BRD-8000.3

目录号: V41424 纯度: ≥98%
BRD-8000.3是一种特异性EfpA抑制剂,是一种窄谱杀菌(杀细菌)抗菌剂,具有良好的野生型活性。
BRD-8000.3 CAS号: 2365504-95-4
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BRD-8000.3 是一种特异性 EfpA 抑制剂,也是一种窄谱杀菌剂,具有良好的野生型活性。BRD-8000.3 可用于结核病 (TB) 相关研究。
BRD-8000.3 是一种窄谱杀菌性抗分枝杆菌药物,它是一种特异性的非竞争性抑制剂,可抑制结核分枝杆菌 (Mtb) 必需的外排泵 EfpA(MFS 转运蛋白)。该药物旨在杀灭耐药性结核分枝杆菌,是研究外排泵生物学和开发耐多药结核病 (MDR-TB) 治疗方法的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
EfpA (Mtb efflux pump). BRD-8000.3 specifically inhibits EfpA, an essential major facilitator superfamily (MFS) transporter in Mycobacterium tuberculosis that functions as a lipid flippase, playing a key role in cell envelope biogenesis and drug tolerance. The compound is an uncompetitive inhibitor, meaning it binds to the EfpA-substrate complex rather than the free enzyme. This inhibition disrupts lipid transport and efflux activity, leading to bacterial cell death.
体外研究 (In Vitro)
BRD-8000.3 是一种窄谱杀菌抗分枝杆菌药物,具有良好的野生型活性,可特异性抑制 EfpA [1]。
在无细胞生化分析中,BRD-8000.3 可直接抑制 EfpA 外排泵。结合实验采用纯化的 EfpA 蛋白,通常将其重组到脂质体系统中。转运活性通过包裹荧光底物(如 NBD-磷脂酰胆碱或 pH 敏感染料)来测定,并监测化合物阻断底物转运的能力。动力学分析证实了非竞争性抑制,结果表明该抑制剂仅与酶-底物复合物结合,导致 Km 和 Vmax 均降低。
体内研究 (In Vivo)
BRD-8000.3 对复制型结核分枝杆菌具有杀菌作用,最低抑菌浓度 (MIC) 为 2 ug/mL。它具有窄谱抗菌活性,对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均无活性,这与 EfpA 抑制的特异性相符。该化合物对药物敏感和耐药的结核分枝杆菌菌株均有效,使其成为治疗持续性感染的有效工具。此外,它与一线抗结核药物联合使用可增强其疗效。
酶活实验
为了确认与 EfpA 的结合并评估非竞争性抑制,可以使用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC)。将纯化的 EfpA 蛋白固定在芯片或细胞中。注入浓度递增的 BRD-8000.3 (0.1-100 uM) 以测量结合亲和力。对于非竞争性动力学,在固定浓度的抑制剂(例如 2 uM)和不同浓度的已知底物(例如荧光脂质)存在下测量 EfpA 的活性。所得的 Lineweaver-Burk 图将显示平行线,这是非竞争性抑制的特征。Ki 值由截距计算得出。
细胞实验
采用微量肉汤稀释法在96孔板中测定最小抑菌浓度(MIC)。结核分枝杆菌(例如H37Rv菌株)培养于添加了OADC增菌剂和Tween 80的Middlebrook 7H9肉汤中。BRD-8000.3的浓度范围为0.0625-32 ug/mL,采用2倍系列稀释法进行测试。将菌悬液加入最终接种量约为5×10⁵ CFU/mL的培养基中。将培养板置于37℃培养7-14天。MIC定义为抑制可见细菌生长的最低化合物浓度。对于时间-杀菌曲线,用2-4倍MIC处理细菌,并在不同时间点取样涂布于琼脂平板上计数菌落形成单位(CFU),以确认其杀菌活性。
动物实验
BRD-8000.3 的体内疗效可在慢性结核病感染小鼠模型中进行评估。小鼠(例如 BALB/c 小鼠)经气溶胶途径感染结核分枝杆菌。感染建立后(例如 4 周),小鼠每日接受 BRD-8000.3 治疗,剂量范围为 10-100 mg/kg,可通过灌胃或腹腔注射给药,持续 4-8 周。主要终点是肺和脾脏中的细菌载量(菌落形成单位计数),通过匀浆化器官并在琼脂平板上进行系列稀释涂布法测定。对肺组织进行组织病理学分析,以评估炎症和组织损伤。
药代性质 (ADME/PK)
BRD-8000.3 的正式药代动力学研究尚未广泛发表。该化合物的分子量为 401.30,预测 LogP 值约为 4-5,在 DMSO 中的溶解度为 50 mg/mL (124.6 mM)。用于体内给药时,通常将其配制成 DMSO:PEG300:Tween-80:生理盐水溶剂。根据其化学结构,预计该化合物具有中等的口服生物利用度,并能分布到包括肺在内的组织中,而肺是结核分枝杆菌感染的主要部位。该化合物具有足够的药代动力学特征,可在小鼠模型中达到治疗浓度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
BRD-8000.3 的临床前毒理学数据有限。在小鼠治疗相关剂量(例如 10-50 mg/kg)的疗效研究中,该化合物通常耐受性良好,未报告明显的体重减轻或急性毒性迹象。由于其对结核分枝杆菌 (Mtb) 的活性谱较窄,因此对宿主微生物群的脱靶效应可能很小。然而,尚未发表正式的重复给药毒性研究。作为一种实验性化学品,应采取适当的安全预防措施进行操作,包括使用通风橱和个人防护装备 (PPE),以避免吸入或皮肤接触。
参考文献

[1]. Large-Scale Chemical-Genetic Strategy Enables the Design of Antimicrobial Combination Chemotherapy in Mycobacteria. ACS Infect Dis. 2020;6(1):56-63.

其他信息
BRD-8000.3 的化学名称为 (1S,3S)-N-[6-溴-5-(嘧啶-2-基)吡啶-2-基]-2,2-二甲基-3-(2-甲基丙-1-烯-1-基)环丙烷-1-甲酰胺。它是一种结核分枝杆菌 (Mtb) 外排泵 EfpA 的特异性抑制剂,也是一种窄谱杀菌剂。该化合物用于结核病研究,尤其是在解决耐药性问题方面。在存在该抑制剂的情况下,已解析出 EfpA 蛋白在 2.9 埃和 3.4 埃分辨率下的结构,结果表明 EfpA 形成反平行二聚体。BRD-8000.3 未获准用于人体,仅供实验室研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H21BRN4O
分子量
401.30
精确质量
400.089
CAS号
2365504-95-4
PubChem CID
162641020
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
4
tPSA
67.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
526
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C/C(/C)=C/[C@@H]1C(C)(C)[C@H]1C(=O)NC1N=C(Br)C(C2=NC=CC=N2)=CC=1
InChi Key
XIITZGMKUBIQRI-DZGCQCFKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H21BrN4O/c1-11(2)10-13-15(19(13,3)4)18(25)24-14-7-6-12(16(20)23-14)17-21-8-5-9-22-17/h5-10,13,15H,1-4H3,(H,23,24,25)/t13-,15+/m0/s1
化学名
(1S,3S)-N-(6-bromo-5-pyrimidin-2-ylpyridin-2-yl)-2,2-dimethyl-3-(2-methylprop-1-enyl)cyclopropane-1-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~124.60 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4919 mL 12.4595 mL 24.9190 mL
5 mM 0.4984 mL 2.4919 mL 4.9838 mL
10 mM 0.2492 mL 1.2460 mL 2.4919 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们