BI-3663

别名: BI-3663; BI3663; 2341740-84-7; CHEMBL4781145; N-[2-[2-[2-[3-[[2-(2,6-Dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]-3-oxopropoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]-3-methoxy-4-[[4-[(3-oxo-1,2-dihydroinden-4-yl)oxy]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]benzamide;

目录号: V4703 纯度: ≥98%

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BI-3663是一种新型、有效、功能性和高选择性的PTK2/FAK降解剂，基于PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）技术，利用VHL（von Hippel-Lindau）和cereblon配体劫持E3连接酶来降解PTK2。

BI-3663 CAS号: 2341740-84-7
产品类别: New7

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

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纯度: ≥98%

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产品描述
生物活性&实验参考方法
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产品描述

BI-3663是一种新型、有效、功能性和高选择性的PTK2/FAK降解剂，基于PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）技术，利用VHL（von Hippel-Lindau）和cereblon配体劫持E3连接酶来降解PTK2。 BI-3663 抑制 PTK2，IC50 为 18 nM。粘斑酪氨酸激酶 (PTK2) 在人类肝细胞癌 (HCC) 中经常过度表达，一些报告已将 PTK2 耗竭和/或药物抑制与致瘤性降低联系起来。然而，靶向 PTK2 的临床意义仍有待证实。 BI-3663（基于 cereblon）在 11 个 HCC 细胞系中以中值 DC50 30 nM 降解 PTK2，达到 >80%。尽管有效降解 PTK2，这些化合物并没有在任何测试的细胞系中表现出报道的 PTK2 消耗的抗增殖作用。

生物活性&实验参考方法

靶点	PTK2/FAK (DC50 = 30 nM)
体外研究 (In Vitro)	在Hep3B2.1-7细胞和A549细胞中，BI-3663可以有效降解PTK2，pDC50分别为7.6和7.9[1]。
酶活实验	研究人员采用多重等压标记质谱法来评估BI-3663（6）和BI-0319（8）对PTK2降解的细胞选择性，并以定量和无偏见的方式确定潜在的降解目标。在A549细胞中本次分析中定量的6008种蛋白质中，PTK2在用PROTAC处理后显示出明显而显著的丰度变化（图4和表S3）。BI-3663（6）和BI-0319（8）均未诱导其他可检测激酶丰度的任何显著变化，从而证实了激酶家族中这两种降解物的高选择性。值得注意的是，在该数据集中没有检测到抑制剂的两个最突出的激酶脱靶点。有趣的是，BI-0319（8）——但不是BI-3663（6）——也诱导了PDE6D水平的显著变化（图4A），A549细胞中的免疫印迹证实了这一发现（图S1）[1]
细胞实验	A549细胞用递增浓度（100 nM至10µM）的BI-4206（BI-0319的顺式VHL对照）、BI-0319和BI-3663处理18小时。通过蛋白质毛细管电泳测定PTK2和PDE6D水平。[1] 用浓度逐渐增加（10 nM至25µM）的BI-0319处理指定的HCC细胞系18小时。通过蛋白质毛细管电泳测定PTK2水平，并将其标准化为GAPDH。数值以DMSO对照（POC）的百分比表示。使用GraphPad Prism的四参数（可变斜率）抑制模型确定剂量反应曲线。分析中排除了在高PROTAC浓度下优先形成二元复合物导致的超过钩点的PTK2水平的增加。[1] 用浓度逐渐增加（10 nM至25µM）的BI-3663处理指定的HCC细胞系18小时。通过蛋白质毛细管电泳测定PTK2水平，并将其标准化为GAPDH。数值以DMSO对照（POC）的百分比表示。使用GraphPad Prism的四参数（可变斜率）抑制模型确定剂量反应曲线。分析中排除了在高PROTAC浓度下优先形成二元复合物导致的超过钩点的PTK2水平的增加。 [1] 将指定的HCC细胞系用浓度逐渐增加（10 nM至25µM）的BI-3663、BI-0319、PTK2激酶抑制剂BI-4464或多柔比嗪作为阳性对照处理6天。在孵育结束时，通过基于发光的存活率测定来测量细胞存活率。DMSO表示用DMSO对照获得的信号，T0表示在添加化合物之前获得的信号。[1]
参考文献	[1]. Highly Selective PTK2 Proteolysis Targeting Chimeras to Probe Focal Adhesion Kinase Scaffolding Functions. J Med Chem. 2019 Mar 14;62(5):2508-2520.
其他信息	黏着斑酪氨酸激酶2 (PTK2) 在人类肝细胞癌 (HCC) 中常过度表达，多项研究表明 PTK2 的缺失和/或药理学抑制可降低肿瘤发生率。然而，靶向 PTK2 的临床意义仍有待证实。本文报道了两种高选择性且功能性的 PTK2 蛋白水解靶向嵌合体，它们利用 von Hippel-Lindau 和 cereblon 配体劫持 E3 连接酶以降解 PTK2。BI-3663（基于 cereblon）在 11 种 HCC 细胞系中对 PTK2 的降解率 (DC50) 中位数为 30 nM，降解率超过 80%。尽管 PTK2 降解有效，但这些化合物并未在任何测试的细胞系中表现出与 PTK2 缺失相关的抗增殖作用。通过公开这些化合物，我们希望为研究不同生物系统中的 PTK2 降解提供有价值的工具。[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C44H42F3N7O12
分子量	917.839201450348
精确质量	917.284
元素分析	C, 57.58; H, 4.61; F, 6.21; N, 10.68; O, 20.92
CAS号	2341740-84-7
PubChem CID	137628657
外观&性状	Light yellow to yellow solid powder
密度	1.5±0.1 g/cm3
折射率	1.627
LogP	2.31
tPSA	243Å²
氢键供体(HBD)数目	4
氢键受体(HBA)数目	18
可旋转键数目(RBC)	20
重原子数目	66
分子复杂度/Complexity	1760
定义原子立体中心数目	0
InChi Key	ADTXLFJKQHYGPM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C44H42F3N7O12/c1-62-33-22-25(8-10-28(33)51-43-49-23-27(44(45,46)47)40(53-43)66-32-7-2-4-24-9-12-31(55)36(24)32)38(58)48-15-17-64-19-21-65-20-18-63-16-14-35(57)50-29-6-3-5-26-37(29)42(61)54(41(26)60)30-11-13-34(56)52-39(30)59/h2-8,10,22-23,30H,9,11-21H2,1H3,(H,48,58)(H,50,57)(H,49,51,53)(H,52,56,59)
化学名	-[2-[2-[2-[3-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]-3-oxopropoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]-3-methoxy-4-[[4-[(3-oxo-1,2-dihydroinden-4-yl)oxy]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]benzamide
别名	BI-3663; BI3663; 2341740-84-7; CHEMBL4781145; N-[2-[2-[2-[3-[[2-(2,6-Dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]-3-oxopropoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]-3-methoxy-4-[[4-[(3-oxo-1,2-dihydroinden-4-yl)oxy]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]benzamide;
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~300 mg/mL (~326.85 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (8.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 75.0 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +，混匀；然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~300 mg/mL (~326.85 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (8.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 75.0 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +，混匀；然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.0895 mL	5.4476 mL	10.8951 mL
	5 mM	0.2179 mL	1.0895 mL	2.1790 mL
	10 mM	0.1090 mL	0.5448 mL	1.0895 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。