AGI-24512

别名: AGI-24512 AGI 24512 AGI24512.
目录号: V10476 纯度: ≥98%
AGI-24512 是一种新型、有效、选择性的 MATA2(甲硫氨酸腺苷转移酶 2A)抑制剂,通过在体外阻断 MTAP 缺失的癌细胞的生长,具有潜在的抗癌活性。
AGI-24512 CAS号: 2201066-53-5
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述

描述:AGI-24512 是一种新型、高效且选择性的 MATA2(甲硫氨酸腺苷转移酶 2A)抑制剂,可通过抑制 MTAP 缺失癌细胞的生长发挥潜在的抗癌活性。体外AGI-24512 也显示出对 MTAP 缺失肿瘤的体内抗肿瘤活性。


AGI-24512 是一种高效、选择性且具有变构活性的 MAT2A 抑制剂,它是通过基于结构的分子设计,从片段筛选中筛选得到的。其设计方法是在吡唑并[1,5-a]嘧啶-7(4H)-酮骨架的 C-6 位引入酚羟基取代基,以取代与 Gly215 的水介导相互作用。 AGI-24512 是一种重要的体外工具化合物,可用于研究 MAT2A 生物学,并表现出对 MTAP 缺失型癌细胞的选择性抗增殖活性,这支持了 MAT2A 的药理学抑制对 MTAP 缺失型肿瘤具有治疗可行性的假设。[2]
生物活性&实验参考方法
靶点
MAT2A (methionine adenosyltransferase 2A) – enzymatic IC50 = 8 nM (0.0089 μM), enzymatic maximal inhibition = 91% [2]
体外研究 (In Vitro)
AGI-24512(0-1 μM;96 小时)通过阻断 MTAP(甲基硫代腺苷磷酸化酶)抑制 HCT116 癌细胞的生长,IC50 值为 100 nM[1]。AGI-24512 抑制 MTAP-/- 细胞中 PRMT5 介导的 SDMA 标记,IC50 值为 95 nM,从而显著增加 MTAP-/- 细胞的表达。在 HCT116 MTAP 细胞中,AGI-24512 诱导 SAM 表达。 AGI-24512 的 IC50 值为 100 nM,S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 水平呈剂量依赖性下降 [2]。在 HCT116 MTAP 缺失细胞中,AGI-24512 处理 4 小时或 72 小时后,S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 水平呈剂量依赖性下降,IC50 值为 100 nM (0.100 μM)(表 3 和正文)。[2] AGI-24512 在 HCT116 工程化同源细胞模型中表现出对 MTAP 缺失细胞的选择性抗增殖活性(未提供具体的 IC50 值)。 [2] 作用机制研究证实,AGI-24512 与化合物 2 一样,对 ATP 和 L-蛋氨酸底物均不具有竞争性(见补充信息图 S2)。[2] 用 AGI-24512 处理后,观察到 MAT2A 蛋白表达上调,这与之前使用 PF-9366 的研究结果一致。然而,这种反馈机制并未抑制其抗增殖活性,这可能是由于 AGI-24512 的效力增强所致。[2]
体内研究 (In Vivo)
AGI-24512 在恶性肿瘤中显示出有限的屏障吸收和抑制半衰期 [2]。
酶活实验
采用磷酸盐释放法测定MAT2A酶的抑制情况。将MAT2A同源二聚体稀释至1.25 μg/mL,溶于测定缓冲液(50 mM Tris pH 8.0、50 mM KCl、15 mM MgCl₂、0.3 mM EDTA、0.005% BSA)。将待测化合物配制成终浓度的50倍,溶于100% DMSO中。取1 μL化合物稀释液加入40 μL酶稀释液中,于25 °C平衡60 min。加入10 μL底物混合物(500 μM ATP pH 7.0、400 μM L-蛋氨酸,溶于1×测定缓冲液)启动反应,并于25 °C继续孵育60 min。终止反应后,使用PiColorLock Gold试剂盒测定与SAM生成量等摩尔释放的磷酸盐。通过与pH 8.0的磷酸钾缓冲液标准曲线进行比较,确定了产物的绝对含量。[2]
在研究L-蛋氨酸的作用机制时,底物浓度从6.25 μM变化至400 μM,而ATP浓度固定为100 μM。在研究ATP的作用机制时,ATP浓度从15 μM变化至1 mM,而L-蛋氨酸浓度固定为50 μM。[2]
表面等离子共振(SPR)分析:将MAT2A蛋白通过共价连接的抗His IgG固定在CMS传感器芯片上。用EDC/NHS活化芯片表面。将五聚抗His IgG稀释于pH 5.0的乙酸钠溶液中并注入芯片。用1 mM乙醇胺-HCl封闭活性位点。将MAT2A蛋白用运行缓冲液(50 mM Tris pH 8.0、150 mM NaCl、10 mM MgCl2、0.005% P20、0.5 mM TCEP)稀释后,捕获到预先制备的表面上。结合分析使用100 mM的化合物储备液,并用运行缓冲液稀释。[2]
结晶:将20 mg/mL MAT2A与2 mM SAM混合,冰上孵育2小时,生成MAT2A-SAM复合物。采用悬滴气相扩散法,将2 μL MAT2A-SAM复合物与1 μL含有0.2 M LiCl、0.1 M Tris-HCl(pH 7.8-8.4)、16-22% PEG6000和10%乙二醇的孔缓冲液混合,于18 °C下进行结晶。将 20 mg/mL MAT2A 与 2-25 mM 化合物共结晶,然后加入 2 mM SAM,冰上孵育 2 小时,得到抑制剂复合物。将晶体置于含 10% DMSO 的母液中进行冷冻保护,然后快速冷冻。MAT2A-SAM-AGI-24512 的结构以 1.10 Å 分辨率解析(PDB 编号 7KCF)。[2]
细胞实验
本研究开发了一种基于HCT116 MTAP-null细胞的细胞检测方法,通过测量不同浓度化合物处理后MAT2A产物SAM的丰度来评估MAT2A抑制情况。细胞用AGI-24512处理4小时或72小时(如表1-3所示),并定量SAM水平以确定IC50值。[2]
在HCT116 MTAP-null和MTAP-WT同源细胞模型中评估了抗增殖活性。AGI-24512显示出对MTAP-null细胞的选择性生长抑制作用(未提供具体的IC50值)。[2]
药代性质 (ADME/PK)
AGI-24512在大鼠体内口服吸收率低,半衰期短。[2]
AGI-24512的人肝微粒体提取率(ER)为0.66(表4)。[2]
AGI-24512的人血浆蛋白结合率(PPB)为99.9%,游离率为0.09%(表5)。[2]
参考文献

[1]. MAT2A Inhibition Blocks the Growth of MTAP-Deleted Cancer Cells by Reducing PRMT5-Dependent mRNA Splicing and Inducing DNA Damage. Cancer Cell. 2021 Feb 8;39(2):209-224.e11.

[2]. Discovery of AG-270, a First-in-Class Oral MAT2A Inhibitor for the Treatment of Tumors with Homozygous MTAP Deletion. J Med Chem. 2021 Apr 22;64(8):4430-4449.

其他信息
AGI-24512 是一种变构 MAT2A 抑制剂,对 ATP 和 L-蛋氨酸均无竞争性抑制作用。其结合通过稳定 α-螺旋门的闭合构象,将反应产物 SAM 捕获在活性位点。共晶体结构(PDB 编号 7KCF)证实,C-6 位的酚羟基取代了与 Gly215 相互作用的水分子(水-436)。C-3 位的哌啶基团被 Phe18、Phe20、Phe139、Ser331、Phe333 和 Leu315 残基构成的疏水环境所包裹。AGI-24512 被用作体外工具,以支持进一步的细胞研究,从而评估 MAT2A 的生物学特性。与之前的MAT2A抑制剂(例如PF-9366)相比,其效力增强,即使在细胞适应(MAT2A上调)的情况下,也能维持抗增殖作用。[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H24N4O2
分子量
400.472965240479
精确质量
400.189
CAS号
2201066-53-5
PubChem CID
134307780
外观&性状
White to gray solid powder
LogP
4.1
tPSA
68.2
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
779
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1C(C2C=CC(=CC=2)O)=C(C)N=C2C(=C(C3C=CC=CC=3)NN21)N1CCCCC1
InChi Key
JDHPOXNOROPDTE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H24N4O2/c1-16-20(17-10-12-19(29)13-11-17)24(30)28-23(25-16)22(27-14-6-3-7-15-27)21(26-28)18-8-4-2-5-9-18/h2,4-5,8-13,25,29H,3,6-7,14-15H2,1H3
化学名
6-(4-hydroxyphenyl)-5-methyl-2-phenyl-3-(piperidin-1-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one
别名
AGI-24512 AGI 24512 AGI24512.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~312.13 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (5.19 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4971 mL 12.4853 mL 24.9707 mL
5 mM 0.4994 mL 2.4971 mL 4.9941 mL
10 mM 0.2497 mL 1.2485 mL 2.4971 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Cocrystal structure of compound 2 with MAT2A and reaction product SAM (PDB code 7KCE).
  • Cocrystal structure of MAT2A·SAM·AGI-24512.
  • Pharmacologic targeting of MAT2A with in vivo tool molecule selectively blocks growth of MTAP-null tumors in vivo. Fifteen mice per arm (total 30 animals) were used in this study.
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