AP1867-3-(Methoxyethylamine)

目录号: V41832 纯度: ≥98%
AP1867-3-(氨基乙氧基) 是一种基于 AP1867 的合成 FKBP 配体,可用于制备基于 PROTAC 结构的 FKBP12 F36V 降解剂。
AP1867-3-(Methoxyethylamine) CAS号: 2127390-15-0
产品类别: New2
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产品描述
AP1867-3-(氨基乙氧基) 是一种合成的基于 AP1867 的 FKBP 配体,可用于制备基于 PROTAC 结构的 FKBP12 F36V 降解剂。
AP1867-3-(甲氧基乙胺)(CAS号:2127390-15-0),又称AP1867-3-(氨基乙氧基),是一种合成的AP1867衍生的小分子,可作为FK506结合蛋白(FKBP)的高亲和力配体。作为一种合成配体,它是构建PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)降解剂的关键结构单元,尤其适用于设计基于FKBP12 F36V的蛋白降解工具,这些工具广泛应用于化学生物学和药物发现研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound specifically binds to FKBP12 (FK506-binding protein 12), particularly the F36V mutant variant engineered for orthogonal control in PROTAC applications. AP1867 acts as a high-affinity synthetic ligand for FKBP, and the (Methoxyethylamine) derivative contains an aminoethoxy group that provides a stable linkage point, enabling its use as a warhead for recruiting FKBP12 proteins to E3 ubiquitin ligases.
体外研究 (In Vitro)
该化合物本身是FKBP配体而非直接酶抑制剂;其主要活性在于与FKBP12的高亲和力结合(Kd通常在低纳摩尔范围内)。作为一种构建单元,当其被整合到完整的PROTAC分子中时,可通过PROTAC介导的FKBP12融合蛋白降解来证实其细胞活性。AP1867-FKBP12相互作用已被广泛验证为诱导系统中选择性最高的蛋白质-配体对之一。
体内研究 (In Vivo)
由于该结构单元本身并非作为治疗药物使用,因此目前尚无其单独的体内数据。当将其整合到 PROTAC 分子中时,所得的 FKBP12 靶向降解剂展现出体内活性。基于 AP1867 的 PROTAC 已成功应用于小鼠模型中,实现了 FKBP12 的降解,验证了该配体骨架在体内化学生物学应用中的实用性。
酶活实验
基于AP1867的配体的结合亲和力和选择性通常采用表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)进行评估。重组FKBP12蛋白固定在传感器芯片上或置于反应池中。将不同浓度的AP1867-3-(甲氧基乙胺)溶液流过表面或进行滴定,并根据所得的传感器图或热谱图计算结合动力学和解离常数(Kd)。
细胞实验
虽然构建单元本身并不直接用于细胞实验,但含有该FKBP配体的完整PROTAC可用于降解剂研究。表达FKBP12融合蛋白的靶细胞用含有AP1867-3-(甲氧基乙胺)的PROTAC处理。处理4-24小时后,裂解细胞,并使用抗FKBP12抗体或蛋白特异性抗体,通过Western blot检测FKBP12融合蛋白水平,同时设置不含配体或E3连接酶配体的阴性对照。
动物实验
体内研究使用的是与该FKBP配体组装的完整PROTAC分子,而非单独的构建单元。在典型的研究中,将携带表达FKBP12融合靶蛋白的异种移植瘤的小鼠通过腹腔或静脉注射给予PROTAC,剂量为10-30 mg/kg。治疗后收集肿瘤组织和其他器官,进行FKBP12靶蛋白水平的Western blot分析,以评估降解效率和生物分布。
药代性质 (ADME/PK)
药代动力学性质的测定针对的是最终的PROTAC分子,而非该配体本身。AP1867是一种小分子,分子量为678.81 g/mol,预测LogP值为5.8,具有高度亲脂性,可能具有良好的膜渗透性。它主要用于偶联反应,而非直接体内给药,其在DMSO中的溶解度(~240 mg/mL)使其适合进一步的化学衍生化。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于AP1867-3-(甲氧基乙胺)是一种仅用于化学合成的研究用结构单元,因此目前尚无其作为独立化合物的毒理学数据。当将其整合到PROTACs中时,需对整个降解分子进行毒性评估。FKBP12配体本身已广泛应用于化学生物学研究,在相关浓度下未见明显的细胞毒性报道。
参考文献

[1]. Assessing Different E3 Ligases for Small Molecule Induced Protein Ubiquitination and Degradation. ACS Chem Biol. 2017 Oct 20;12(10):2570-2578.

其他信息
AP1867-3-(甲氧基乙胺)是一种研究级化学结构单元,并非临床药物。它可通过其氨基乙氧基连接基团合成FKBP12 F36V靶向PROTAC降解剂,该连接基团可与E3泛素连接酶配体(例如VHL或CRBN结合剂)偶联。这种方法能够选择性地降解蛋白质,是对传统抑制剂研究的补充。截至最新信息,该化合物尚未获准用于临床,仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C38H50N2O9
分子量
678.811611652374
精确质量
678.351
CAS号
2127390-15-0
PubChem CID
139600312
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.8
tPSA
128
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
18
重原子数目
49
分子复杂度/Complexity
973
定义原子立体中心数目
3
SMILES
O([C@H](C1C=CC=C(C=1)OCCN)CCC1C=CC(=C(C=1)OC)OC)C([C@H]1CCCCN1C([C@@H](C1C=C(C(=C(C=1)OC)OC)OC)CC)=O)=O
InChi Key
IUXMLUSGUQVKAO-RWSKJCERSA-N
InChi Code
InChI=1S/C38H50N2O9/c1-7-29(27-23-34(45-4)36(47-6)35(24-27)46-5)37(41)40-19-9-8-13-30(40)38(42)49-31(26-11-10-12-28(22-26)48-20-18-39)16-14-25-15-17-32(43-2)33(21-25)44-3/h10-12,15,17,21-24,29-31H,7-9,13-14,16,18-20,39H2,1-6H3/t29-,30-,31+/m0/s1
化学名
[(1R)-1-[3-(2-aminoethoxy)phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~240 mg/mL (~353.56 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 6 mg/mL (8.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 60.0 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 6 mg/mL (8.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 60.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 6 mg/mL (8.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 60.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4732 mL 7.3658 mL 14.7317 mL
5 mM 0.2946 mL 1.4732 mL 2.9463 mL
10 mM 0.1473 mL 0.7366 mL 1.4732 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们