A 21960

别名: A21960; A 21960; A-21960 2-氯乙酰乙酸乙酯; 乙基2-氯乙酸乙酯; 2-氯-3-氧丁酸乙酯; Α-氯乙酰乙酸乙酯; 2-氯代乙酰乙酸乙酯; Ethyl 2-Chloroacetoacetate 2-氯乙酰乙酸乙酯
目录号: V3071 纯度: ≥98%
21960能够抑制解离酶和两个直接重复的res位点之间的突触形成,并随后阻断位点特异性重组反应。
A 21960 CAS号: 609-15-4
产品类别: Others 8
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纯度: ≥98%

产品描述
A21960能够抑制重组酶与两个直接重复的res位点之间的突触形成,进而阻断位点特异性重组反应。Tn3编码的重组酶蛋白促进两个直接重复的res重组位点之间的位点特异性重组反应。A21960不影响重组酶与res位点的结合以及DNA的弯曲,但抑制重组酶与两个直接重复的res位点之间的突触形成。


A21960是Tn3重组酶介导的位点特异性重组反应的抑制剂。它属于一类不影响重组酶与res位点结合或DNA弯曲,但抑制重组酶与两个直接重复的res位点之间突触形成的抑制剂。[1]
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
A21960在体外抑制了resolvase介导的位点特异性重组,抑制浓度约为1 mg/ml时达到50%,5 mg/ml时完全抑制,该结果通过模型整合质粒πres^2和纯化的resolvase蛋白进行评估。[1]
A21960不抑制EcoRI切割,表明其对resolvase具有特异性。[1]
在硝酸纤维素滤膜结合实验和DNase I足迹实验中,A21960即使在完全抑制重组的浓度下,也不阻断resolvase与res位点的结合。[1]
A21960抑制了resolvase-res突触复合物(α型结构)的形成,该抑制作用通过戊二醛交联和BamHI切割检测。 [1]在拓扑异构酶I松弛实验中,A21960导致解离酶保护的连接数差(ΔLk)降低:在1 mg/ml和2 mg/ml浓度下,ΔLk为-2(相比之下,在没有抑制剂的情况下为-3),在3 mg/ml浓度下,ΔLk为-1,表明突触形成被阻断,但解离酶仍与未突触化的res位点结合并发生DNA缠绕,从而保护了一个负超螺旋。[1]
酶活实验
标准的重组酶重组反应在37°C下进行15分钟,反应缓冲液包含150 mM NaCl、20 mM Tris-HCl (pH 7.5)、20 mM MgCl2、1 mM 二硫苏糖醇、1% DMSO、0.4 μg πres^2 质粒DNA和2 μg重组酶。抑制剂A21960在加入DNA前于4°C下与重组酶预孵育1分钟。反应终止后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。[1] 戊二醛交联实验用于检测突触复合物:在含有150 mM NaCl、20 mM三乙醇胺-HCl (pH 7.5)和5 mM EDTA的缓冲液中,于15°C下使重组酶与res^2 DNA结合5分钟。将新鲜稀释的 8% 戊二醛溶液加入至终浓度为 0.2%,并在 15°C 下孵育 5 分钟。复合物经 Sepharose CL-4B 微柱过滤纯化,然后在 37°C 下用 BamHI 酶切 10 分钟。产物经 0.8% 琼脂糖凝胶电泳分离。[1]
拓扑异构酶 I 松弛实验:将戊二醛固定的突触复合物与小麦胚芽拓扑异构酶 I 在 15°C 下处理 15 分钟。加入 SDS 至终体积为 0.2% 以终止反应。样品在含有 1.2 μg/ml 氯喹的 TBE 缓冲液中进行 1.2% 琼脂糖凝胶电泳分离。[1]
动物实验


参考文献
1989 Mar 20;206(2):295-304.
其他信息
A21960是雅培实验室慷慨赠送的。[1] 它的作用机制是阻断res位点之间的突触形成,而不影响resolvase结合或DNA弯曲。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C6H9CLO3
分子量
164.5869
精确质量
164.024
CAS号
609-15-4
相关CAS号
609-15-4
PubChem CID
11858
外观&性状
Colorless to light yellow liquid(Density:1.172 g/cm³)
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
225.5±0.0 °C at 760 mmHg
熔点
-80 °C
闪点
50.0±0.0 °C
蒸汽压
0.1±0.4 mmHg at 25°C
折射率
1.434
LogP
1.66
tPSA
43.37
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
10
分子复杂度/Complexity
144
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC([H])(C(C([H])([H])[H])=O)C(=O)OC([H])([H])C([H])([H])[H]
InChi Key
RDULEYWUGKOCMR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C6H9ClO3/c1-3-10-6(9)5(7)4(2)8/h5H,3H2,1-2H3
化学名
ethyl 2-chloro-3-oxobutanoate
别名
A21960; A 21960; A-21960
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:
Water:
Ethanol:
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.0757 mL 30.3785 mL 60.7570 mL
5 mM 1.2151 mL 6.0757 mL 12.1514 mL
10 mM 0.6076 mL 3.0379 mL 6.0757 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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