Azido-PEG3-azide

别名: AzidoPEG3azide; Azido PEG3 azide 1,11-二叠氮基-3,6,9-三氧杂十一烷;1,11-二叠氮基-3,6,9-三噁十一烷; 叠氮-三聚乙二醇-叠氮;叠氮-四聚乙二醇-叠氮;叠氮-二聚乙二醇-叠氮
目录号: V39421 纯度: ≥98%
Azido-PEG3-azide 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Azido-PEG3-azide CAS号: 101187-39-7
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
500mg
1g
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产品描述
叠氮基-PEG3-叠氮是一种聚乙二醇(PEG)类PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。叠氮基-PEG3-叠氮是一种点击化学试剂。它含有叠氮基(N3)部分,可与带有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可与带有BCN或DBCO基团的化合物发生SPAAC(应变促进炔-叠氮环加成反应)。
叠氮基-PEG3-叠氮(CAS 101187-39-7)是一种同双功能PEG连接剂,其三个PEG单元间隔臂的两端均带有叠氮基。它被归类为用于PROTAC合成的PEG基PROTAC连接剂。叠氮基团能够与含炔烃分子进行铜催化的叠氮-炔环加成(CuAAC)点击化学反应。PEG3间隔基赋予化合物柔性和亲水性。
生物活性&实验参考方法
靶点
Azido-PEG3-azide does not possess a specific pharmacological target of its own. Its function is chemical rather than biological—the two terminal azide groups provide reactive handles for click chemistry conjugation. The compound's role in PROTAC synthesis is structural: it serves as a linker that connects two ligands via azide-alkyne cycloaddition. The PEG3 spacer provides flexibility.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
叠氮-PEG3-叠氮化物本身在体外不具有内在的生物活性。其活性是在完整的PROTAC分子中评估的。叠氮基团能够实现高效的点击化学偶联。
体内研究 (In Vivo)
作为一种非治疗性连接剂,叠氮-PEG3-叠氮化物本身不具有体内活性。其在体内的应用是通过使用该试剂制备的缀合物实现的。
酶活实验
表征方法包括高效液相色谱(HPLC)、核磁共振(NMR)和质谱(MS)。叠氮基团可通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)检测。储存:适用于含叠氮化合物的储存条件。
细胞实验
本研究以细胞为基础,探讨PROTAC介导的蛋白质降解机制。将细胞用含有该连接子的PROTAC处理,并通过Western blot检测靶蛋白的降解情况。
动物实验
在小鼠异种移植模型中,使用含有该连接子的 PROTAC 分子进行体内研究。
药代性质 (ADME/PK)
在完整的 PROTAC 分子背景下表征药代动力学特性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
叠氮基-PEG3-叠氮化物不适用于人类或兽医用途。含叠氮化合物应谨慎处理。应遵循标准的实验室安全操作规程。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
叠氮基-PEG3-叠氮化物是一种基于PEG的PROTAC连接剂和点击化学试剂,用于合成靶向蛋白降解剂。该化合物尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₈H₁₆N₆O₃
分子量
244.25
精确质量
244.128
CAS号
101187-39-7
PubChem CID
4157492
外观&性状
Colorless to light yellow liquid(Density:1.17 g/cm3)
密度
1.1703g/mL
沸点
163-196°C
LogP
0.562
tPSA
127.19
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
236
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(COCCOCCOCCN=[N+]=[N-])N=[N+]=[N-]
InChi Key
SFMMXKLNFMIUCH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C8H16N6O3/c9-13-11-1-3-15-5-7-17-8-6-16-4-2-12-14-10/h1-8H2
化学名
1-azido-2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethane
别名
AzidoPEG3azide; Azido PEG3 azide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~409.42 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.0942 mL 20.4708 mL 40.9417 mL
5 mM 0.8188 mL 4.0942 mL 8.1883 mL
10 mM 0.4094 mL 2.0471 mL 4.0942 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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