Asp-AMS

目录号: V29178 纯度: ≥98%
Asp-AMS 是天冬氨酸腺苷酸的类似物、天冬氨酰-tRNA 合成酶的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)和线粒体酶的有效竞争性抑制剂。
Asp-AMS CAS号: 828288-98-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Asp-AMS 是天冬氨酸腺苷酸的类似物,是天冬氨酰-tRNA 合成酶的抑制剂(阻断剂/拮抗剂),也是线粒体酶的强效竞争性抑制剂。
Asp-AMS(CAS号:828288-98-8)是天冬氨酰腺苷酸的类似物,可作为线粒体天冬氨酰tRNA合成酶(AspRS)和线粒体酶的强效竞争性抑制剂。它是一种小分子抑制剂,广泛应用于生物化学研究中,用于研究蛋白质合成和线粒体功能。Asp-AMS具有很强的抑制活性,其Ki值在纳摩尔范围内。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of Asp-AMS is aspartyl-tRNA synthetase (AspRS), an enzyme essential for protein synthesis that catalyzes the attachment of aspartic acid to its cognate tRNA. Asp-AMS also acts as a potent competitive inhibitor of mitochondrial enzymes. The compound exhibits differential selectivity, showing stronger inhibitory effects on bacterial AspRS from organisms such as E. coli and Pseudomonas aeruginosa compared to human cytosolic AspRS. Additionally, Asp-AMS targets the mitochondrial isoform of AspRS with high affinity.
体外研究 (In Vitro)
与天冬氨酸-AMP(10 nM)相比,Asp-AMS 的抑制活性比人源和牛源细胞色素天冬氨酸合成酶(300 nM)低35倍,而天冬氨酸-AMP对线粒体酶的抑制活性是Asp-AMS的500倍。Asp-AMS的Ki值在纳摩尔(nM)范围内,是一种强效抑制剂。Asp-AMS对线粒体酶的抑制作用同样显著。由于其Ki值在纳摩尔范围内,Asp-AMS是最有效的抑制剂,并且对细菌(如大肠杆菌和铜绿假单胞菌)的AspRS的抑制效果优于对人源胞质AspRS的抑制效果[1]。
Asp-AMS 对天冬氨酰-tRNA合成酶表现出强效的体外抑制活性。它对线粒体酶的竞争性抑制作用比天冬氨酰-AMP(10 nM)强500倍。对于人和牛的胞质AspRS,Asp-AMS 的竞争性抑制作用弱35倍(300 nM)。该化合物的Ki值在纳摩尔范围内,使其成为活性最强的线粒体AspRS抑制剂之一。与人胞质酶相比,Asp-AMS 对细菌AspRS的抑制效力更高,表明其具有物种选择性。
体内研究 (In Vivo)
目前,Asp-AMS 的体内活性数据有限,因为该化合物主要用于生化和细胞实验,而非动物模型。基于其对天冬氨酰-tRNA 合成酶和线粒体酶的强效体外抑制作用(Ki 值达纳摩尔级),Asp-AMS 有望干扰生物体内的蛋白质合成和线粒体功能。然而,目前尚未有大量关于其在动物模型中药代动力学和药效学的全面研究报道。因此,该化合物仍是研究氨酰-tRNA 合成酶生物学和线粒体酶功能的研究工具,而非具有确切体内疗效的候选治疗药物。
酶活实验
Asp-AMS的体外酶/受体结合试验通常包括使用酶活性测定法测量其对天冬氨酰tRNA合成酶的抑制活性。该测定体系包含纯化的AspRS酶、其天然底物天冬氨酸、ATP和tRNA,并通过ATP消耗或tRNA氨酰化来监测反应进程。加入不同浓度的Asp-AMS以确定IC50或Ki值。Ki值的测定采用Lineweaver-Burk作图或Dixon作图分析法,通过测量不同底物和抑制剂浓度下的酶活性来进行。测定缓冲液通常包含Tris-HCl、氯化镁、氯化钾和DTT,pH值维持在生理范围内。反应在37℃下孵育,并通过加入三氯乙酸或SDS终止反应,然后定量分析产物生成量。
细胞实验
Asp-AMS的体外细胞检测方法包括培养相关细胞系(例如哺乳动物细胞或细菌细胞),并用不同浓度的化合物处理细胞。通常将细胞接种于多孔板中,并在37℃、5% CO₂的条件下,于合适的培养基中培养24-72小时。处理后,使用MTT、CCK-8或ATP-lite等标准检测方法评估细胞活力,以确定IC50值。此外,可通过测量放射性标记氨基酸的掺入量或通过Western blot分析特定蛋白的表达水平来评估化合物对蛋白质合成的影响。线粒体功能可通过氧消耗率测量或使用JC-1等荧光染料进行线粒体膜电位测定来评估。
动物实验
关于Asp-AMS的体内动物研究在文献中鲜有报道。基于该化合物作为天冬氨酰tRNA合成酶抑制剂的作用机制,潜在的动物研究通常会采用腹腔注射、静脉注射或口服途径,在啮齿动物模型中给药。给药剂量将根据初步的药代动力学数据和溶解度曲线确定。此类研究的常见终点包括评估靶组织中的酶抑制情况、评估蛋白质合成抑制情况以及监测一般毒性参数。然而,由于Asp-AMS主要用作生化研究的试剂,因此尚未有大量关于其全面的体内动物疗效和毒性研究报道。
药代性质 (ADME/PK)
文献中尚未对Asp-AMS的药代动力学性质进行全面表征。根据其理化性质,该化合物的分子量为461.41 g/mol,LogP值为-6.5,表明其具有高亲水性,并含有6个氢键供体和14个氢键受体。该化合物在DMSO中溶解度良好(100 mg/mL),并已配制成用于体内研究的溶液,其配制方法为:10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45%生理盐水。其高极性(LogP -6.5)提示其口服生物利用度有限,且可能存在膜渗透性问题。该化合物粉末在-20℃下可稳定保存3年,在4℃下可稳定保存2年;溶液在-80℃下可稳定保存6个月,在-20℃下可稳定保存1个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中关于Asp-AMS毒性的数据记录并不详尽。作为一种用于体外生化和细胞研究的科研用化合物,尚未有关于其在动物模型中全面毒理学分析的报道。基于其作为天冬氨酰tRNA合成酶抑制剂的作用机制,其潜在毒性可能与细胞内蛋白质合成和线粒体功能的紊乱有关。该化合物的高极性(LogP -6.5)可能限制细胞摄取并降低全身毒性。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备。与所有科研化学品一样,应遵守正确的废物处理程序并尽量减少接触。
参考文献

[1]. Peculiar inhibition of human mitochondrial aspartyl-tRNA synthetase by adenylate analogs. Biochimie. 2009 May;91(5):596-603.

其他信息
Asp-AMS(CAS号:828288-98-8)是一种研究级化合物,分子式为C14H1₉N₇O₉S,分子量为461.41。它是天冬氨酰腺苷酸的类似物,既是天冬氨酰tRNA合成酶抑制剂,也是线粒体酶的强效竞争性抑制剂。该化合物的Ki值在纳摩尔范围内,并表现出差异选择性,对细菌AspRS的抑制作用强于对人胞质AspRS的抑制作用。Asp-AMS已被同行评审文献引用,包括发表在《生物化学》(Biochimie)杂志上的研究。该化合物仅供研究用途,未经批准用于临床或人体服用。目前尚未有关于该化合物的临床试验或监管审批报告。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H19N7O9S
分子量
461.407160997391
精确质量
461.096
CAS号
828288-98-8
PubChem CID
11190411
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-6.5
tPSA
264
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
781
定义原子立体中心数目
5
SMILES
O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](COS(=O)(=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(=O)O)O[C@H]1N1C=NC2C(=NC=NC1=2)N
InChi Key
KMRBRMHHDAUXAY-UFIIOMENSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H19N7O9S/c15-5(1-7(22)23)13(26)20-31(27,28)29-2-6-9(24)10(25)14(30-6)21-4-19-8-11(16)17-3-18-12(8)21/h3-6,9-10,14,24-25H,1-2,15H2,(H,20,26)(H,22,23)(H2,16,17,18)/t5-,6+,9+,10+,14+/m0/s1
化学名
(3S)-3-amino-4-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxysulfonylamino]-4-oxobutanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~216.73 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1673 mL 10.8363 mL 21.6727 mL
5 mM 0.4335 mL 2.1673 mL 4.3345 mL
10 mM 0.2167 mL 1.0836 mL 2.1673 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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