TMX-4113

别名: TMX4113
目录号: V35188 纯度: ≥98%
TMX-4113 是磷酸二酯酶 6D (PDE6D) 和酪蛋白激酶 1α (CK1α) 的降解剂。
TMX-4113 CAS号: 2766385-92-4
产品类别: Casein Kinase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
TMX-4113 是一种磷酸二酯酶 6D (PDE6D) 和酪蛋白激酶 1α (CK1α) 的降解剂。TMX-4113 可用于癌症相关研究。
TMX-4113 是一种小分子异双功能降解剂,专门设计用于靶向并诱导磷酸二酯酶 6D (PDE6D) 和酪蛋白激酶 1alpha (CK1alpha) 的蛋白酶体降解。它可用作化学探针,用于研究这些蛋白在癌症生物学中的致癌作用。该化合物包含一个与靶标结合配体相连的 cereblon E3 连接酶募集部分,该部分使 E3 连接酶与 PDE6D 和 CK1alpha 接近,从而导致它们的泛素化和后续降解。这种机制能够永久性地去除靶蛋白,而非短暂抑制,为研究 PDE6D 和 CK1alpha 缺失在细胞信号通路中的功能后果提供了一种强有力的工具。TMX-4113 仅供研究使用,尚未获准用于任何治疗用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDE6D CK1α
PDE6D (phosphodiesterase 6D) and CK1alpha (casein kinase 1alpha).
体外研究 (In Vitro)
在 MOLT4 细胞中,TMX-4113(化合物 21;1 μM;4 小时)对 PDE6D 和 CK1α 的降解表现出强烈的选择性[1]。在 MOLT4 细胞中,TMX-4113(0 nM、40 nM、200 nM、1 μM;4 小时)可导致 PDE6D 降解[1]。在 MM.1S 细胞中,当 TMX-4113 的浓度为 40 nM 时,其浓度(0 nM、40 nM、200 nM、1 μM;4 小时)可破坏超过 50% 的 CK1α[1]。
在 MOLT4 细胞中,TMX-4113(化合物 21;1 uM;4 小时)对 PDE6D 和 CK1α 的降解表现出很强的选择性。在 40 nM 的浓度下,它能破坏 MM.1S 细胞中超过 50% 的 CK1α。在 MOLT4 细胞中,TMX-4113(0-1 uM;4 小时)以剂量依赖的方式诱导 PDE6D 降解。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中尚未找到关于TMX-4113的具体体内数据。然而,作为一种靶向蛋白降解剂,预计TMX-4113将被用于异种移植小鼠模型,以评估其在肿瘤微环境中降解PDE6D和CK1α的功效,并评估其在未来癌症研究中的潜在抗肿瘤活性。
酶活实验
采用蛋白质印迹法分析蛋白质降解情况。细胞类型:MOLT4细胞。测试浓度:1 uM。孵育时间:4小时。实验结果:PDE6D和CK1α表现出较高的降解偏好性。剂量反应实验中,细胞分别用0 nM、40 nM、200 nM和1 uM的浓度处理4小时。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: MOLT4 细胞
测试浓度: 1 μM
孵育时间: 4 小时
实验结果: 表明对 PDE6D 和 CK1α 具有较高的降解偏好性。

Western Blot 分析[1]
细胞类型: MOLT4 细胞
测试浓度: 0 nM、40 nM、200 nM、1 µM
孵育时间: 4 小时
实验结果: 诱导 PDE6D 降解。
在 MOLT4 和 MM.1S 细胞中进行基于细胞的检测。将 MOLT4 细胞用浓度分别为 0 nM、40 nM、200 nM 和 1 μM 的 TMX-4113 处理 4 小时,然后进行蛋白质印迹分析以检测 PDE6D 和 CK1α 蛋白水平。在 MM.1S 细胞中,评估 40 nM 浓度下 CK1α 的降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
理化性质:分子式 = C12H12N4O2S2,分子量 = 308.38,LogP = 0.9,氢键供体数 = 1,氢键受体数 = 6。外观:灰白色至浅黄色固体粉末。溶解度:DMSO:100 mg/mL (324.28 mM)。储存:粉末 -20℃ 可保存 3 年,4℃ 可保存 2 年;溶剂 -80℃ 可保存 6 个月,-20℃ 可保存 1 个月。运输:室温(运输过程中可稳定数日)。
参考文献

[1]. Development of PDE6D and CK1α Degraders through Chemical Derivatization of FPFT-2216. J Med Chem. 2022 Jan 13;65(1):747-756.

其他信息
TMX-4113(CAS号:2766385-92-4)是一种双靶点蛋白降解剂。它通过募集泛素-蛋白酶体系统降解其靶蛋白PDE6D和CK1α发挥作用。这种作用机制不同于传统的酶抑制,因为它能永久性地去除靶蛋白,而不仅仅是阻断其活性。它是研究PDE6D和CK1α在癌症信号通路中生物学功能的重要化学探针。纯度:≥98%。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H12N4O2S2
分子量
308.379279136658
精确质量
308.04
CAS号
2766385-92-4
PubChem CID
162641721
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
0.9
tPSA
130
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
409
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CSC1=CSC=C1C2=CN(N=N2)C3CCC(=O)NC3=O
InChi Key
YIIUEHDPOPLUBR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H12N4O2S2/c1-19-10-6-20-5-7(10)8-4-16(15-14-8)9-2-3-11(17)13-12(9)18/h4-6,9H,2-3H2,1H3,(H,13,17,18)
化学名
3-[4-(4-methylsulfanylthiophen-3-yl)triazol-1-yl]piperidine-2,6-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (324.28 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2428 mL 16.2138 mL 32.4275 mL
5 mM 0.6486 mL 3.2428 mL 6.4855 mL
10 mM 0.3243 mL 1.6214 mL 3.2428 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们