A-395 hydrochloride

别名: A395 A 395A-395 hydrochlorideA-395 A-395 HCl
目录号: V9849 纯度: ≥98%
A-395 是多梳抑制复合物 2 (PRC2) 蛋白质-蛋白质相互作用的拮抗剂,抑制三聚体 PRC2 复合物 (EZH2-EED-SUZ12),IC50 为 18 nM。
A-395 hydrochloride CAS号: 2089148-72-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
A-395 是一种多梳抑制复合物 2 (PRC2) 蛋白-蛋白相互作用的拮抗剂,能以 18 nM 的 IC50 值抑制三聚体 PRC2 复合物 (EZH2-EED-SUZ12)。
A-395 盐酸盐 (CAS# 2089148-72-9) 是一种高效且选择性的化学探针,可用于检测多梳蛋白 EED(胚胎外胚层发育相关蛋白)。该化合物的分子式为 C₂₆H₃₅FN₄O₂S·xHCl,分子量为 486.65(以游离碱计),是多梳抑制复合物 2 (PRC2) 的重要组成部分。它通过组蛋白 H3K27 的甲基化参与转录抑制。A-395 盐酸盐是一种高纯度 (≥98%) 的研究化合物,用于表观遗传学研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of A-395 hydrochloride is the polycomb protein EED, an essential component of the Polycomb repressive complex 2 (PRC2). PRC2 is responsible for the methylation of histone H3K27, a mark associated with transcriptional repression. A-395 binds to EED in vitro with a Ki value of 0.4 nM, inhibiting the allosteric stimulation of PRC2 catalytic activity. It inhibits the PRC2 complex with an IC₅₀ value of 34 nM for methylation of H3K27.
体外研究 (In Vitro)
多梳抑制复合物2 (PRC2) 包含关键成员胚胎外胚层发育 (EED) 蛋白。A-395 抑制 EED 与 H3K27me3 的结合。A-395 结合于 EED 的 H3K27me3 结合口袋,抑制 PRC2 催化活性的变构刺激。A-395 的 IC50 值为 7 nM,它与 EED 竞争结合 H3K27me3 肽段。A-395 选择性且高效地降低细胞内 H3K27 的甲基化水平,从而影响 PRC2 的活性,而其化学结构类似的化合物 A-395N 则无此作用。A-395 处理可抑制 H3K27me2 和 H3K27me3 的表达,其 IC50 值分别为 390 nM 和 90 nM。此外,对SAM竞争性EZH2抑制剂敏感的人类肿瘤细胞系在接受A-395治疗后无法增殖[1]。体外实验表明,盐酸A-395对PRC2复合物具有强效且选择性的抑制作用。它与EED的结合Ki值为0.4 nM,并以34 nM的IC₅₀值抑制H3K27的甲基化。该化合物对其他组蛋白甲基转移酶和非表观遗传靶点的选择性超过100倍。在细胞实验中,例如在RD横纹肌样瘤细胞系中,A-395以90 nM的IC₅₀值抑制PRC2复合物,从而抑制H3K27me3的形成。
体内研究 (In Vivo)
多梳抑制复合物2 (PRC2) 包含关键成员胚胎外胚层发育 (EED) 蛋白。A-395 抑制 EED 与 H3K27me3 的结合。A-395 结合于 EED 的 H3K27me3 结合口袋,抑制 PRC2 催化活性的变构刺激。A-395 的 IC50 值为 7 nM,它与 EED 竞争结合 H3K27me3 肽段。A-395 选择性且高效地降低细胞内 H3K27 的甲基化水平,从而影响 PRC2 的活性,而其化学结构类似的化合物 A-395N 则无此作用。A-395 处理可抑制 H3K27me2 和 H3K27me3 的表达,其 IC50 值分别为 390 nM 和 90 nM。此外,对SAM竞争性EZH2抑制剂敏感的人类肿瘤细胞系在接受A-395治疗后无法增殖[1]。
在体内,A-395盐酸盐已被用作化学探针,用于研究PRC2在各种生物过程中的作用。它对EED的强效选择性抑制使其成为研究PRC2在转录抑制中的功能及其与癌症等疾病的关联的重要工具。该化合物的体内疗效和药代动力学特性已在临床前研究中得到表征。
酶活实验
体外结合研究测定了A-395盐酸盐与EED的亲和力。采用表面等离子共振(SPR)或荧光偏振等技术测定了解离常数(Kd)或抑制常数(Ki)。利用重组PRC2复合物和组蛋白底物进行酶活性测定,评估该化合物抑制PRC2介导的H3K27甲基化的能力。这些测定证实了其作为高效选择性EED抑制剂的作用机制。
细胞实验
体外细胞实验评估了A-395盐酸盐对细胞内PRC2活性的影响。用该化合物处理细胞后,通过Western blot或免疫荧光法检测H3K27me3的水平。该化合物对细胞增殖和基因表达的影响也可进行评估。在RD横纹肌样瘤细胞中,A-395抑制H3K27me3的形成,IC₅₀值为90 nM。
动物实验
为评估A-395盐酸盐的药理作用,需进行体内动物研究。该化合物通常通过腹腔注射或口服给药。药效学研究评估其对靶组织中H3K27me3的抑制作用。疗效研究可在PRC2参与的疾病模型中进行,例如癌症。药代动力学研究测定该化合物的半衰期和生物利用度。
药代性质 (ADME/PK)
临床前研究已对A-395盐酸盐的药代动力学特性进行了表征。该化合物溶于水,溶解度为10 mg/mL,应在2-8°C干燥环境下保存。其分子量为486.65(以游离碱计)。本品为白色至浅棕色粉末,供研究使用。有关其半衰期、Cmax和生物利用度的更多详细信息,请参阅相关研究文献。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
A-395盐酸盐的毒性已在临床前研究中得到评估。它被归类为危险物质,危险说明包括H301(吞咽有毒)、H315(引起皮肤刺激)和H319(引起严重眼刺激)。该化合物仅供研究使用,不得用于人类食用。处理危险化学品时应遵循标准安全预防措施。
参考文献

[1]. The EED protein-protein interaction inhibitor A-395 inactivates the PRC2 complex. Nat Chem Biol. 2017 Apr;13(4):389-395.

其他信息
补充信息:A-395 盐酸盐是一种高效且选择性的 EED 化学探针,由与结构基因组学联盟 (SGC) 合作开发。它是一种表观遗传学研究工具。该化合物以高纯度 (≥98%) 产品形式提供。A-395N 是活性对映体的阴性对照。本产品仅供研究使用,未经批准用于临床或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H38CL3FN4O2S
分子量
596.02792596817
精确质量
486.246
CAS号
2089148-72-9
相关CAS号
2138326-06-2 (R-isomer);2089148-72-9;2089148-71-8;2138319-85-2 (S-isomer)
PubChem CID
123132213
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
3.1
tPSA
55.5
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
789
定义原子立体中心数目
2
SMILES
Cl.Cl.Cl.S(C)(N1CCN(CC1)C1C=CC(=CC=1)[C@H]1CN(C2C3C(=CC=CC=3CC2)F)C[C@@H]1N(C)C)(=O)=O
InChi Key
REVJNSVNICWODC-KIDMSAQOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H35FN4O2S/c1-28(2)25-18-30(24-12-9-20-5-4-6-23(27)26(20)24)17-22(25)19-7-10-21(11-8-19)29-13-15-31(16-14-29)34(3,32)33/h4-8,10-11,22,24-25H,9,12-18H2,1-3H3/t22-,24?,25+/m1/s1
化学名
(3R,4S)-1-(7-fluoro-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N,N-dimethyl-4-(4-(4-(methylsulfonyl)piperazin-1-yl)phenyl)pyrrolidin-3-amine trihydrochloride
别名
A395 A 395A-395 hydrochlorideA-395 A-395 HCl
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~205.49 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (1.71 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 8.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (1.71 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 8.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (1.71 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 8.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6778 mL 8.3888 mL 16.7777 mL
5 mM 0.3356 mL 1.6778 mL 3.3555 mL
10 mM 0.1678 mL 0.8389 mL 1.6778 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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