BET bromodomain inhibitor 1

目录号: V38708 纯度: ≥98%
BET bromodomaininhibitor 1 是一种口服生物活性、选择性 BET bromodomain 抑制剂(拮抗剂),对于 BRD4 的 IC50 为 2.6 nM。
BET bromodomain inhibitor 1 CAS号: 2411226-02-1
产品类别: New2
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产品描述
BET溴结构域抑制剂1是一种口服生物活性选择性BET溴结构域抑制剂(拮抗剂),对BRD4的IC50值为2.6 nM。BET溴结构域抑制剂1与BRD2(2)、BRD3(2)、BRD4(1)、BRD4(2)和BRDT(2)具有高亲和力结合(Kd值分别为1.3 nM、1.0 nM、3.0 nM、1.6 nM和2.1 nM)。BET溴结构域抑制剂1具有抗癌作用。
BET溴结构域抑制剂1是一种口服有效的选择性小分子抑制剂,可抑制溴结构域和末端外结构域(BET)家族的表观遗传阅读蛋白。它是癌症生物学和表观遗传调控研究的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
BRD4 (IC50 = 2.6 nM), BRD2(2), BRD3(2), BRDT(2); binds with high affinity (Kds 1.0-3.0 nM).
体外研究 (In Vitro)
BET溴结构域抑制剂1(化合物38;31.25-125 nM;24小时)可诱导更显著的G1期细胞周期阻滞[1]。使用BET溴结构域抑制剂1(31.25-500 nM;6或24小时)可有效诱导剂量依赖性的c-Myc表达抑制和p21水平升高[1]。BET溴结构域抑制剂1(31.25-125 nM;6小时)可显著降低c-Myc、BCL-2和CDK6的表达[1]。BET溴结构域抑制剂1不抑制五种细胞色素P450酶(IC50>20 μM)[1]。 BET溴结构域抑制剂1对BRD4(1)的选择性比EP300高约1500倍(IC50=3857 nM),并且对BET溴结构域家族的选择性优于其他溴结构域[1]。BET溴结构域抑制剂1对急性髓系白血病细胞系MV4-11、急性白血病细胞系Kasumi-1和RS-4-11以及多发性骨髓瘤细胞系MM1.S的增殖具有显著的抑制作用,其IC50值分别为2.4、4.8、17.6和15.1 nM[1]。
抑制MV4-11(IC50=2.4 nM)、Kasumi-1(4.8 nM)、RS-4-11(17.6 nM)和MM1.S(15.1 nM)的增殖。诱导G1期阻滞,并以剂量依赖的方式抑制c-Myc表达,同时上调p21表达。选择性比EP300高1500倍。
体内研究 (In Vivo)
化合物38每日口服给药,连续28天,表现出更强的抗癌功效,在BET溴结构域抑制剂1剂量为6.25和12.5 mg/kg时,可完全抑制肿瘤生长(TGI为99.7%)[1]。对于大鼠和小鼠,BET溴结构域抑制剂1(1 mg/kg;静脉注射)的半衰期(T1/2)分别为1.3和0.9小时,清除率(CL)分别为21.5和15.3 mL/min·kg,稳态分布容积(Vss)分别为1464和15.3 mL/min·kg[1]。大鼠口服BET溴结构域抑制剂1(3 mg/kg)后,其曲线下面积(AUC)为884 ng·h/mL,峰浓度(Cmax)为159 ng/mL,半衰期(T1/2)为3.6小时[1]。口服BET溴结构域抑制剂1(1.3 mg/kg)在小鼠中的AUC为1710 ng·h/mL,T1/2为1.3小时,Cmax为399 ng/mL [1]。
每日口服,连续28天;剂量分别为6.25和12.5 mg/kg时,肿瘤生长抑制率(TGI)为99.7%。大鼠药代动力学:半衰期为3.6小时,口服3 mg/kg时AUC为884 ng·h/mL。小鼠药代动力学:半衰期为1.3小时,口服1.3 mg/kg时AUC为1710 ng·h/mL。
酶活实验
采用荧光各向异性或时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)技术,利用重组BRD4(1)和四乙酰化组蛋白H4肽段进行BET溴结构域结合实验。IC50值通过竞争性置换法测定。选择性分析包括BRD2/3/4/T和非BET溴结构域。
细胞实验
细胞周期分析[1]
细胞类型: MV-4-11 细胞
测试浓度: 31.25、62.5、125 nM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 导致更明显的 G1 期细胞周期阻滞。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: MV-4-11 细胞
测试浓度: 31.25、62.5、125、250、500 nM
孵育时间: 6 或 24 小时
实验结果: 诱导剂量依赖性抑制 c-Myc 表达和上调 p21 水平。

RT-PCR[1]
细胞类型: MV-4-11 细胞
测试浓度: 31.25、62.5、125 nM
孵育时间: 6 小时
实验结果: c-Myc、BCL-2 和 CDK6 的表达显著降低。
在急性髓系白血病 (MV4-11) 和多发性骨髓瘤 (MM1.S) 细胞中进行细胞活力/增殖检测。细胞用化合物处理 72 小时;采用 CellTiter-Glo 或 MTS 法测定细胞活力。处理 24 小时后,采用流式细胞术进行细胞周期分析。
动物实验
动物/疾病模型: MV4-11 小鼠异种移植模型 [1]
剂量: 6.25、12.5 mg/kg
给药途径: 口服;每日;28 天
实验结果: 显示出更强的抗肿瘤活性,并完全抑制了肿瘤生长。在 12.5 mg/kg 剂量下,肿瘤生长抑制率 (TGI) 为 99.7%。

动物/疾病模型:雄性SD大鼠[1]
剂量:1 mg/kg(药代动力学/PK/PK分析)
给药途径:静脉注射(iv)
实验结果:T1/2为1.3小时(小时(小时)),CL为21.5 mL/min·kg,Vss为1464 mL/kg。
在免疫缺陷小鼠中建立MV4-11异种移植瘤模型。每日口服一次,连续28天,剂量分别为6.25 mg/kg和12.5 mg/kg。每周测量两次肿瘤体积;计算肿瘤生长指数(TGI)。监测体重和临床症状以评估耐受性。
药代性质 (ADME/PK)
大鼠(1 mg/kg IV):T1/2 1.3h,CL 21.5 mL/min·kg;小鼠(1 mg/kg IV):T1/2 0.9h,CL 15.3 mL/min·kg。大鼠 PO (3 mg/kg):T1/2 3.6h,Cmax 159 ng/mL,AUC 884 ng·h/mL;小鼠 PO (1.3 mg/kg):T1/2 1.3h,Cmax 399 ng/mL,AUC 1710 ng·h/mL。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
BET抑制剂类药物通常伴有剂量限制性毒性(血小板减少症、胃肠道毒性)。化合物1在临床前模型中表现出良好的耐受性;无CYP抑制作用(对5种主要CYP同工酶的IC50>20 μM)。目前尚无该化合物的临床毒性数据。
参考文献

[1]. Discovery of 8-Methyl-pyrrolo[1,2- a]pyrazin-1(2 H)-one Derivatives as Highly Potent and Selective Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Bromodomain Inhibitors. J Med Chem. 2020 Apr 23;63(8):3956-3975.

其他信息
化合物 38 源自一项选择性 BET 抑制剂发现计划。其对 BRD4(1) 的选择性比 EP300 高 1500 倍以上。尚未进入人体试验阶段;目前主要用作表观遗传学和癌症研究的工具。已证实其在啮齿动物体内具有良好的口服生物利用度,且半衰期适中。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H19F2N3O4S
分子量
459.47
精确质量
459.106
CAS号
2411226-02-1
PubChem CID
146047136
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.7
tPSA
98.7
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
821
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCS(=O)(CC1C=NC(OC2C=CC(=CC=2F)F)=C(C2=CC(C)=C3C(NC=CN23)=O)C=1)=O
InChi Key
UETQFSCWDMJWMM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H19F2N3O4S/c1-3-32(29,30)12-14-9-16(18-8-13(2)20-21(28)25-6-7-27(18)20)22(26-11-14)31-19-5-4-15(23)10-17(19)24/h4-11H,3,12H2,1-2H3,(H,25,28)
化学名
6-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(ethylsulfonylmethyl)pyridin-3-yl]-8-methyl-2H-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-1-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~62.5 mg/mL (~136.03 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.44 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1764 mL 10.8821 mL 21.7642 mL
5 mM 0.4353 mL 2.1764 mL 4.3528 mL
10 mM 0.2176 mL 1.0882 mL 2.1764 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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