AX15836

别名: AX15836; AX-15836; 2035509-96-5; AX15,836; AX-15,836; AX 15,836; 2-[2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]anilino]-5-methyl-11-methylsulfonylpyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one; CHEMBL4541479; 2-((2-ethoxy-4-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl)phenyl)amino)-5-methyl-11-(methylsulfonyl)-5,11-dihydro-6H-benzo[e]pyrimido[5,4-b][1,4]diazepin-6-one; 2-(2-Ethoxy-4-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl)phenylamino)-5-methyl-11-(methylsulfonyl)-5H-benzo[e]pyrimido[5,4-b][1,4]diazepin-6(11H)-one; AX 15836 AX15836
目录号: V11971 纯度: ≥98%
AX-15836 是一种有效且特异性的 ERK5 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 8 nM。
AX15836 CAS号: 2035509-96-5
产品类别: ERK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
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纯度: ≥98%

产品描述
AX-15836 是一种有效且特异性的 ERK5 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 8 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
ERK5 (IC50 = 8 nM)
体外研究 (In Vitro)
AX-15836 的 ERK5 选择性比 200 多种激酶高 1,000 倍以上。它的 Kd 为 3,600 nM,还表现出优于 BRD4 的选择性。外周血单核细胞 (PBMC)、内皮细胞和致癌细胞系均表现出相似的 AX15836 细胞内效力 (4–9 nM)。 AX15836 在抑制炎症细胞因子反应方面完全无效(EC50>10 M),表明化合物的 BRD 抑制成分实际上导致细胞因子减少。在 HUVEC 和 HeLa 细胞类型中经 AX15836 处理的样品中,只有少数基因表现出差异表达。在 HeLa 细胞中,AX15836 能够明显抑制因 EGF 反应而磷酸化的 ERK5[1]。
细胞实验
对于细胞增殖的研究,将细胞暴露于 DMSO 载体(0.25% 最终体积)或 AX-15836的八点连续稀释系列(起始浓度 15 μM)。对于MM.1S细胞,在添加5nM重组人IL-6之前1小时添加化合物。利用CellTiter-Glo 2.0试剂,3天后计算活细胞的相对数量。 Synergy 2 多模式读取器用于读取发光[1]。
RNA测序细胞样品的制备。[1]
将细胞与0.1%DMSO载体、1μMAX-15836(ERK5抑制剂)、5μM AX15839(ERK5/BRD双重抑制剂)或1μM I-BET762(BRD抑制剂)预孵育1小时。然后在37°C下用各自的激动剂(10μg/mL Pam3CSK4或50 ng/mL EGF)刺激HUVEC和HeLa细胞5小时。使用RNeasy试剂盒将细胞加工成总RNA。 使用Ribo Zero rRNA去除试剂盒从每个样品中去除1微克总RNA。然后,按照制造商推荐的方案,使用NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒为Illumina制备核糖核酸测序文库,并使用标准Illumina TruSeq条形码适配器序列进行条形码。使用Agencourt AMPure XP珠子选择最终库的大小。将纯化的文库合并并加载到Illumina HiSeq2000测序仪上,进行100个碱基的单端测序,读取7个碱基的索引。
动物实验
Male CD-1 mice (∼12 wk old; Envigo) were used in this study. Animals were allowed to acclimate for a minimum of 48 h before the conduction of experiments. All animals were group housed in ventilated cages in the animal facility with regulated temperature from 20 °C to 26 °C and relative humidity at 30–70% with a 12/12-h day/night cycle. Pharmacokinetic studies were performed using fasted mice orally dosed at 50 mg/kg with AX-15836 formulated in 2.5% (vol/vol) dimethylacetamide: in 0.3% (wt/vol) carboxymethylcellulose. Blood was sampled for eight time points over 24 h. [1]
参考文献

[1]. ERK5 kinase activity is dispensable for cellular immune response and proliferation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 18;113(42):11865-11870.

其他信息
Unlike other members of the MAPK family, ERK5 contains a large C-terminal domain with transcriptional activation capability in addition to an N-terminal canonical kinase domain. Genetic deletion of ERK5 is embryonic lethal, and tissue-restricted deletions have profound effects on erythroid development, cardiac function, and neurogenesis. In addition, depletion of ERK5 is antiinflammatory and antitumorigenic. Small molecule inhibition of ERK5 has been shown to have promising activity in cell and animal models of inflammation and oncology. Here we report the synthesis and biological characterization of potent, selective ERK5 inhibitors. In contrast to both genetic depletion/deletion of ERK5 and inhibition with previously reported compounds, inhibition of the kinase with the most selective of the new inhibitors had no antiinflammatory or antiproliferative activity. The source of efficacy in previously reported ERK5 inhibitors is shown to be off-target activity on bromodomains, conserved protein modules involved in recognition of acetyl-lysine residues during transcriptional processes. It is likely that phenotypes reported from genetic deletion or depletion of ERK5 arise from removal of a noncatalytic function of ERK5. The newly reported inhibitors should be useful in determining which of the many reported phenotypes are due to kinase activity and delineate which can be pharmacologically targeted. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H40N8O5S
分子量
648.7756
精确质量
648.28
元素分析
C, 59.24; H, 6.21; N, 17.27; O, 12.33; S, 4.94
CAS号
2035509-96-5
相关CAS号
2035509-96-5
PubChem CID
122705989
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
LogP
2.4
tPSA
140
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
46
分子复杂度/Complexity
1170
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C([H])([H])[H])(N1C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C2C(N(C([H])([H])[H])C2=C([H])N=C(N=C12)N([H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1OC([H])([H])C([H])([H])[H])C(N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])(C([H])([H])C1([H])[H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])[H])C([H])([H])C1([H])[H])=O)=O)(=O)=O
InChi Key
HTFNVAVTYILUCF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H40N8O5S/c1-5-45-28-20-22(30(41)39-14-12-23(13-15-39)38-18-16-36(2)17-19-38)10-11-25(28)34-32-33-21-27-29(35-32)40(46(4,43)44)26-9-7-6-8-24(26)31(42)37(27)3/h6-11,20-21,23H,5,12-19H2,1-4H3,(H,33,34,35)
化学名
2-[2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]anilino]-5-methyl-11-methylsulfonylpyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one
别名
AX15836; AX-15836; 2035509-96-5; AX15,836; AX-15,836; AX 15,836; 2-[2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]anilino]-5-methyl-11-methylsulfonylpyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one; CHEMBL4541479; 2-((2-ethoxy-4-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl)phenyl)amino)-5-methyl-11-(methylsulfonyl)-5,11-dihydro-6H-benzo[e]pyrimido[5,4-b][1,4]diazepin-6-one; 2-(2-Ethoxy-4-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl)phenylamino)-5-methyl-11-(methylsulfonyl)-5H-benzo[e]pyrimido[5,4-b][1,4]diazepin-6(11H)-one; AX 15836
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~154.1 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.85 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.85 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.85 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5414 mL 7.7068 mL 15.4135 mL
5 mM 0.3083 mL 1.5414 mL 3.0827 mL
10 mM 0.1541 mL 0.7707 mL 1.5414 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Differential gene expression in HUVECs and HeLa cells treated with AX15836, AX15839, and I-BET762 indicates lack of effect by selective ERK5 inhibition. Proc Natl Acad Sci U S A . 2016 Oct 18;113(42):11865-11870.
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