ABL127

别名: 4-OXO-3,3-DIPHENYL-[1,2]DIAZETIDINE-1,2-DICARBOXYLIC ACID DIMETHYL ESTER
目录号: V9949 纯度: ≥98%
ABL127 是一种选择性共价蛋白甲基酯酶 1 (PME-1) 抑制剂(拮抗剂),在 HEK293T 和 MDA-MB-231 细胞中的 IC50 分别为 6.4 和 4.2 nM。
ABL127 CAS号: 1073529-41-5
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
ABL127 是一种选择性共价蛋白甲基酯酶 1 (PME-1) 抑制剂(拮抗剂),在 HEK293T 和 MDA-MB-231 细胞中的 IC50 分别为 6.4 和 4.2 nM。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
在该实验中,检查了三种已知的 PME-1 抑制剂,发现了 100 μM ABL127 的热位移。当使用 25 或 50 μM ABL127 时,蛋白质解链温度也会发生变化。与使用 shRNA 去除 PME-1 类似,我们发现用 ABL127 和 AMZ-30 处理 Ishikawa 细胞会显着降低细胞生长。此外,ABL127 或 AMZ-30 治疗对 ECC-1 细胞的细胞侵袭具有剂量依赖性影响。用 ABL127 处理的 EC 细胞中蛋白磷酸酶 2A (PP2A) 活性显着增加至约 45%,但用 AMZ-30 处理导致 PP2A 活性仅略微增加至 10% 左右 [1]。
体内研究 (In Vivo)
这些试点研究无法评估肿瘤负荷的显着减少[1]。根据基于凝胶的研究,大脑 PME-1 被 ABL127 灭活,但重叠的丝氨酸水解酶活性阻碍了灭活程度的准确测量 [2]。
参考文献

[1]. Inhibition of protein methylesterase 1 decreased cancerous phenotypes in endometrial adenocarcinoma cell lines and xenograft tumor models. Tumour Biol. 2016 Sep;37(9):11835-11842.

[2]. Academic cross-fertilization by public screening yields a remarkable class of protein phosphatase methylesterase-1 inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Apr 26;108(17):6811-6.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H20N2O5
分子量
332.351104736328
精确质量
332.137
CAS号
1073529-41-5
PubChem CID
24856225
外观&性状
Colorless to off-white oil
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
422.8±48.0 °C at 760 mmHg
闪点
209.5±29.6 °C
蒸汽压
0.0±1.0 mmHg at 25°C
折射率
1.586
LogP
2.78
tPSA
76.2
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
525
定义原子立体中心数目
1
SMILES
N1(C(OC)=O)C(=O)[C@@](C2CCCC2)(C2=CC=CC=C2)N1C(OC)=O
InChi Key
ZRHWCAFAIHTQKD-KRWDZBQOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H20N2O5/c1-23-15(21)18-14(20)17(13-10-6-7-11-13,19(18)16(22)24-2)12-8-4-3-5-9-12/h3-5,8-9,13H,6-7,10-11H2,1-2H3/t17-/m0/s1
化学名
dimethyl (3R)-3-cyclopentyl-4-oxo-3-phenyldiazetidine-1,2-dicarboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~300.89 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (7.52 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0089 mL 15.0444 mL 30.0888 mL
5 mM 0.6018 mL 3.0089 mL 6.0178 mL
10 mM 0.3009 mL 1.5044 mL 3.0089 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Discovery of selective ABL inhibitors of PME-1. (A) Four ABLs (ABL127, ABL103, ABL105, and ABL107) identified as active in the MLPCN screen. (B) Chemistry space coordinates for compounds (colored red in high occupancy cells; colored blue in low occupancy cells) that were screened against PME-1. The 26 ABLs (shown as enlarged squares; all other compounds are shown as small circles) are located in a sparsely populated region of chemical space. This optimized 6-dimensional BCUTs (31) visualization of chemistry space for the compound library was generated using the standard 3D hydrogen suppressed descriptors with Diverse Solutions (Diverse Solutions, Tripos), with coverage illustrated by compression into an optimized two-dimensional BCUTs space as described in more detail previously (32). (C) Evaluation of compounds by gel-based competitive ABPP with FP-Rh (2 μM) in the soluble proteome (1 mg/mL protein) of MDA-MB-231 cells. (D) Complete PME-1 IC50 curves for ABL127 (4.2 nM; 95% confidence limits 2.3–7.5 nM) and ent-ABL127 (450 nM; 95% confidence limits 240–850 nM) in the soluble proteome of MDA-MB-231 cells (for IC50 curves of ABL103, ABL105, and ABL107, see Fig. S2). Data are presented as mean values ± SEM; n = 3/group. (E) Pretreatment of HEK 293T proteomes with ABL127 (500 nM, 30 min) before addition of purified PME-1 (500 nM, 1 h) blocks PP2A demethylation as determined by Western blotting with antibodies that recognize specific methylation states of PP2A.[2]. Academic cross-fertilization by public screening yields a remarkable class of protein phosphatase methylesterase-1 inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Apr 26;108(17):6811-6.
  • ABLs are covalent inhibitors of PME-1. (A) Proposed mechanism for covalent PME-1 inhibition by ABL127. (B) PME-1 (500 nM) was incubated with DMSO or ABL127 (5 μM), and each reaction was split into two fractions. One fraction was directly labeled with FP-Rh (left panels), and the other was subjected to gel-filtration to remove free inhibitor and then reacted with FP-Rh (right panels) to determine the reversibility of inhibition. (C) MS1 traces for the PME-1 active site peptide not adducted (top panel) or adducted (bottom panel) to ABL127. See SI Materials and Methods for more information on this experiment. Traces were obtained from tryptic digests of purified, recombinant PME-1 (10 μM) treated with ABL127 (50 μM, red trace) or DMSO (black trace).[2]. Academic cross-fertilization by public screening yields a remarkable class of protein phosphatase methylesterase-1 inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Apr 26;108(17):6811-6.
  • ABL127 selectively inactivates PME-1 and decreases the demethylated form of PP2A in cells. (A) Gel-based competitive ABPP of the soluble proteomes from MDA-MB-231 cells treated with ABL127 (0.61–10,000 nM; 1 h) reveals selective blockade of PME-1 with (B) an IC50 value of 11.1 nM. (C) Isotopically “light” and “heavy” MDA-MB-231 cells were treated with DMSO or ABL127 (100 nM), respectively, for 1 h. Proteomes were combined in a 1∶1 total protein ratio (0.5 mg each), analyzed by ABPP-MudPIT, and serine hydrolase activities were quantified by comparing intensities of light and heavy peptide peaks (see Fig. S4 for additional SILAC ABPP-MudPIT analyses). Data are presented as mean values ± SEM for all quantifiable peptides from each serine hydrolase. (D and E) MDA-MB-231 and HEK 293T cells treated with ABL127 (500 nM, 1 h) exhibit significant reductions in demethylated PP2A. (F) Stable overexpression of PME-1 in HEK 293T cells compared to control cells overexpressing GFP. PME-1 is completely inhibited by ABL127 (500 nM, 1 h) in both cell lines. (G and H) Cells overexpressing PME-1 show decreased PP2A methylation, which is reversed by addition of ABL127 (500 nM, 1 h). (I) Time-course for PME-1 inhibition by ABL127 (500 nM) in PME-1-overexpressing HEK 293T cells. For E and I: *p < 0.05, **p < 0.01 for DMSO-treated versus ABL127-treated cells. #p < 0.05, ##p < 0.01 for cells overexpressing GFP versus PME-1. Data are presented as mean values ± SEM; n = 3/group.[2]. Academic cross-fertilization by public screening yields a remarkable class of protein phosphatase methylesterase-1 inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Apr 26;108(17):6811-6.
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