Aminoacyl tRNA synthetase-IN-1

目录号: V31568 纯度: ≥98%
Aminoacyl tRNA Synthetase-IN-1 是细菌氨酰 tRNA 合成酶 (aaRS) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
Aminoacyl tRNA synthetase-IN-1 CAS号: 219931-45-0
产品类别: New2
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产品描述
氨酰 tRNA 合成酶-IN-1 是细菌氨酰 tRNA 合成酶 (aaRS) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
氨酰tRNA合成酶抑制剂-IN-1 (aaRS-IN-1) 是一种小分子抑制剂,靶向亮氨酰tRNA合成酶 (LeuRS) 的编辑结构域,LeuRS 是一种必需的氨酰tRNA合成酶 (aaRS)。其分子式为C1₆H2₅N₇O₇S,分子量为459.48,是一种细菌氨酰tRNA合成酶抑制剂。该化合物也称为5'-[[(2S,3S)-2-氨基-3-甲基-1-氧代戊基]磺酰胺]腺苷。
生物活性&实验参考方法
靶点
Aminoacyl tRNA synthetase-IN-1 targets bacterial aminoacyl tRNA synthetases (aaRS), specifically the editing domain of leucyl-tRNA synthetase (LeuRS). aaRS enzymes are essential for protein synthesis as they catalyze the attachment of amino acids to their cognate tRNAs. By inhibiting LeuRS, the compound disrupts protein synthesis in bacteria. The editing domain is responsible for proofreading and correcting mischarged tRNAs, making it an attractive target for antibacterial drug development. This mechanism underlies the compound's antibacterial activity.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,氨酰tRNA合成酶抑制剂-IN-1是一种细菌氨酰tRNA合成酶(aaRS)抑制剂。它特异性靶向亮氨酰tRNA合成酶(LeuRS)的编辑结构域。通过抑制aaRS活性,该化合物阻断细菌的蛋白质合成,使其成为一种潜在的抗菌剂。其抑制活性通常通过使用重组LeuRS和tRNA底物的酶活性测定进行评估。该化合物对细菌aaRS而非哺乳动物aaRS的选择性是其作为抗菌剂的重要特性。
体内研究 (In Vivo)
由于氨酰tRNA合成酶-IN-1主要用作生化分析的研究工具,因此对其体内研究有限。然而,鉴于其对细菌氨酰tRNA合成酶(aaRS)的抑制作用,该化合物可能具有在细菌感染动物模型中进行体内疗效研究的潜力。需要进一步研究以评估其药代动力学特性、生物利用度和体内疗效。该化合物抑制细菌蛋白质合成的能力表明其可能被开发为抗菌剂。
酶活实验
在体外酶/受体结合实验中,氨酰tRNA合成酶-IN-1的活性通过氨酰化实验进行评估,该实验测量亮氨酸通过LeuRS与tRNA的连接。将该化合物与重组LeuRS酶、亮氨酸、ATP和tRNA在不同浓度下孵育。LeuRS活性通过放射性或荧光法测量亮氨酰-tRNA的生成量来定量。IC₅0值由剂量反应曲线确定。该化合物与编辑结构域的结合可以通过表面等离子共振等生物物理方法进行评估。
细胞实验
在体外细胞实验中,氨酰tRNA合成酶-IN-1在细菌细胞中进行测试,以评估其对蛋白质合成和细胞生长的影响。将细菌培养在合适的培养基中,并用不同浓度的化合物处理。通过放射性标记氨基酸的掺入或使用报告系统来测量蛋白质合成。通过测量光密度或菌落形成单位来监测细菌生长。可以使用哺乳动物细胞系平行评估该化合物对细菌细胞和哺乳动物细胞的选择性。
动物实验
在体内动物实验中,氨酰tRNA合成酶-IN-1可根据其溶解度和药代动力学特性,通过多种途径给药,包括灌胃、静脉注射或腹腔注射。该化合物的疗效可在细菌感染动物模型中进行评估。典型的给药方案为1至50 mg/kg。评估指标包括细菌载量、存活率和炎症标志物。此外,还需检测组织中的药效学指标,例如蛋白质合成抑制情况。
药代性质 (ADME/PK)
文献中对氨酰tRNA合成酶-IN-1的药代动力学特性描述尚不充分。该化合物分子量为459.48,是一种小分子,可能具有良好的生物利用度和组织分布。其在水和有机溶剂中的溶解度会影响其药代动力学特征。需要通过全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。该化合物的代谢和排泄途径仍有待进一步阐明。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于氨酰tRNA合成酶-IN-1主要用作研究工具,因此其毒理学数据有限。作为一种靶向蛋白质合成的氨酰tRNA合成酶抑制剂,其毒性取决于其对细菌氨酰tRNA合成酶与哺乳动物氨酰tRNA合成酶的选择性。抑制哺乳动物氨酰tRNA合成酶可能对蛋白质合成和细胞活力产生显著影响。因此,需要开展包括细胞毒性筛选和选择性分析在内的全面毒理学研究,以支持其进一步开发。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施。
参考文献

[1]. Microcin C and albomycin analogues with aryl-tetrazole substituents as nucleobase isosters areselective inhibitors of bacterial aminoacyl tRNA synthetases but lack efficient uptake. Chembiochem. 2012 Sep 3;13(13):1959-69.

其他信息
氨酰tRNA合成酶-IN-1是一种用于研究氨酰tRNA合成酶(aaRS)生物学和开发抗菌剂的研究化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管批准的报道。它仅供研究用途,可从多家化学品供应商处获得。该化合物是一种细菌aaRS抑制剂,靶向亮氨酰tRNA合成酶(LeuRS)的编辑结构域。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H25N7O7S
分子量
459.47740149498
精确质量
459.153
CAS号
219931-45-0
PubChem CID
10095725
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-2
tPSA
226
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
738
定义原子立体中心数目
6
SMILES
S(NC([C@H]([C@@H](C)CC)N)=O)(=O)(=O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@H](N2C=NC3C(N)=NC=NC2=3)O1)O)O
InChi Key
ADKZHDGLJXVNIT-VBJYJYTRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H25N7O7S/c1-3-7(2)9(17)15(26)22-31(27,28)29-4-8-11(24)12(25)16(30-8)23-6-21-10-13(18)19-5-20-14(10)23/h5-9,11-12,16,24-25H,3-4,17H2,1-2H3,(H,22,26)(H2,18,19,20)/t7-,8+,9-,11+,12+,16+/m0/s1
化学名
[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl N-[(2S,3S)-2-amino-3-methylpentanoyl]sulfamate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~65 mg/mL (~141.46 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.08 mg/mL (2.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.8 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.08 mg/mL (2.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.08 mg/mL (2.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1764 mL 10.8819 mL 21.7637 mL
5 mM 0.4353 mL 2.1764 mL 4.3527 mL
10 mM 0.2176 mL 1.0882 mL 2.1764 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们