Boc-Dap-NE

别名: Boc-Dap-NE; (S)-2-((1R,2R)-3-(((1S,2R)-1-羟基-1-苯基丙-2-基)氨基)-1-甲氧基-2-甲基-3氧代丙基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
目录号: V2288 纯度: ≥98%
Boc-Dap-NE 是一种二肽,是可切割的 ADC 连接体。
Boc-Dap-NE CAS号: 160800-65-7
产品类别: ADC Linker
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
1g
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产品描述
Boc-Dap-NE 是一种二肽,可作为可裂解的抗体药物偶联物 (ADC) 连接子。Boc-Dap-NE 用于抗体药物偶联物 (ADC) 的合成。
Boc-Dap-NE(CAS 编号:160800-65-7)是一种二肽,用作可裂解的抗体药物偶联物 (ADC) 连接子,用于合成抗体药物偶联物 (ADC)。其分子式为 C23H36N2O5,分子量为 420.55 g/mol。Boc-Dap-NE 是一种受保护的氨基功能化 ADC 连接子中间体,用于合成位点特异性抗体偶联物,以提高药物递送效率和稳定性。该化合物是一种小分子中间体,用于合成单甲基澳瑞他汀 E (MMAE),MMAE 是一种常用的 ADC 细胞毒性有效载荷。 Boc(叔丁氧羰基)保护基在合成过程中提供稳定性,必要时可在酸性条件下脱除。NE(硝基或其他官能团)部分可能参与共轭反应。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cleavable Linker
The molecular target of Boc-Dap-NE is not a biological target per se, as it is a chemical linker used in the synthesis of ADCs rather than a therapeutic agent. In the context of an ADC, the linker connects the antibody (which targets a cell surface antigen) to the cytotoxic drug payload. Boc-Dap-NE is a cleavable linker that is designed to release the drug payload upon enzymatic cleavage in the target cell. The dipeptide structure may be recognized and cleaved by lysosomal proteases such as cathepsin B, which are overexpressed in many cancer cells. The Boc-protected amino group provides stability during synthesis and can be deprotected when needed for conjugation. The ultimate biological target of the complete ADC would be the specific antigen recognized by the antibody, which could be HER2, CD30, CD33, or other tumor-associated antigens. The linker's role is to deliver the cytotoxic payload specifically to tumor cells, thereby maximizing efficacy and minimizing systemic toxicity.
体外研究 (In Vitro)
抗体药物偶联物 (ADC) 由抗体和 ADC 细胞毒素组成,二者通过 ADC 连接子连接。
Boc-Dap-NE 的体外活性并非作为独立化合物进行评估,因为它是一种连接子分子而非治疗药物。其活性是在完整的 ADC 体系中进行评估的,其中连接子的作用是将细胞毒性有效载荷递送至靶细胞。在基于细胞的检测中,使用 Boc-Dap-NE 构建的 ADC 将针对表达靶抗原的癌细胞系进行抗原特异性细胞毒性测试。通过测量 ADC 的效力 (IC50) 与游离药物的比较以及对抗原阳性细胞与抗原阴性细胞的选择性来评估连接子的效率。此外,还会评估连接子在血清中的稳定性,以确保药物不会过早释放。利用重组酶或细胞裂解液在体外评估组织蛋白酶B或其他溶酶体蛋白酶对连接子的切割效率。具体的IC50值取决于抗体、药物有效载荷和靶抗原。
体内研究 (In Vivo)
在动物模型中,Boc-Dap-NE 连接子在完整抗体药物偶联物 (ADC) 中的体内活性评估正在进行。含有该连接子的 ADC 将在异种移植模型中进行测试,即将表达靶抗原的人类肿瘤细胞植入免疫缺陷小鼠体内。ADC 将以 1 至 30 mg/kg 的剂量进行静脉给药,通常每周或每两周给药一次,持续 2 至 4 周。将测量肿瘤生长抑制情况以及生存期延长情况。还将评估连接子的体内稳定性、药代动力学和生物分布。含有可裂解连接子(例如 Boc-Dap-NE)的 ADC 旨在将药物有效载荷特异性地释放到肿瘤细胞内,从而最大限度地提高疗效并最大限度地降低全身毒性。ADC 的体内疗效取决于抗体的靶向性、药物有效载荷的效力以及连接子在肿瘤微环境中的裂解效率。
酶活实验
对于使用 Boc-Dap-NE 进行体外连接子偶联和稳定性测定,采用以下方案:将抗体(例如曲妥珠单抗)在 37°C 下用 TCEP(三(2-羧乙基)膦)还原 2 小时,以在半胱氨酸残基上生成游离巯基。使用 Ellman 试剂测定游离巯基的数量。将 Boc-Dap-NE 溶解于 DMSO 中,并以 5-10:1 的摩尔比(连接子:抗体)加入到含有 20 mM 组氨酸(pH 5.5)和 2 mM EDTA 的缓冲液中,与还原后的抗体反应。偶联反应在室温下进行 1-2 小时。通过透析或尺寸排阻色谱法去除过量的连接子。所得抗体药物偶联物 (ADC) 通过 HIC-HPLC、SEC-HPLC 和 LC-MS 进行表征,以确定药物抗体比 (DAR)。稳定性研究中,将抗体药物偶联物(ADC)在37°C下于人血浆或血清中孵育长达7天,并通过SEC-HPLC分析样品以监测聚集情况,并通过LC-MS评估药物释放。组织蛋白酶B裂解实验中,将连接子与重组组织蛋白酶B在含有二硫苏糖醇(DTT)的醋酸盐缓冲液(pH 5.5)中于37°C下孵育2-24小时,并通过HPLC定量释放的药物。
细胞实验
对于含有Boc-Dap-NE的抗体药物偶联物(ADC)的体外细胞实验,通常采用以下方案:将靶抗原阳性的癌细胞(例如,HER2阳性的SK-BR-3或BT-474细胞)和抗原阴性的细胞(例如,MDA-MB-468细胞)在37°C、5% CO₂的条件下于合适的培养基中培养。将细胞以每孔5,000-10,000个细胞的密度接种于96孔板中,并使其过夜贴壁。将ADC在培养基中进行系列稀释,最终浓度范围为0.001至100 μg/mL(基于抗体浓度)。用ADC处理细胞72-120小时。使用CellTiter-Glo或MTT法评估细胞活力。IC50值根据剂量反应曲线计算得出。为进行机制研究,将细胞用抗体药物偶联物(ADC)处理24-48小时,并使用Annexin V/PI染色通过流式细胞术评估细胞凋亡。细胞周期分析采用碘化丙啶染色。ADC的特异性通过其对抗原阴性细胞无活性以及与过量未偶联抗体的竞争性结合来证实。ADC的细胞内转运通过荧光标记抗体的共聚焦显微镜进行评估。
动物实验
对于含有Boc-Dap-NE的抗体偶联药物(ADC)的体内动物研究,通常采用以下方案:将5-10 × 10⁶个靶抗原阳性肿瘤细胞(例如,针对HER2的BT-474或NCI-N87)皮下注射到雌性无胸腺裸鼠(6-8周龄,18-22 g)的侧腹部。当肿瘤体积达到约100-200 mm³时,将小鼠随机分组(每组n=8-10)。在第1、8、15和22天(每周一次,持续3-4周),通过尾静脉注射ADC,剂量分别为1、3、10和30 mg/kg。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积,并计算公式为(长度×宽度²)/2。监测体重以评估毒性。研究结束时,切除肿瘤,称重,并进行组织病理学和免疫组织化学分析。采集血样进行药代动力学分析,以测量抗体药物偶联物(ADC)浓度、总抗体和释放的药物。
其他信息
Boc-Dap-NE(CAS号:160800-65-7)是一种可裂解的抗体药物偶联物(ADC)连接子,分子式为C23H36N2O5,分子量为420.55 g/mol。它用于抗体药物偶联物(ADC)的合成,也是MMAE合成的中间体。未来的研究方向可以集中在优化该连接子的稳定性和裂解效率、开发具有更高治疗指数的新型ADC,以及探索其与不同抗体和有效载荷联合应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H36N2O5
分子量
420.542346954346
精确质量
420.26
元素分析
C, 65.69; H, 8.63; N, 6.66; O, 19.02
CAS号
160800-65-7
相关CAS号
Boc-Dap-NE;160800-65-7
PubChem CID
20777964
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.7
tPSA
88.1
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
570
定义原子立体中心数目
5
SMILES
C[C@H]([C@H]([C@@H]1CCCN1C(=O)OC(C)(C)C)OC)C(=O)N[C@H](C)[C@H](C2=CC=CC=C2)O
InChi Key
XJDVGABQIFOWFC-SCQOQHIRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H36N2O5/c1-15(21(27)24-16(2)19(26)17-11-8-7-9-12-17)20(29-6)18-13-10-14-25(18)22(28)30-23(3,4)5/h7-9,11-12,15-16,18-20,26H,10,13-14H2,1-6H3,(H,24,27)/t15-,16-,18+,19-,20-/m1/s1
化学名
tert-butyl (S)-2-((1R,2R)-3-(((1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl)amino)-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl)pyrrolidine-1-carboxylate
别名
Boc-Dap-NE;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~237.79 mM)
H2O: < 0.1 mg/mL (Insoluble)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 10% DMSO+ 40% PEG300+ 5% Tween-80+ 45% saline: ≥ 2.5 mg/mL (5.94 mM)

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3779 mL 11.8895 mL 23.7790 mL
5 mM 0.4756 mL 2.3779 mL 4.7558 mL
10 mM 0.2378 mL 1.1889 mL 2.3779 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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