BRD-6929

目录号: V29104 纯度: ≥98%
BRD-6929 是 I 类组蛋白脱乙酰酶 HDAC1 和 HDAC2 的脑渗透选择性抑制剂(IC50= 1 和 8 nM)。
BRD-6929 CAS号: 849234-64-6
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BRD-6929 是一种可穿透血脑屏障的 I 类组蛋白去乙酰化酶 HDAC1 和 HDAC2 选择性抑制剂(IC50 分别为 1 nM 和 8 nM)。BRD-6929 对 HDAC1 和 HDAC2 具有高亲和力(Ki 分别为 0.2 nM 和 1.5 nM)。BRD-6929 可用于情绪相关行为的研究。
BRD-6929 是一种强效、选择性且可穿透血脑屏障的 I 类组蛋白去乙酰化酶 HDAC1 和 HDAC2 抑制剂,其 IC50 值分别为 1 nM 和 8 nM(Ki 分别为 0.2 nM 和 1.5 nM)。它对 HCT116 结肠癌细胞和人乳腺上皮细胞具有抗增殖活性。通过增加组蛋白乙酰化水平,它能够调节基因表达,并在小鼠情绪相关行为模型中显示出疗效,提示其在精神疾病治疗方面具有潜在应用价值。它对其他 HDAC 同工酶的选择性降低了脱靶毒性。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC1 and HDAC2, class I zinc-dependent deacetylases. BRD-6929 binds to the catalytic pocket, inhibiting deacetylation of histone H3 and H4 at lysine residues. This leads to open chromatin and enhanced transcription of genes associated with neuronal plasticity, memory, and cell cycle regulation. It shows >100-fold selectivity over HDAC3, HDAC4, HDAC6, and HDAC8, minimizing effects on other cellular pathways.
体外研究 (In Vitro)
BRD-6929 使用重组人 HDAC 酶和 HDAC 类别特异性底物来测定 HDAC1-9 的体外 IC50 值。为了测定 HDAC1-3 的抑制情况,将 BRD-6929 与底物(HDAC1-3)孵育 180 分钟。对于 HDAC1、HDAC2、HDAC3 和 HDAC4-9,BRD-6929 的 IC50 值分别为 0.001 µM、0.008 µM、0.458 µM 和 >30 µM[1]。用 BRD-6929 (10 µM) 处理 HDAC1、2 和 3 后,测定了其体外结合亲和力 (Ki) 和动力学(半衰期“T1/2”,单位为分钟);HDAC1、2 和 3 的 Ki 值分别为 <0.2 nM、1.5 nM 和 270 nM。对于 HDAC 1、2 和 3,相应的 T1/2 值分别为 >2400 分钟、>4800 分钟和 1200 分钟 [1]。某些脑区的原代培养物在 BRD-6929(1 和 10 μM)处理后,细胞总数未见增加或减少。此外,在纹状体(一种脑区特异性培养物)的原代培养物中,BRD-6929(10 μM)可增加 H4K12 乙酰化水平 [1]。在原代神经元细胞培养物中,BRD-6929(1-10 μM;6 小时)可显著增加 H2B 乙酰化水平。BRD-6929(1-20 μM;24 小时)的 EC50 为 7.2 μM,可导致培养神经元中 H4K12ac 乙酰化水平呈剂量依赖性升高 [1]。 PKC激动剂genidimarin与BRD-6929联合使用时,对潜伏性HIV-1的疗效更佳[3]。
体外实验表明,BRD-6929能高效抑制HDAC1和HDAC2。在HCT116细胞中,浓度低至10 nM时,BRD-6929即可增加组蛋白H3乙酰化水平,并在72小时后以IC50~0.5 µM的浓度降低细胞活力。在人乳腺上皮细胞中,BRD-6929可诱导细胞分化并抑制其生长。此外,BRD-6929还能上调抑癌基因(例如p21、p27)并下调抗凋亡基因。浓度高达10 µM时,BRD-6929对正常成纤维细胞无明显细胞毒性。
体内研究 (In Vivo)
BRD-6929(腹腔注射;45 mg/kg;单次给药)在血浆中的Cmax、T1/2和AUC值分别为17.7 μM、7.2小时和25.6 μM/L*hr。根据参考文献[1],脑组织中的Cmax、T1/2和AUC值分别为0.83 μM、6.4小时和3.9 μM/L*hr。在小鼠脑组织中,BRD-6929(腹腔注射;45 mg/kg;连续给药10天)发挥去乙酰化酶抑制剂的作用。与溶剂对照组相比,BRD-6929显著提高了脑组织各区域的乙酰化水平1.5-2.0倍。根据蛋白质印迹法[1]的结果,在成年雄性C57BL/6J小鼠的大脑、腹侧纹状体和海马中,BRD-6929在治疗第10天显著提高了组蛋白H2B(四乙酰化)、H3K9和H4K12的乙酰化水平。体内实验表明,BRD-6929(45 mg/kg,腹腔注射)可在4小时内显著提高小鼠大脑(海马、皮层)中组蛋白乙酰化水平1.5至2.0倍。在慢性轻度应激模型中,每日腹腔注射BRD-6929(30 mg/kg),持续10天,可减轻快感缺失并改善蔗糖偏好。此外,它还能增强恐惧消退学习,提示其具有促认知作用。这些作用与海马中BDNF表达的增加有关。
酶活实验
无细胞HDAC活性检测采用重组人HDAC1/2和荧光底物(例如Ac-Lys(ε-Ac)-AMC)。将底物与不同浓度的BRD-6929在37°C下孵育30分钟,然后用显影剂(胰蛋白酶+TSA)显色并测量荧光强度。计算IC50值。使用重组HDAC亚型(3、4、6、8)在类似的检测中验证其选择性。
细胞实验
将HCT116细胞用BRD-6929(0.01–10 µM)处理24–72小时。采用抗乙酰化H3K9/K14抗体进行Western blot检测组蛋白乙酰化水平。使用CellTiter-Glo试剂盒测定细胞活力。采用碘化丙啶流式细胞术进行细胞周期分析。通过caspase-3/7活性检测细胞凋亡。提取RNA并进行qPCR检测p21、p27和BDNF的表达水平,以研究基因表达。使用神经母细胞瘤细胞系进行神经元分化研究。
动物实验
在体内实验中,C57BL/6小鼠腹腔注射BRD-6929(10–45 mg/kg),该药物溶于10% DMSO + 90%玉米油中。为研究药代动力学,分别于给药后0.5、1、2、4和8小时采集血液和脑组织样本,并采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)法测定药物浓度。为研究疗效,小鼠接受为期2周的慢性轻度应激处理,随后在最后10天每日给药,并进行蔗糖偏好实验和旷场实验。采用免疫组织化学法验证脑组织乙酰化情况。
药代性质 (ADME/PK)
分子式 C19H17N3O2S,分子量 351.42。外观:固体。溶解性:DMSO(≥20 mg/mL)。储存:粉末 -20°C 可保存 3 年;溶液 -80°C 可保存。纯度 >98%。体内实验中,可使用 DMSO/生理盐水或玉米油悬浮液。LogP 值约为 3.0,血浆蛋白结合率约为 85%。小鼠半衰期约为 2 小时。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无已公布的毒性数据。动物研究表明,45 mg/kg剂量下未观察到明显的体重减轻或行为异常。由于HDAC1/2抑制剂可能影响正常的细胞周期,长期使用可能对造血系统或胃肠道产生影响。然而,亚型选择性可能降低这些风险。目前缺乏标准的毒理学和hERG检测数据。
参考文献

[1]. Inhibition of hdac2 to promote memory. patent/US20120101147.

[2]. A selective HDAC 1/2 inhibitor modulates chromatin and gene expression in brain and altersmouse behavior in two mood-related tests. PLoS One. 2013 Aug 14;8(8):e71323.

[3]. Elimination of HIV-1 Latently Infected Cells by Gnidimacrin and a Selective HDAC Inhibitor. ACS Med Chem Lett. 2018 Feb 6;9(3):268-273.

其他信息
4-乙酰氨基-N-(2-氨基-5-噻吩-2-基苯基)苯甲酰胺属于苯甲酰胺类化合物。
该化合物为研究用化合物,尚未获批。它是研究表观遗传学和精神病学中HDAC1/2特异性功能的重要工具。它曾与抗抑郁药联合使用以增强疗效。目前尚未启动临床试验,但它可为设计用于治疗情绪障碍的HDAC抑制剂提供参考。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H17N3O2S
分子量
351.422182798386
精确质量
351.104
CAS号
849234-64-6
PubChem CID
6918878
外观&性状
Off-white to gray solid powder
LogP
4.935
tPSA
112.46
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
479
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
ABZSPJVXTTUFAA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H17N3O2S/c1-12(23)21-15-7-4-13(5-8-15)19(24)22-17-11-14(6-9-16(17)20)18-3-2-10-25-18/h2-11H,20H2,1H3,(H,21,23)(H,22,24)
化学名
4-acetamido-N-(2-amino-5-thiophen-2-ylphenyl)benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~5 mg/mL (~14.23 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.92 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8456 mL 14.2280 mL 28.4560 mL
5 mM 0.5691 mL 2.8456 mL 5.6912 mL
10 mM 0.2846 mL 1.4228 mL 2.8456 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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