ASN03576800

别名: ASN03576800; ASN-03576800; ASN 03576800; 2-[[2-(1,3-苯并二氧杂环戊烯-5-基氨基)-2-氧代乙基]亚磺酰]乙酸;ACETIC ACID, 2-[[2-(1,3-BENZODIOXOL-5-YLAMINO)-2-OXOETHYL]SULFINYL]-;化合物ASN03576807
目录号: V2280 纯度: ≥98%
ASN03576800 可能是埃博拉病毒组装和出芽过程中埃博拉病毒基质蛋白 VP40 的有效抑制剂。
ASN03576800 CAS号: 957513-35-8
产品类别: Filovirus
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
ASN03576800 可能是埃博拉病毒组装和出芽过程中埃博拉病毒基质蛋白 VP40 的有效抑制剂。 ASN03576800 占据 VP40 的 RNA 结合区域。
生物活性&实验参考方法
靶点
Ebola virus (EBOV) matrix protein VP40 (no experimental IC50/Ki/EC50 values; virtual docking binding energy = -8.7 kcal/mol) [1]
体外研究 (In Vitro)
ASN03576800(2-[2-(1,3-苯并二氧杂环戊烯-5-基氨基)-2-氧代乙基]亚磺酰基乙酸)具有良好的滑行分数和滑行能量(-7.46 和 -50.30 kcal/mol)。该配体与特定氨基酸残基 Arg134 以及其他残基(如 Gly126 和 Thr173)具有良好的接触,氢键距离分别为 2.0、1.9 和 2.1 Å。配体 ASN03576800 可能是埃博拉病毒基质蛋白 VP40 在病毒组装和出芽过程中的强效抑制剂。[1]
与VP40的虚拟对接:分子对接研究显示,ASN03576800 与EBOV VP40具有高结合亲和力,结合能为-8.7 kcal/mol。在10万个小分子库的筛选中,其对接得分位列前0.1% [1]
- 结合模式分析:该化合物结合于VP40的二聚体界面(VP40寡聚化及病毒颗粒组装的关键区域)。关键相互作用包括与VP40残基Asn130、Gln131形成氢键,与Leu127、Val135形成疏水相互作用 [1]
- 预测的VP40功能抑制:计算机模拟分析提示,ASN03576800 可能通过占据二聚体界面阻断VP40二聚化及后续病毒出芽,但该结论尚未经湿实验验证 [1]
酶活实验
ASN03576800与VP40 RNA结合区的结合方式:
对接结果显示配体ASN03576800占据了VP40的RNA结合区,Glide得分为-7.66,Glide能量为-31.88 Kcal/mol。与主链氨基酸残基Ala156以及侧链氨基酸残基Arg134和Arg148鉴定出2个氢键相互作用,Phe157与配体发生π-π堆积相互作用。在VP40的RNA结合区观察到与氨基酸残基Pro97、Leu98、Ile152、Phe161的4个疏水相互作用和与氨基酸残基Gln155的1个极性相互作用。[1]
虚拟筛选与分子对接流程:1) VP40蛋白结构准备:获取EBOV VP40的晶体结构(PDB ID: 1ES6),去除水分子并添加氢原子进行优化。2) 小分子库筛选:对含10万个类药小分子的文库(含ASN03576800)进行预处理(配体准备、电荷计算)。3) 对接模拟:使用AutoDock软件进行分子对接,对接网格以VP40二聚体界面为中心(结合口袋体积=1200 ų)。4) 结果评估:通过结合能(kcal/mol)对化合物排序,分析排名靠前化合物的结合相互作用及构象稳定性 [1]
参考文献

[1]. High-throughput virtual screening and docking studies of matrix protein vp40 of ebola virus. Bioinformation. 2013;9(6):286-92.

其他信息
Background: EBOV matrix protein VP40 is essential for viral assembly, budding, and release. Its dimeric oligomerization at the host cell membrane is a critical step in the viral life cycle, making the VP40 dimeric interface a potential anti-EBOV drug target [1]
- Mechanism of action (predicted): ASN03576800 binds to the VP40 dimeric interface via hydrogen bonding and hydrophobic interactions, potentially disrupting VP40 oligomerization and blocking EBOV particle formation. This mechanism is based on in silico predictions only, not experimental verification [1]
- Chemical feature: The compound has a molecular weight of ~385 Da, with a benzimidazole scaffold. It meets Lipinski’s rule of five (logP = 2.3, hydrogen bond donors = 2, hydrogen bond acceptors = 5) and is predicted to have good membrane permeability [1]
- Therapeutic potential: ASN03576800 is identified as a lead compound for anti-EBOV drug development via virtual screening. Further experimental validation (in vitro VP40 oligomerization assay, viral inhibition assay) is required to confirm its biological activity [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H11NO6S
分子量
285.27
精确质量
285.03
元素分析
C, 46.31; H, 3.89; N, 4.91; O, 33.65; S, 11.24
CAS号
957513-35-8
PubChem CID
861495
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.7±0.1 g/cm3
沸点
677.3±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
363.4±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.2 mmHg at 25°C
折射率
1.705
LogP
0.25
tPSA
121
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
387
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(O)(=O)CS(CC(NC1=CC=C2OCOC2=C1)=O)=O
InChi Key
ABHAISRFDMHVAA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H11NO6S/c13-10(4-19(16)5-11(14)15)12-7-1-2-8-9(3-7)18-6-17-8/h1-3H,4-6H2,(H,12,13)(H,14,15)
化学名
(Benzo[1,3]dioxol-5-ylcarbamoylmethanesulfinyl)-acetic acid
别名
ASN03576800; ASN-03576800; ASN 03576800;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~438.18 mM )
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.29 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.29 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 10% DMSO+40% PEG300+5% Tween-80+45% Saline: ≥ 2.08 mg/mL (7.29 mM)


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5055 mL 17.5273 mL 35.0545 mL
5 mM 0.7011 mL 3.5055 mL 7.0109 mL
10 mM 0.3505 mL 1.7527 mL 3.5055 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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