BX517

别名: BX-517; BX 517; BX517; PDK1 inhibitor2; PDK1 inhibitor 2; PDK1 inhibitor-2 脲基-3-(1-(吡咯-2-基)亚乙基)吲哚-2-酮
目录号: V4912 纯度: ≥98%
BX-517(也称为 PDK1 抑制剂 2)是一种有效的 ATP 竞争性选择性 PDK1 抑制剂,IC50 值为 6 nM。
BX517 CAS号: 850717-64-5
产品类别: PDPK1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
BX-517(也称为 PDK1 抑制剂 2)是一种有效的 ATP 竞争性选择性 PDK1 抑制剂,IC50 值为 6 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDK1 (IC50 = 6 nM)
Phosphoinositide-dependent kinase-1 (PDK1) (IC50: single-digit nM in cAKT2 assay; IC50: similar single-digit nM in direct PDK1 enzyme assay)

Protein kinase A (PKA) (IC50: 1600 nM) [1]
体外研究 (In Vitro)
BX-517 可防止肿瘤细胞激活 Akt[2]。
BX-517 在无细胞的、PDK1介导的AKT2活化实验 (cAKT2) 中表现出对PDK1的强效抑制活性,IC值为个位数纳摩尔范围。 [1]
BX-517 在滤膜结合法直接PDK1激酶实验中,也显示出相当的抑制效力 (IC50为个位数纳摩尔)。 [1]
在PC-3人前列腺癌细胞中,BX-517 以亚微摩尔效力抑制PDK1依赖的Akt蛋白Thr308位点磷酸化 (P-AKT),IC值范围在100至1000纳摩尔之间。 [1]
BX-517 对PDK1相较于密切相关的激酶PKA表现出优异的选择性 (320倍)。 此外,它对另外七种丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸激酶也显示出高度选择性 (>100倍)。 [1]
体内研究 (In Vivo)
BX517的药学特性较差,包括半衰期短(大鼠体内0.4小时)、代谢稳定性低、溶解度差[2]。
酶活实验
PDK1介导的AKT2活化实验 (cAKT2): 这是一个偶联的闪烁亲近测定法 (SPA)。 非活性AKT2在测试化合物、[γ-³²P]ATP和AKT2特异性生物素化肽底物存在下,与PDK1和磷脂酰肌醇-3,4-二磷酸 (PtdIns-3,4-P2) 共同孵育进行原位活化。 随后,磷酸化的生物素化肽产物被链霉亲和素包被的SPA珠子捕获,用于放射性检测。 该实验可鉴定AKT2活化的抑制剂,以及PDK1或AKT2的直接抑制剂。 [1]
直接PDK1酶实验: 直接测量PDK1抑制活性。 将PDK1酶与肽底物、[γ-³²P]ATP和测试化合物一起孵育。 反应终止后,磷酸化的肽产物被P81磷酸纤维素滤膜捕获。 通过磷屏成像定量滤膜上保留的放射性,其对应于磷酸化水平。 [1]
细胞实验
抑制PC-3细胞中Akt磷酸化: 用不同浓度的测试化合物孵育PC-3人前列腺癌细胞。 孵育一段时间后,裂解细胞。 随后对细胞裂解物进行标准免疫印迹 (Western blot) 分析。 使用针对Akt蛋白Thr308位点磷酸化 (P-Thr308) 的特异性磷酸化抗体来检测Akt的活化水平。 通过测量化合物对此磷酸化信号的抑制程度来确定其细胞活性。 [1]
动物实验
Pharmacokinetic Study in Rats: For intravenous (iv) pharmacokinetic assessment, BX-517 was administered to three rats at a dose of 2 mg/kg via intravenous injection. For oral (po) bioavailability assessment, BX-517 was administered to three rats at a dose of 10 mg/kg orally. Blood samples were collected over time to determine plasma concentration profiles. [1]
药代性质 (ADME/PK)
BX-517 displayed poor solubility in aqueous media, specifically 2 mg/L in phosphate-buffered saline (PBS). [1]
In rats, after a 2 mg/kg intravenous dose, BX-517 had a short plasma half-life (t1/2) of 24 minutes. [1]
The plasma clearance (Cl) in rats was high, at 31 mL/min/kg. [1]
Oral bioavailability in rats was very low, at less than 1% following a 10 mg/kg oral dose. [1]
参考文献

[1]. Bioorg Med Chem Lett. 2007 Jul 15;17(14):3814-8.

[2]. Bioorg Med Chem Lett. 2007 Jul 15;17(14):3819-25.

其他信息
Phosphoinositide-dependent kinase-1 (PDK1) is a key activator of Akt/PKB and other AGC family kinases (like PKC, SGK, S6K1), which are involved in tumor cell growth, survival, and angiogenesis. Inhibiting PDK1 is a strategy for cancer therapy. [1]
BX-517 was optimized from a high-throughput screening hit (compound 1). The key optimization involved introducing a urea substituent at the 5-position of the indolinone core, which directly hydrogen-bonds with Lys111 and Thr222 in the PDK1 ATP-binding pocket, significantly enhancing potency and selectivity compared to earlier analogs like the 5-hydroxyl compound (2a). [1]
An X-ray co-crystal structure of BX-517 bound to PDK1 (PDB: 2PE1) confirms the binding mode: the indolinone core makes three hydrogen bonds with the hinge region (backbone of Ser160 and Ala162), and the 5-urea group forms direct hydrogen bonds with the side chains of Lys111 and Thr222. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H14N4O2
分子量
282.29700
精确质量
282.112
元素分析
C, 63.82; H, 5.00; N, 19.85; O, 11.33
CAS号
850717-64-5
相关CAS号
850717-64-5
PubChem CID
11161844
外观&性状
Light yellow to khaki solid powder
LogP
3.299
tPSA
100.01
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
488
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(NC1C=C2C(NC(C2=C(C)C2NC=CC=2)=O)=CC=1)N
InChi Key
DFURSNCTQGJRRX-JYRVWZFOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H14N4O2/c1-8(11-3-2-6-17-11)13-10-7-9(18-15(16)21)4-5-12(10)19-14(13)20/h2-7,17H,1H3,(H,19,20)(H3,16,18,21)/b13-8-
化学名
[(3Z)-2-oxo-3-[1-(1H-pyrrol-2-yl)ethylidene]-1H-indol-5-yl]urea
别名
BX-517; BX 517; BX517; PDK1 inhibitor2; PDK1 inhibitor 2; PDK1 inhibitor-2
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 27~56 mg/mL (95.6~198.4 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5423 mL 17.7117 mL 35.4233 mL
5 mM 0.7085 mL 3.5423 mL 7.0847 mL
10 mM 0.3542 mL 1.7712 mL 3.5423 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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