ATG7-IN-2

目录号: V46999 纯度: ≥98%
ATG7-IN-2 (Compound 1) 是一种有效的 ATG7 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 0.089 μM。
ATG7-IN-2 CAS号: 2226227-75-2
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
ATG7-IN-2(化合物 1)是一种强效的 ATG7 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 0.089 μM。ATG7-IN-2 可抑制自噬标志物 LC3B。
ATG7-IN-2(2226227-75-2,化合物1)是一种高效的自噬相关蛋白ATG7抑制剂,ATG7是一种E1样酶,对自噬的启动至关重要。其IC50值为0.089 microM,能有效抑制自噬标志物LC3B的活性,从而调节自噬过程。
生物活性&实验参考方法
靶点
Target: ATG7 (autophagy-related protein 7, IC50 = 0.089 microM). ATG7 is an E1-like activating enzyme that plays a critical role in the formation of autophagosomes, essential for the initiation of the autophagy pathway. By inhibiting ATG7, ATG7-IN-2 disrupts autophagic flux at an early stage, preventing LC3 lipidation and autophagosome formation.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,ATG7-IN-2(化合物1)是一种强效的ATG7抑制剂,生化分析显示其IC50值为0.089 uM。它能有效抑制自噬标志物LC3B(LC3B-II转化)。该化合物在多种细胞模型中均能抑制自噬,是研究自噬调控的有效工具。在有效浓度下,尚未报道其具有细胞毒性。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无针对 ATG7-IN-2 在动物模型中的体内疗效数据发表。作为一种 ATG7 抑制剂,预计 ATG7-IN-2 将在自噬功能紊乱的疾病模型中发挥作用,包括癌症(抑制肿瘤细胞存活)、神经退行性疾病(减轻自噬应激)和病原体清除(增强微生物杀灭)。详细的动物研究数据尚未公开。
酶活实验
对于无细胞 ATG7 活性测定:将重组 ATG7 蛋白 (100-200 ng) 与不同浓度的 ATG7-IN-2 (0-100 uM)、ATP (1-2 mM) 以及荧光或放射性标记的底物(例如,35S 标记的 ATG12)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、5 mM MgCl2、1 mM DTT)中于 37℃ 孵育 30-60 分钟。加入 SDS 上样缓冲液终止反应,并通过 SDS-PAGE 和放射自显影分析 ATG12-ATG5 共轭物的形成。IC50 由剂量反应曲线计算得出 (0.089 uM)。或者,也可以使用标记的 ATG7 和 ATG10 底物进行基于荧光的测定。
细胞实验
对于基于细胞的检测:将癌细胞系(例如 HeLa、MCF7、A549、HCT116)接种于 6 孔或 96 孔板中,并用 ATG7-IN-2(0.1-100 uM,24-72 小时)处理。通过以下方法评估自噬抑制:1) Western blot 检测 LC3B-II 转化和 p62/SQSTM1 积累;2) 免疫荧光检测 LC3 斑点形成;3) 使用 Cyto-ID 自噬染料进行流式细胞术分析。细胞活力通过 MTT 或 CellTiter-Glo 法测定。使用串联荧光 LC3 报告基因(mCherry-GFP-LC3)监测自噬体-溶酶体融合,从而测定自噬通量。
动物实验
对于体内动物研究:潜在方案包括异种移植小鼠模型(例如,HeLa 或 A549 肿瘤)或癌细胞系来源的异种移植模型。ATG7-IN-2 配制于 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% 生理盐水中,并以 20-100 mg/kg 的剂量每日腹腔注射或静脉注射,持续 2-4 周。使用游标卡尺测量肿瘤体积。收集肿瘤组织,用于通过蛋白质印迹法分析 LC3B-II、p62 和 ATG7 靶点结合情况。对于神经退行性疾病模型(例如,Tau 蛋白病、亨廷顿病),该化合物将用于评估其对蛋白质聚集体自噬清除的影响。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无 ATG7-IN-2 的药代动力学 (PK) 数据。对于一种小分子 ATG7 抑制剂(分子量 376.35,基于结构计算的 LogP 值约为 0.9),腹腔注射后在啮齿动物体内的预期药代动力学特征为:中等血浆暴露量,达峰时间 (Tmax) 0.5-1 小时,血浆半衰期 2-4 小时。该化合物可溶于二甲基亚砜 (DMSO)。体内制剂:10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% 生理盐水。口服生物利用度可能为中等。脑渗透性尚不确定。该化合物仅适用于研究用途。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于ATG7-IN-2毒性的数据报道。ATG7是自噬所必需的,抑制ATG7可能导致自噬周转率高的组织(包括肝脏、肾脏、神经元和免疫细胞)出现毒性。ATG7基因敲除小鼠在新生儿期即死亡,但成年小鼠可能耐受急性药理学抑制。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Discovery and optimization of pyrazolopyrimidine sulfamates as ATG7 inhibitors. Bioorg Med Chem. 2020 Oct 1;28(19):115681.

其他信息
ATG7-IN-2 是一种尚未获准用于临床的研究化合物。它是一种有价值的化学探针,可用于研究 ATG7 和自噬在各种生物过程和疾病状态中的作用。它在癌症研究(阻断自噬以克服化疗耐药性)、神经退行性疾病(阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病)、传染病(增强病原体清除)和代谢紊乱等领域具有潜在的应用价值。它是验证 ATG7 作为治疗靶点的关键工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H16N6O7S
分子量
376.345740318298
精确质量
376.08
CAS号
2226227-75-2
PubChem CID
134501092
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-2.6
tPSA
206
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
576
定义原子立体中心数目
4
SMILES
O[C@@H]1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N1N=C(C2=C(N=CN=C12)N)OC)COS(=O)(=O)N)O
InChi Key
SVHOPJCSYNTLAH-RPKMEZRRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H16N6O7S/c1-22-10-5-8(12)14-3-15-9(5)17(16-10)11-7(19)6(18)4(24-11)2-23-25(13,20)21/h3-4,6-7,11,18-19H,2H2,1H3,(H2,12,14,15)(H2,13,20,21)/t4-,6-,7-,11-/m1/s1
化学名
[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-3-methoxypyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl sulfamate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~265.71 mM)
H2O : ~0.5 mg/mL (~1.33 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 25 mg/mL (66.43 mM) in Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 25 mg/mL (66.43 mM) in 20% HP-β-CD in Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 需要超声波并用 1M HCl 将 pH 调节至 4。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6571 mL 13.2855 mL 26.5710 mL
5 mM 0.5314 mL 2.6571 mL 5.3142 mL
10 mM 0.2657 mL 1.3286 mL 2.6571 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们