ATP-polyamine-biotin

目录号: V32219 纯度: ≥98%
ATP-聚胺-生物素是第一个细胞穿透/可穿透的 ATP 类似物,是一种有效的激酶共底物。
ATP-polyamine-biotin CAS号: 1800401-93-7
产品类别: New2
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产品描述
ATP-多胺-生物素是首个可穿透细胞的ATP类似物,也是一种高效的激酶辅底物。ATP-多胺-生物素能够促进活细胞中激酶底物的生物素标记。
ATP-多胺-生物素(CAS 1800401-93-7)是首个可穿透细胞的ATP类似物,也是一种高效的激酶辅底物。它是一种化学修饰的ATP衍生探针,能够与蛋白激酶的ATP结合位点结合,从而实现激酶活性和底物识别的标记和检测。ATP-多胺-生物素能够促进活细胞中激酶底物的生物素标记,使其成为研究激酶信号传导、鉴定激酶底物和发现激酶抑制剂的有力工具。该化合物的转化率和动力学与其他已知的ATP类似物相似。它未来有望应用于磷蛋白的纯化和分析。其分子式为 C₃₂H₅₈N₁₁O₁₄P₃S,分子量为 945.85。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary molecular target of ATP-polyamine-biotin is the ATP-binding site of protein kinases. As an ATP analogue, the compound mimics ATP and binds to the kinase active site, where it acts as a cosubstrate. The compound's polyamine moiety enhances cell permeability, allowing it to penetrate cell membranes and access intracellular kinases. The biotin moiety enables the labeling and subsequent detection or purification of kinase substrates via streptavidin-based methods (e.g., Western blot, pull-down, mass spectrometry). By binding to kinases and being transferred to substrates, ATP-polyamine-biotin enables the identification and characterization of kinase-substrate interactions and the study of kinase signaling networks.
体外研究 (In Vitro)
PKA激酶和髓鞘碱性蛋白(MBP,全长蛋白底物)用ATP-多胺-生物素(APB)处理。检测生物素化需要激酶。此外,在激酶抑制剂星形孢菌素存在下、在没有ATP-多胺-生物素的情况下或在酸性孵育期间,由于磷酰胺键的断裂,MBP的生物素化会丢失。只有在APB共底物存在的情况下,才能检测到生物素化的Kemp肽产物[1]。体外研究表明,ATP-多胺-生物素是一种高效的激酶共底物,其转化率和动力学与其他已知的ATP类似物相似。该化合物可透过细胞膜,可用于标记活细胞中的激酶底物。在生化分析中,ATP-多胺-生物素用作纯化激酶的底物,从而实现激酶底物的生物素化。生物素化产物可通过链霉亲和素-HRP在Western blot中检测,或捕获于链霉亲和素磁珠上进行质谱分析鉴定。该化合物能够以激酶依赖的方式标记激酶底物,使其成为研究激酶特异性、底物鉴定和抑制剂筛选的有力工具。ATP-多胺-生物素具有细胞毒性,在细胞实验中使用时应予以考虑。在细胞研究中,ATP-多胺-生物素用于促进活细胞中激酶底物的生物素标记。该化合物具有细胞渗透性,可添加到细胞培养基中,进入细胞后作为内源性激酶的共底物发挥作用。激酶底物以激酶依赖的方式被生物素化,标记的蛋白质可通过链霉亲和素-HRP在Western blot中检测,或捕获于链霉亲和素磁珠上进行质谱分析鉴定。这种方法能够用于鉴定激酶底物、研究激酶信号通路以及筛选激酶抑制剂。该化合物已应用于多种细胞类型,并可用于磷酸化蛋白的纯化和分析。ATP-多胺-生物素是化学生物学和蛋白质组学研究的重要工具。
体内研究 (In Vivo)
由于ATP-多胺-生物素主要用作体外和细胞研究工具,因此其体内研究较为有限。然而,该化合物的细胞渗透性表明,它可能适用于动物模型,用于研究体内激酶活性。在这些研究中,可将ATP-多胺-生物素注射到动物体内,并收集组织样本以分析生物素化蛋白。然而,目前尚未有关于该化合物的广泛体内药理学或毒理学研究报道。该化合物主要用于化学生物学和蛋白质组学研究。
酶活实验
在激酶活性测定中,ATP-多胺-生物素用作体外纯化激酶的底物。将纯化的激酶与ATP-多胺-生物素(通常为0.1-100 µM)以及肽或蛋白质底物在激酶测定缓冲液(例如,50 mM HEPES,pH 7.5,10 mM MgCl₂,1 mM DTT)中于30°C孵育30-60分钟。反应通过加入SDS-PAGE上样缓冲液或加热灭活终止。反应产物经SDS-PAGE分离后转移至膜上。生物素化产物通过链霉亲和素-HRP和化学发光法检测。在激酶活性测定中,生物素化程度通过密度扫描法定量。在动力学研究中,ATP-多胺-生物素的Km值通过改变化合物浓度并测量生物素化速率来确定。对于抑制剂筛选,将激酶与 ATP-多胺-生物素在不同浓度的测试抑制剂存在下孵育,并测量生物素化的抑制情况。
细胞实验
在细胞标记研究中,细胞(例如癌细胞系、原代细胞)在含有10%胎牛血清(FBS)和抗生素的适宜培养基中培养。将细胞接种于6孔板或10厘米培养皿中,培养至70-80%汇合度。将ATP-多胺-生物素溶解于水或缓冲液中,并加入培养基中,使其最终浓度达到一定值(通常为10-100 µM)。细胞在37°C下处理1-4小时。在激酶抑制剂研究中,细胞在加入ATP-多胺-生物素前,先用激酶抑制剂预处理30-60分钟。处理后,用PBS洗涤细胞,并在RIPA裂解缓冲液或含有蛋白酶抑制剂的裂解缓冲液中裂解细胞。生物素标记的蛋白质可通过链霉亲和素-HRP进行Western blot检测,或捕获于链霉亲和素-琼脂糖珠上进行下拉实验。对于质谱鉴定,生物素化蛋白在链霉亲和素磁珠上富集,洗脱后通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行分析。对于磷蛋白纯化,生物素化磷蛋白使用链霉亲和素亲和层析法进行纯化。
动物实验
对于体内研究,可根据初步毒性研究确定的剂量,通过静脉注射或腹腔注射的方式向小鼠给药ATP-多胺-生物素。在不同时间点收集组织样本,并进行Western blot分析或质谱分析,以鉴定生物素化蛋白。然而,此类研究对于该化合物并不常见,文献中也未报道具体的实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
由于ATP-多胺-生物素化合物主要用作研究试剂而非治疗药物,因此其药代动力学数据有限。作为一种细胞可渗透的ATP类似物,该化合物预计会被细胞吸收并分布到组织中。其代谢过程可能涉及磷酸酐键的水解以及多胺和生物素部分的降解。然而,目前尚未有专门的药代动力学研究报道。该化合物主要用于体外和细胞实验,不适用于体内药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
ATP-多胺-生物素的毒理学数据有限。该化合物具有细胞毒性,在进行细胞实验时应予以考虑。在标记浓度(通常为10-100 µM)下,该化合物可能具有一定的细胞毒性,具体取决于细胞类型和暴露时间。目前尚未有关于其急性毒性、器官特异性毒性或致突变性的数据报道。与所有化学试剂一样,处理ATP-多胺-生物素时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备(手套、实验服、护目镜)并在通风良好的区域进行操作。
参考文献

[1]. A Cell-Permeable ATP Analogue for Kinase-Catalyzed Biotinylation. Angew Chem Int Ed Engl. 2015 Aug 10;54(33):9618-21.

其他信息
ATP-多胺-生物素(CAS 1800401-93-7)是首个可透过细胞膜的ATP类似物,也是一种高效的激酶辅底物。它能与蛋白激酶的ATP结合位点结合,促进活细胞中激酶底物的生物素标记。该化合物的转化率和动力学与其他ATP类似物相似。其分子式为C₃₂H₅₈N₁₁O₁₄P₃S,分子量为945.85。ATP-多胺-生物素是研究激酶信号传导、鉴定激酶底物和发现激酶抑制剂的有力工具。它还可用于磷蛋白的纯化和分析。该化合物仅供科研使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H58N11O14P3S
分子量
945.8545
精确质量
945.309
CAS号
1800401-93-7
PubChem CID
118704767
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.8±0.1 g/cm3
折射率
1.730
LogP
-3.53
tPSA
373
氢键供体(HBD)数目
10
氢键受体(HBA)数目
22
可旋转键数目(RBC)
27
重原子数目
61
分子复杂度/Complexity
1590
定义原子立体中心数目
7
SMILES
CN(CCCCN(C)CCCNP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)N2C=NC3=C(N=CN=C32)N)O)O)CCCNC(=O)CCCC[C@H]4[C@@H]5[C@H](CS4)NC(=O)N5
InChi Key
MODMQMYTNMWWCS-MCINONILSA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H58N11O14P3S/c1-41(15-7-11-34-24(44)10-4-3-9-23-25-21(18-61-23)39-32(47)40-25)13-5-6-14-42(2)16-8-12-38-58(48,49)56-60(52,53)57-59(50,51)54-17-22-27(45)28(46)31(55-22)43-20-37-26-29(33)35-19-36-30(26)43/h19-23,25,27-28,31,45-46H,3-18H2,1-2H3,(H,34,44)(H,50,51)(H,52,53)(H2,33,35,36)(H2,38,48,49)(H2,39,40,47)/t21-,22+,23-,25-,27+,28+,31+/m0/s1
化学名
N-[3-[4-[3-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]propyl-methylamino]butyl-methylamino]propyl]-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxyphosphonamidic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~6 mg/mL (~6.34 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 7.69 mg/mL (8.13 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 通过加热和超声助溶。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0573 mL 5.2863 mL 10.5725 mL
5 mM 0.2115 mL 1.0573 mL 2.1145 mL
10 mM 0.1057 mL 0.5286 mL 1.0573 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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