50 为 440 nM),且这种选择性在细胞中也得以保持(nanoBRET CK2α' 为 16 nM,DYRK2 为 3.7 μM)。该化合物挑战了CK2对癌细胞增殖普遍至关重要的传统观念,因为它在大多数癌细胞系中缺乏抗增殖活性,这表明先前报道的选择性较低的CK2抑制剂(例如CX-4945)的抗增殖作用很可能是由于其对脱靶激酶(例如DAPK家族)的抑制作用所致。除了肿瘤治疗外,该化合物的潜在治疗应用还包括神经退行性疾病(阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、额颞叶痴呆)和病毒感染(SARS-CoV-2),因为CK2在神经炎症和病毒劫持中发挥着重要作用。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H21N7O
分子量
375.427042722702
精确质量
375.18
CAS号
2470424-39-4
PubChem CID
146681133
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
2.8
tPSA
107
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
615
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(CC)NC1=C(C)C=CC(=C1)NC1C=C(N2C(=C(C#N)C=N2)N=1)NC1CC1
InChi Key
YKDZIFFKQUNVHH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H21N7O/c1-3-19(28)25-16-8-15(5-4-12(16)2)23-17-9-18(24-14-6-7-14)27-20(26-17)13(10-21)11-22-27/h4-5,8-9,11,14,24H,3,6-7H2,1-2H3,(H,23,26)(H,25,28)
化学名
N-[5-[[3-cyano-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]-2-methylphenyl]propanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (266.36 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6636 mL 13.3181 mL 26.6361 mL
5 mM 0.5327 mL 2.6636 mL 5.3272 mL
10 mM 0.2664 mL 1.3318 mL 2.6636 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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