Seco-DUBA

别名: SECO DUBA
目录号: V37124 纯度: ≥98%
Seco-DUBA 是多卡霉素 (DUBA) 的前药,含有两个羟基,每个羟基都可以通过连接基与抗体缀合。
Seco-DUBA CAS号: 1227961-59-2
产品类别: ADC Cytotoxin
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
Other Sizes

Other Forms of Seco-DUBA:

  • Seco-DUBA hydrochloride
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产品描述
Seco-DUBA是多卡霉素(DUBA)的前药,含有两个羟基,每个羟基都可以通过连接子与抗体偶联。Seco-DUBA可用于制备抗体药物偶联物(ADC)。
Seco-DUBA (V37124):一种含有两个羟基的杜卡霉素 (DUBA) 前药,每个羟基均可通过连接子与抗体偶联,使其成为抗体药物偶联物 (ADC) 开发中用途广泛的有效载荷。它是一种细胞渗透性前药,在 ADC 内化后,于细胞内溶酶体中被蛋白酶切割成活性毒素 (DUBA)。杜卡霉素是已知最有效的细胞毒性药物之一,可作为 DNA 小沟烷基化剂发挥作用。“seco”(seco-环丙基)形式是稳定的前药形式;在细胞内活化后,它发生环化反应,形成活性环丙基吡咯并吲哚 (CPI) 化合物,该化合物可烷基化 DNA 腺嘌呤的 N3 位点。用于合成靶向癌症治疗的 ADC。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA (minor groove). Duocarmycins are potent DNA alkylating agents that bind to the minor groove of DNA with high sequence selectivity (preferring AT-rich sequences) and alkylate adenine residues at the N3 position, leading to irreversible DNA damage, cell cycle arrest, and cell death. Seco-DUBA itself is a prodrug and requires activation to the active DUBA form.
体外研究 (In Vitro)
Seco-DUBA(SK-BR-3 细胞;0.0001 pM~0.01 nM;144 小时)的效力和功效与 DUBA 相当,但细胞活力呈剂量依赖性降低[1]。SK-BR-3 (IC50=0.09)、SK-OV-3 (IC50=0.43) 和 SW620 (IC50=0.09) 细胞在暴露于 seco-DUBA 时表现出很高的敏感性[1]。
Seco-DUBA是一种前药,在转化为DUBA之前不具有直接的细胞毒活性。活性DUBA毒素是一种高效的细胞毒剂,对多种癌细胞系的IC50值在皮摩尔至低纳摩尔范围内(通常为10-100 pM)。作为一种前药,其活性依赖于细胞内激活并从抗体药物偶联物(ADC)中释放。当与靶向抗体偶联时,ADC可将前药特异性地递送至肿瘤细胞,并在细胞内激活,释放出强效的DUBA毒素,从而导致靶向肿瘤细胞死亡。
体内研究 (In Vivo)
Seco-DUBA(89 μg/kg;静脉注射)很可能几乎瞬间转化为 DUBA[1]。
在体内,seco-DUBA 可用作抗体药物偶联物 (ADC) 的有效载荷。当与靶向抗体偶联后,ADC 通过抗原介导的结合在肿瘤中积聚并被内化。前药在细胞内被裂解和激活,释放出强效的 DUBA 毒素,从而导致肿瘤细胞死亡。与直接给药游离毒素相比,这种方法通过降低全身毒性显著提高了治疗指数。含有 duocarmycin 有效载荷的 ADC 在小鼠异种移植模型中显示出强大的抗肿瘤活性。
酶活实验
不适用于前药本身。释放的DUBA毒素的活性可通过无细胞DNA烷基化试验进行评估:将分离的质粒DNA或小牛胸腺DNA与DUBA(0.1-100 nM)在TE缓冲液中于37℃孵育1-24小时。DNA烷基化可通过琼脂糖凝胶上DNA迁移率的变化、溴化乙锭置换或烷基化核苷的HPLC-MS分析来检测。
细胞实验
细胞毒性试验[1]
细胞类型: SK-BR-3 细胞
测试浓度: 0.0001 pM~0.01 nM
孵育时间: 144 小时
实验结果: 细胞活力呈剂量依赖性下降。
细胞活力检测:将表达靶抗原的癌细胞接种于96孔板中,并用含有seco-DUBA(0.001-1000 nM)的抗体药物偶联物(ADC)或游离DUBA毒素处理72-96小时。采用MTT、CellTiter-Glo或克隆形成实验检测细胞活力。IC50值由剂量反应曲线确定。靶向依赖性杀伤(与抗原阴性细胞比较)证实了ADC的特异性。
动物实验
动物/疾病模型: Wistar 大鼠[1]
剂量: 89 μg/kg(药代动力学/PK 分析)
给药途径: 静脉注射
实验结果: 可能几乎立即转化为 DUBA。
小鼠异种移植模型:将携带表达靶抗原的人类肿瘤异种移植瘤的免疫缺陷小鼠,用含有seco-DUBA的抗体偶联药物(ADC)(1-10 mg/kg,静脉注射,单次或多次给药)进行治疗。每周测量两次肿瘤体积,并计算肿瘤生长抑制率(TGI)。药效学分析包括评估肿瘤组织中的DNA损伤标志物(γ-H2AX)。
药代性质 (ADME/PK)
seco-DUBA本身不适用。含有seco-DUBA的抗体药物偶联物(ADC)的药代动力学由抗体成分决定,其半衰期长(通常在啮齿动物中为数天,在人体内为1-3周)、清除率低且组织分布有限,这些都是单克隆抗体的特征。药物抗体比(DAR)和连接子稳定性会影响有效载荷的释放动力学。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为一种前药,seco-DUBA 的设计旨在降低活性 DUBA 毒素的毒性,从而减少脱靶效应。毒性主要与释放的 DUBA 毒素相关,高剂量时可引起骨髓抑制(中性粒细胞减少症、血小板减少症)、胃肠道反应以及潜在的肝毒性。抗体偶联药物 (ADC) 策略旨在通过将有效载荷特异性递送至肿瘤细胞来最大限度地降低全身毒性。
参考文献

[1]. Design, Synthesis, and Evaluation of Linker-Duocarmycin Payloads: Toward Selection of HER2-Targeting Antibody-Drug Conjugate SYD985. Mol Pharm. 2015;12(6):1813-1835.

[2]. Platform Technologies in Drug Discovery and Validation.

其他信息
这是一种用于抗体药物偶联物(ADC)开发的研究化合物。它是一种基于杜卡霉素的有效载荷,可用于构建稳定高效的ADC。其分子中两个羟基的存在使其能够通过多种连接化学方法(包括马来酰亚胺-硫醇化学和点击化学)与抗体进行位点特异性偶联。该化合物也称为DUBA(杜卡霉素DUBA)前药。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H23CLN4O4
分子量
526.97
精确质量
526.14
CAS号
1227961-59-2
相关CAS号
Seco-DUBA hydrochloride;1795733-93-5
PubChem CID
46240929
外观&性状
Light yellow to brown solid powder
LogP
5.3
tPSA
107
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
885
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C(NC1=CN2C=C(C(N3C4=C(C5=C(C)C=CC=C5C(O)=C4)[C@H](CCl)C3)=O)N=C2C=C1)(=O)C1=CC=C(O)C=C1
InChi Key
VQAFBYLFRCCWNB-GOSISDBHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H23ClN4O4/c1-16-3-2-4-21-24(36)11-23-27(26(16)21)18(12-30)13-34(23)29(38)22-15-33-14-19(7-10-25(33)32-22)31-28(37)17-5-8-20(35)9-6-17/h2-11,14-15,18,35-36H,12-13H2,1H3,(H,31,37)/t18-/m1/s1
化学名
N-[2-[(1S)-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-9-methyl-1,2-dihydrobenzo[e]indole-3-carbonyl]imidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]-4-hydroxybenzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (189.76 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 1 mg/mL (1.90 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 1 mg/mL (1.90 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8976 mL 9.4882 mL 18.9764 mL
5 mM 0.3795 mL 1.8976 mL 3.7953 mL
10 mM 0.1898 mL 0.9488 mL 1.8976 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们