Zapnometinib (PD0184264; ATR-002)

别名: zapnometinib; 2-(2-chloro-4-iodophenylamino)-3,4-difluorobenzoic acid; ATR-002; Zapnometinib [INN]; PD-0184264; Benzoic acid, 2-[(2-chloro-4-iodophenyl)amino]-3,4-difluoro-; 4RZD8LK83V; 3,4-二氟-2-(2-氯-4-碘苯基氨基)-苯甲酸
目录号: V35103 纯度: ≥98%
Zapnometinib (PD0184264) 是 CI-1040 的生物活性代谢物,是一种 MEK 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 5.7 nM。
Zapnometinib (PD0184264; ATR-002) CAS号: 303175-44-2
产品类别: Influenza Virus
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
Zapnometinib (PD0184264) 是 CI-1040 的生物活性代谢物,是一种 MEK 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 5.7 nM。 Zapnometinib 对流感病毒具有抗病毒和抗菌作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
MEK (IC50 = 5.7 nM)
体外研究 (In Vitro)
在 A549、MDCK 细胞和人 PBMC 中,zapnometinib (0.1 nM-1 μM) 抑制 MEK,IC50 分别为 30.96 nM、357 nM 和 15 nM[1]。在人 PBMC 中,zapnometinib(100 μM;4 小时)可抑制离子霉素 (PMA/I) 引起的 ERK1/2 磷酸化 [1]。 zapnometinib (1-100 μM) 可降低 H3N2 和 IV H1N1pdm09 病毒滴度 [1]。
体内研究 (In Vivo)
Zapnometinib(8.4–75 mg/kg/天;每天口服 3 次)可降低致命 H1N1pdm09 感染后的肺部病毒滴度并提高小鼠的存活率 [1]。 Zapnometinib (150 mg/kg) 静脉内或口服给予小鼠的 AUC 值分别为 860.02 和 1953.68 μg?h/mL [1]。
酶活实验
无细胞激酶活性测定:[1]
用单克隆抗ERK(细胞外信号调节激酶)抗体在TBST(50 mM Tris-HCl,0.9%NaCl,0.05%吐温20)中以1:1000(100μl/孔)的稀释液涂覆96孔微量滴定板过夜。用100μl/孔TBST洗涤(3×5分钟)后,在室温下用100μl/min的1%BSA PBS溶液封闭孔60分钟。在加入激酶反应样品(见下文)之前,再次洗涤板。为了确定抑制剂的IC50值,制备了最终的测试浓度(DMSO中的1μM、500 nM、100 nM、50 nM、10 nM、5 nM、1 nM、0.5 nM和0.1 nM)。活性GST c-Raf1-DD在杆状病毒感染的SF9细胞中表达,而GST-MEK1和His-ERK2在大肠杆菌中表达。通过与谷胱甘肽琼脂糖珠结合纯化GST标记的蛋白质,并在镍螯合柱上纯化His标记的ERK2。将三种纯化的重组激酶以3:2:3的比例在激酶缓冲液(10 mM MgCl2,25 mMβ-甘油磷酸,25 mM HEPES;pH 7.5,5 mM苯甲脒,0.5 mM二硫苏糖醇,1 mM钒酸钠)和DMSO/抑制剂中混合,并在室温下在黑暗中预孵育,然后加入10 mM ATP并进一步孵育30分钟。为了停止激酶反应,在50°C下加入20%SDS溶液10分钟,并用阻断缓冲液(TBST中1%BSA)进一步稀释。接下来,将100μl的每个样品加入到抗ERK涂层的96孔微量滴定板中。将激酶反应样品在室温下在用BSA封闭的抗ERK包被的96孔微量滴定板中孵育60分钟。为了检测磷酸化ERK,将样品在4°C下用抗磷酸ERK(p44/p42)抗体孵育过夜,然后用稀释在TBST缓冲液中的辣根过氧化物酶抗小鼠IgG特异性抗体在室温下孵育60 min。然后,洗涤平板并用ABTS底物溶液孵育30 min。用20%SDS溶液终止反应,然后用ELISA阅读器测量405nm处的光密度。
A549、MDCK细胞和人外周血单个核细胞中的激酶活性测定:[1]
A549和MDCK II细胞在含有10%FBS、100U/mL青霉素、100µl/mL链霉素和1%l-谷氨酰胺的IMDM中培养。接下来,将4×105 A549或MDCK II细胞接种在24孔板中过夜,然后在含有0%FBS的IMDM中饥饿24小时。饥饿后,用20 ng/ml肿瘤坏死因子(TNF)刺激细胞30分钟,然后用溶解在DMSO中的不同浓度的CI-1040或Zapnometinib(PD0184264;ATR-002) 5μM至3 nM;Zapnometinib(PD0184264;ATR-002):25μM至12 nM。为了确定CI-1040和Zapnometinib(PD0184264;ATR-002)对A549细胞的IC50值,在两倍稀释步骤中制备了12个测试浓度(CI-1040:3.07μM至1.5 nM;Zapnometinib(PD0184274;ATR-2002):30.72μM至15 nM)。孵育时间结束后,用冰冷的PBS洗涤细胞两次,立即停止治疗。细胞在冰冷的改良RIPA缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.4;1%NP-40;0.25%脱氧胆酸钠;150 mM NaCl)中在冰上裂解,补充有完全蛋白酶抑制剂混合物和磷酸酶抑制剂混合物。裂解物被短暂超声处理,并在4°C下以18000×g离心5分钟。通过Ficoll密度梯度分离法从新鲜血液中分离出人外周血单核细胞(PBMCs),然后在含有10%自体血清、100 U/mL青霉素、100µg/mL链霉素和1%L-谷氨酰胺的RPMI 1640培养基中培养。然后,将5x106的培养的PBMC接种在24孔板中,用100 ng/mL的佛波醇12-肉豆蔻酸13-乙酸酯(PMA)和1µg/mL的离子霉素(I)刺激4小时。为了确定CI-1040和Zapnometinib/扎诺替尼(PD0184264;ATR-002)对人PBMC的IC50值,制备了12个两倍稀释步骤的测试浓度(CI-1040:200 nM至0.097 nM;Zapnometinib(PD0184244;ATR-2002):780 nM至0.38 nM)。停止治疗,按照A549/MDCK细胞的描述继续手术。所有样本均留作蛋白质印迹分析。
细胞实验
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: 人 PBMC
测试浓度: 100 μM
孵育时间: 4 h
实验结果:抑制离子霉素(PMA/I)增加的pERK1/2。
后代病毒抑制试验[1]
在37°C和5%CO2下,用上述IAV菌株在磷酸盐缓冲盐水(PBS)中制备的相应MOI接种A549细胞,该PBS补充了0.2%(w/v)牛血清白蛋白、1 mM MgCl2、0.5 mM CaCl2、100 U/mL青霉素、100μg/mL链霉素,持续45分钟。移除接种物,用PBS冲洗细胞,并补充1 mL IV感染培养基(Dulbecco's Modified Eagle Medium;DMEM补充了0.2%BSA、1 mM MgCl2、0.5 mM CaCl2、100 U/mL青霉素、100μg/mL链霉素和2μg/mL TPCK处理的胰蛋白酶,含有不同浓度的CI-1040或ATR-002(100μM、50μM、10μM、5μM、1μM、0.5μM和0.1μM,DMSO终浓度为1%,在37°C、5%CO2中24小时)。
细胞活力测定(WST测定)[1]
将A549细胞、MDCK细胞和人PBMC接种在96孔平底组织板中并如第2.2节所述生长过夜。此后,用不同浓度的ATR-002(100μM、50μM、10μM、5μM、1μM、0.5μM和0.1μM)处理细胞,ATR-002溶解在100μl IMDM中,IMDM补充了5%FBS,DMSO终浓度为1%(v/v)。将细胞在37°C和5%CO2中培养24小时。此后,将10μl WST-1试剂加入培养基中并孵育4小时。之后,在405 nm的ELISA平板读数器上定量形成的甲赞染料。
动物实验
Animal/Disease Models: Female C57BL/6 mice (8 weeks; 21-24 g) were infected with H1N1pdm09[1]
Doses: 8.4, 25, 75 mg/ kg/day (2.8, 8.4, 25 mg/kg)
Route of Administration: Po three times a day
Experimental Results: Dramatically diminished the virus titer at the dose of either 75 mg/kg/day or 25 mg/kg/day.
Preparation of compounds for pharmacokinetic analysis[1]
For i.v. administration, 30.65 mg CI-1040 was dissolved in 0.075 mL DMSO and further diluted with 0.225 mL Cremophor EL and 2.7 mL PBS. Next, 34.88 mg ATR-002 was dissolved in 0.075 mL DMSO and further diluted with 0.225 mL Cremophor EL and 2.7 mL PBS. For oral administration 202.5 mg CI-1040 was dissolved in 0.5 mL DMSO, 1.5 mL Cremophor EL, and 8.0 mL PBS. Accordingly, 81.0 mg Zapnometinib (PD0184264; ATR-002)  was dissolved in 0.2 mL DMSO, 0.6 mL Cremophor EL, and 3.2 mL PBS.
Preparation of compounds to investigate virus titer reduction in the lungs of mice[1]
For oral application of 25 mg Zapnometinib (PD0184264; ATR-002) /kg bodyweight, 10 mg of ATR-002 was dissolved in 50 μl DMSO and further diluted with 0.15 mL Cremophor EL and 0.8 mL PBS. For application of 8.4 mg/kg and 2.8 mg/kg, 3.36 mg or 1.12 mg ATR-002 was dissolved in 50 μl DMSO and further diluted with 0.15 mL Cremophor EL and 0.8 mL PBS. Additionally, 202.5 mg CI-1040 was dissolved in 0.5 mL DMSO, 0.15 mL Cremophor EL, and 0.8 mL PBS.
参考文献

[1]. Antiviral efficacy against influenza virus and pharmacokinetic analysis of a novel MEK-inhibitor, ATR-002, in cell culture and in the mouse model. Antiviral Res. 2020 Jun;178:104806.

[2]. Improved in vitro Efficacy of Baloxavir Marboxil Against Influenza A Virus Infection by Combination Treatment With the MEK Inhibitor ATR-002. Front Microbiol. 2021 Feb 12;12:611958.

[3]. Metabolic conversion of CI-1040 turns a cellular MEK-inhibitor into an antibacterial compound. Sci Rep. 2018 Jun 14;8(1):9114.

其他信息
Zapnometinib is an orally bioavailable, small molecule inhibitor of mitogen-activated protein kinase kinase (MAP2K; MAPK/ERK kinase; MEK), with potential anti-viral and anti-inflammatory activities. Upon oral administration, zapnometinib selectively binds to and inhibits the activity of MEK. This may prevent the export of the viral genome protein complexes from the nucleus to the cytoplasm, thereby inhibiting the formation of new viral particles and the replication of various RNA viruses, including influenza virus, hantavirus, respiratory syncytial virus (RSV) and severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2). In addition, the inhibition of the activity of MEK may also decrease gene expression and inhibit the production of proinflammatory cytokines and chemokines, including tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha), interleukin (IL)-1-beta, IL-8, C-X-C motif chemokine 10 (interferon gamma-induced protein 10; IP-10), C-C motif chemokine 2 (monocyte chemoattractant protein-1; MCP-1) and C-C motif chemokine 3 (macrophage inflammatory protein 1-alpha; MIP-1a), thereby reducing inflammation. MEK, a dual-specificity threonine/tyrosine kinase family, plays a key role in the activation of the RAS/RAF/MEK/ERK signaling pathway. Many RNA viruses rely on this pathway inside human cells to replicate.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H7CLF2INO2
分子量
409.55
精确质量
408.918
元素分析
C, 38.13; H, 1.72; Cl, 8.66; F, 9.28; I, 30.99; N, 3.42; O, 7.81
CAS号
303175-44-2
PubChem CID
10112191
外观&性状
Off-white to gray solid powder
LogP
4.737
tPSA
49.33
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
363
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
XCNBGWKQXRQKSA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H7ClF2INO2/c14-8-5-6(17)1-4-10(8)18-12-7(13(19)20)2-3-9(15)11(12)16/h1-5,18H,(H,19,20)
化学名
2-(2-chloro-4-iodoanilino)-3,4-difluorobenzoic acid
别名
zapnometinib; 2-(2-chloro-4-iodophenylamino)-3,4-difluorobenzoic acid; ATR-002; Zapnometinib [INN]; PD-0184264; Benzoic acid, 2-[(2-chloro-4-iodophenyl)amino]-3,4-difluoro-; 4RZD8LK83V;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 62.5 mg/mL (152.61 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4417 mL 12.2085 mL 24.4170 mL
5 mM 0.4883 mL 2.4417 mL 4.8834 mL
10 mM 0.2442 mL 1.2209 mL 2.4417 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Safety, Tolerability, Pharmacokinetics, Pharmacodynamics, Food Effect and DDI of Ascending Doses of the MEK Inhibitor Zapnometinib
CTID: NCT05555823
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2023-08-01
Clinical Trial to Evaluate the Safety and Efficacy of ATR-002 in Adult Hospitalized Patients With COVID-19
CTID: NCT04776044
Phase: Phase 2
Status: Terminated
Date: 2022-09-22
RESPIRE - A Randomized, Double-Blind, Placebo-Controlled, Multi-Centre Clinical Trial to Evaluate the Safety and Efficacy of ATR-002 in Adult Hospitalized Patients with COVID-19
EudraCT: 2020-004206-59
Phase: Phase 2
Status: Prematurely Ended
Date: 2021-01-11
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