Zapnometinib (PD0184264; ATR-002)

别名: zapnometinib; 2-(2-chloro-4-iodophenylamino)-3,4-difluorobenzoic acid; ATR-002; Zapnometinib [INN]; PD-0184264; Benzoic acid, 2-[(2-chloro-4-iodophenyl)amino]-3,4-difluoro-; 4RZD8LK83V; 3,4-二氟-2-(2-氯-4-碘苯基氨基)-苯甲酸
目录号: V35103 纯度: ≥98%
Zapnometinib (PD0184264) 是 CI-1040 的生物活性代谢物,是一种 MEK 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 5.7 nM。
Zapnometinib (PD0184264; ATR-002) CAS号: 303175-44-2
产品类别: Influenza Virus
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
Zapnometinib (PD0184264) 是 CI-1040 的生物活性代谢物,是一种 MEK 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 5.7 nM。 Zapnometinib 对流感病毒具有抗病毒和抗菌作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
MEK (IC50 = 5.7 nM)
体外研究 (In Vitro)
在 A549、MDCK 细胞和人 PBMC 中,zapnometinib (0.1 nM-1 μM) 抑制 MEK,IC50 分别为 30.96 nM、357 nM 和 15 nM[1]。在人 PBMC 中,zapnometinib(100 μM;4 小时)可抑制离子霉素 (PMA/I) 引起的 ERK1/2 磷酸化 [1]。 zapnometinib (1-100 μM) 可降低 H3N2 和 IV H1N1pdm09 病毒滴度 [1]。
体内研究 (In Vivo)
Zapnometinib(8.4–75 mg/kg/天;每天口服 3 次)可降低致命 H1N1pdm09 感染后的肺部病毒滴度并提高小鼠的存活率 [1]。 Zapnometinib (150 mg/kg) 静脉内或口服给予小鼠的 AUC 值分别为 860.02 和 1953.68 μg?h/mL [1]。
酶活实验
无细胞激酶活性测定:[1]
用单克隆抗ERK(细胞外信号调节激酶)抗体在TBST(50 mM Tris-HCl,0.9%NaCl,0.05%吐温20)中以1:1000(100μl/孔)的稀释液涂覆96孔微量滴定板过夜。用100μl/孔TBST洗涤(3×5分钟)后,在室温下用100μl/min的1%BSA PBS溶液封闭孔60分钟。在加入激酶反应样品(见下文)之前,再次洗涤板。为了确定抑制剂的IC50值,制备了最终的测试浓度(DMSO中的1μM、500 nM、100 nM、50 nM、10 nM、5 nM、1 nM、0.5 nM和0.1 nM)。活性GST c-Raf1-DD在杆状病毒感染的SF9细胞中表达,而GST-MEK1和His-ERK2在大肠杆菌中表达。通过与谷胱甘肽琼脂糖珠结合纯化GST标记的蛋白质,并在镍螯合柱上纯化His标记的ERK2。将三种纯化的重组激酶以3:2:3的比例在激酶缓冲液(10 mM MgCl2,25 mMβ-甘油磷酸,25 mM HEPES;pH 7.5,5 mM苯甲脒,0.5 mM二硫苏糖醇,1 mM钒酸钠)和DMSO/抑制剂中混合,并在室温下在黑暗中预孵育,然后加入10 mM ATP并进一步孵育30分钟。为了停止激酶反应,在50°C下加入20%SDS溶液10分钟,并用阻断缓冲液(TBST中1%BSA)进一步稀释。接下来,将100μl的每个样品加入到抗ERK涂层的96孔微量滴定板中。将激酶反应样品在室温下在用BSA封闭的抗ERK包被的96孔微量滴定板中孵育60分钟。为了检测磷酸化ERK,将样品在4°C下用抗磷酸ERK(p44/p42)抗体孵育过夜,然后用稀释在TBST缓冲液中的辣根过氧化物酶抗小鼠IgG特异性抗体在室温下孵育60 min。然后,洗涤平板并用ABTS底物溶液孵育30 min。用20%SDS溶液终止反应,然后用ELISA阅读器测量405nm处的光密度。
A549、MDCK细胞和人外周血单个核细胞中的激酶活性测定:[1]
A549和MDCK II细胞在含有10%FBS、100U/mL青霉素、100µl/mL链霉素和1%l-谷氨酰胺的IMDM中培养。接下来,将4×105 A549或MDCK II细胞接种在24孔板中过夜,然后在含有0%FBS的IMDM中饥饿24小时。饥饿后,用20 ng/ml肿瘤坏死因子(TNF)刺激细胞30分钟,然后用溶解在DMSO中的不同浓度的CI-1040或Zapnometinib(PD0184264;ATR-002) 5μM至3 nM;Zapnometinib(PD0184264;ATR-002):25μM至12 nM。为了确定CI-1040和Zapnometinib(PD0184264;ATR-002)对A549细胞的IC50值,在两倍稀释步骤中制备了12个测试浓度(CI-1040:3.07μM至1.5 nM;Zapnometinib(PD0184274;ATR-2002):30.72μM至15 nM)。孵育时间结束后,用冰冷的PBS洗涤细胞两次,立即停止治疗。细胞在冰冷的改良RIPA缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.4;1%NP-40;0.25%脱氧胆酸钠;150 mM NaCl)中在冰上裂解,补充有完全蛋白酶抑制剂混合物和磷酸酶抑制剂混合物。裂解物被短暂超声处理,并在4°C下以18000×g离心5分钟。通过Ficoll密度梯度分离法从新鲜血液中分离出人外周血单核细胞(PBMCs),然后在含有10%自体血清、100 U/mL青霉素、100µg/mL链霉素和1%L-谷氨酰胺的RPMI 1640培养基中培养。然后,将5x106的培养的PBMC接种在24孔板中,用100 ng/mL的佛波醇12-肉豆蔻酸13-乙酸酯(PMA)和1µg/mL的离子霉素(I)刺激4小时。为了确定CI-1040和Zapnometinib/扎诺替尼(PD0184264;ATR-002)对人PBMC的IC50值,制备了12个两倍稀释步骤的测试浓度(CI-1040:200 nM至0.097 nM;Zapnometinib(PD0184244;ATR-2002):780 nM至0.38 nM)。停止治疗,按照A549/MDCK细胞的描述继续手术。所有样本均留作蛋白质印迹分析。
细胞实验
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: 人 PBMC
测试浓度: 100 μM
孵育时间: 4 h
实验结果:抑制离子霉素(PMA/I)增加的pERK1/2。
后代病毒抑制试验[1]
在37°C和5%CO2下,用上述IAV菌株在磷酸盐缓冲盐水(PBS)中制备的相应MOI接种A549细胞,该PBS补充了0.2%(w/v)牛血清白蛋白、1 mM MgCl2、0.5 mM CaCl2、100 U/mL青霉素、100μg/mL链霉素,持续45分钟。移除接种物,用PBS冲洗细胞,并补充1 mL IV感染培养基(Dulbecco's Modified Eagle Medium;DMEM补充了0.2%BSA、1 mM MgCl2、0.5 mM CaCl2、100 U/mL青霉素、100μg/mL链霉素和2μg/mL TPCK处理的胰蛋白酶,含有不同浓度的CI-1040或ATR-002(100μM、50μM、10μM、5μM、1μM、0.5μM和0.1μM,DMSO终浓度为1%,在37°C、5%CO2中24小时)。
细胞活力测定(WST测定)[1]
将A549细胞、MDCK细胞和人PBMC接种在96孔平底组织板中并如第2.2节所述生长过夜。此后,用不同浓度的ATR-002(100μM、50μM、10μM、5μM、1μM、0.5μM和0.1μM)处理细胞,ATR-002溶解在100μl IMDM中,IMDM补充了5%FBS,DMSO终浓度为1%(v/v)。将细胞在37°C和5%CO2中培养24小时。此后,将10μl WST-1试剂加入培养基中并孵育4小时。之后,在405 nm的ELISA平板读数器上定量形成的甲赞染料。
动物实验
动物/疾病模型:雌性C57BL/6小鼠(8周龄;21-24克)感染H1N1pdm09[1]
剂量:8.4、25、75毫克/公斤/天(2.8、8.4、25毫克/公斤)
给药途径:口服,每日三次
实验结果:75毫克/公斤/天或25毫克/公斤/天的剂量均显著降低了病毒滴度。
用于药代动力学分析的化合物制备[1]
静脉给药时,将30.65毫克CI-1040溶解于0.075毫升DMSO中,并用0.225毫升Cremophor EL和2.7毫升PBS进一步稀释。接下来,将34.88 mg ATR-002溶解于0.075 mL DMSO中,并用0.225 mL Cremophor EL和2.7 mL PBS进一步稀释。对于口服给药,将202.5 mg CI-1040溶解于0.5 mL DMSO、1.5 mL Cremophor EL和8.0 mL PBS中。因此,将 81.0 mg 的 Zapnometinib (PD0184264; ATR-002) 溶解于 0.2 mL DMSO、0.6 mL Cremophor EL 和 3.2 mL PBS 中。
制备化合物以研究小鼠肺部病毒滴度的降低[1]
对于 25 mg Zapnometinib (PD0184264; ATR-002)/kg 体重的口服给药,将 10 mg ATR-002 溶解于 50 μl DMSO 中,并用 0.15 mL Cremophor EL 和 0.8 mL PBS 进一步稀释。对于 8.4 mg/kg 和 2.8 mg/kg 的应用剂量,将 3.36 mg 或 1.12 mg ATR-002 溶解于 50 μl DMSO 中,并用 0.15 mL Cremophor EL 和 0.8 mL PBS 进一步稀释。此外,将 202.5 mg CI-1040 溶解于 0.5 mL DMSO、0.15 mL Cremophor EL 和 0.8 mL PBS 中。
参考文献

[1]. Antiviral efficacy against influenza virus and pharmacokinetic analysis of a novel MEK-inhibitor, ATR-002, in cell culture and in the mouse model. Antiviral Res. 2020 Jun;178:104806.

[2]. Improved in vitro Efficacy of Baloxavir Marboxil Against Influenza A Virus Infection by Combination Treatment With the MEK Inhibitor ATR-002. Front Microbiol. 2021 Feb 12;12:611958.

[3]. Metabolic conversion of CI-1040 turns a cellular MEK-inhibitor into an antibacterial compound. Sci Rep. 2018 Jun 14;8(1):9114.

其他信息
扎普诺替尼是一种口服生物利用度高的丝裂原活化蛋白激酶激酶(MAP2K;MAPK/ERK激酶;MEK)小分子抑制剂,具有潜在的抗病毒和抗炎活性。口服后,扎普诺替尼选择性地结合并抑制MEK的活性。这可能阻止病毒基因组蛋白复合物从细胞核输出到细胞质,从而抑制新病毒颗粒的形成和多种RNA病毒(包括流感病毒、汉坦病毒、呼吸道合胞病毒(RSV)和严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2))的复制。此外,抑制MEK活性还可能降低基因表达,并抑制促炎细胞因子和趋化因子的产生,包括肿瘤坏死因子-α (TNF-α)、白细胞介素 (IL)-1β、IL-8、CXC基序趋化因子10(干扰素γ诱导蛋白10;IP-10)、CC基序趋化因子2(单核细胞趋化蛋白-1;MCP-1)和CC基序趋化因子3(巨噬细胞炎症蛋白1-α;MIP-1α),从而减轻炎症。MEK是一种双特异性苏氨酸/酪氨酸激酶家族成员,在RAS/RAF/MEK/ERK信号通路的激活中发挥关键作用。许多RNA病毒依赖于该通路在人体细胞内进行复制。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H7CLF2INO2
分子量
409.55
精确质量
408.918
元素分析
C, 38.13; H, 1.72; Cl, 8.66; F, 9.28; I, 30.99; N, 3.42; O, 7.81
CAS号
303175-44-2
PubChem CID
10112191
外观&性状
Off-white to gray solid powder
LogP
4.737
tPSA
49.33
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
363
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
XCNBGWKQXRQKSA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H7ClF2INO2/c14-8-5-6(17)1-4-10(8)18-12-7(13(19)20)2-3-9(15)11(12)16/h1-5,18H,(H,19,20)
化学名
2-(2-chloro-4-iodoanilino)-3,4-difluorobenzoic acid
别名
zapnometinib; 2-(2-chloro-4-iodophenylamino)-3,4-difluorobenzoic acid; ATR-002; Zapnometinib [INN]; PD-0184264; Benzoic acid, 2-[(2-chloro-4-iodophenyl)amino]-3,4-difluoro-; 4RZD8LK83V;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 62.5 mg/mL (152.61 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4417 mL 12.2085 mL 24.4170 mL
5 mM 0.4883 mL 2.4417 mL 4.8834 mL
10 mM 0.2442 mL 1.2209 mL 2.4417 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Safety, Tolerability, Pharmacokinetics, Pharmacodynamics, Food Effect and DDI of Ascending Doses of the MEK Inhibitor Zapnometinib
CTID: NCT05555823
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2023-08-01
Clinical Trial to Evaluate the Safety and Efficacy of ATR-002 in Adult Hospitalized Patients With COVID-19
CTID: NCT04776044
Phase: Phase 2
Status: Terminated
Date: 2022-09-22
RESPIRE - A Randomized, Double-Blind, Placebo-Controlled, Multi-Centre Clinical Trial to Evaluate the Safety and Efficacy of ATR-002 in Adult Hospitalized Patients with COVID-19
EudraCT: 2020-004206-59
Phase: Phase 2
Status: Prematurely Ended
Date: 2021-01-11
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