| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| 50mg |
|
||
| 100mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
- Binds directly to the DNA-binding domain of p53 (Kd = 60 ± 20 nM), near Ser240 and Ser241, disrupting the p53-MDM2 interaction and preventing p53 ubiquitination and degradation. [1]
- Upregulates Btf (Bcl-2-associated transcription factor), which represses MDM2 transcription and modulates p53, BAX, and Bcl-2 pathways. [2] C16 ceramide targets cellular membranes and signaling pathways involved in apoptosis and stress responses. As a lipid second messenger, it activates ceramide-activated protein kinase and induces phosphorylation of epidermal growth factor receptor. It also activates a cytosolic serine/threonine protein phosphatase. C16 ceramide incorporates into the mitochondrial outer membrane and forms channels that increase its permeability, promoting apoptosis. Its levels are correlated with increased apoptosis. |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
C16-神经酰胺(水溶性吡啶衍生物PC16,1-5 μM)在A549、HCT116和HepG2细胞中以剂量依赖的方式诱导p53表达上调、核转位以及下游靶基因p21和PUMA的激活。[1] - 纯化的重组p53在下拉实验中与生物素标记的C16-神经酰胺结合。荧光滴定显示其具有高亲和力结合,Kd = 60 ± 20 nM。PC6(C6-吡啶神经酰胺)不结合。[1] - 膜结合实验表明,p53对C16-神经酰胺的亲和力远高于其他酰基链长度(C12、C18、C20、C22、C24)、C16-二氢神经酰胺或PC6。 [1]
- 光活化神经酰胺 (PAC) 可共价修饰 p53 的 Ser240 和 Ser241 位点(AScore 1000)。在这些残基上引入庞大侧链的突变(S240K、S241K、S241E)可消除神经酰胺的结合;而 S240E 或 S241A 突变则不影响神经酰胺的结合。[1] - 神经酰胺的结合提高了 p53 DNA 结合域的热稳定性(Tm 从 41.6°C 升高至 43.2°C)。[1] - PC16 (5 μM) 可破坏活 PC-3 细胞中的 p53-MDM2 复合物(双分子荧光互补实验),其作用与 Nutlin 3 (50 μM) 类似。ELISA 实验表明,p53-MDM2 相互作用的丧失呈浓度依赖性(PC16 浓度为 0–100 nM)。 [1] - PC16 (60–100 nM) 在体外泛素化实验中抑制 p53 泛素化,其效果与 Nutlin 3 (80 nM) 相当。[1] - 在 HCT116 细胞中,C16-神经酰胺 (12 μM,6 小时) 以时间和浓度依赖的方式降低细胞活力(6 小时后存活率约为 60%)。PARP 裂解、pro-caspase 3 减少和 Annexin V/PI 染色证实了细胞凋亡。 [2] - 2D-DIGE蛋白质组学分析鉴定出C16-神经酰胺(12 μM,6 h)处理后51种差异表达蛋白,包括Btf(1.24~1.85倍)和prohibitin(1.48倍)上调,以及stratifin(2.77倍)和stathmin(1.11倍)下调。Western blot实验证实了这些变化。[2] - C16-神经酰胺(12 μM)可增加p53表达(15~30 min内),上调BAX,并降低Mdm2和磷酸化Bcl-2水平。[2] - Btf过表达(GFP-Btf转染)可使细胞活力降低约20%,增加p53和BAX,并降低磷酸化Bcl-2水平。 Btf 敲低(siRNA)可增强细胞对神经酰胺诱导的细胞死亡的抵抗力,并使 caspase 3/7 活性降低高达 60%。[2] - C16-神经酰胺可降低 MDM2 启动子活性(6 小时降低约 40%)和 Mdm2 蛋白水平(降低 1.85 倍)。Btf 过表达也可降低 MDM2 启动子活性(约 40%)和 Mdm2 蛋白水平(降低 1.30 倍)。神经酰胺处理后,Btf 沉默可增加 MDM2 启动子活性。[2] p53 和 C16-神经酰胺在其核心结构域内相互作用。在细胞中,p53 与天然 C16-神经酰胺结合形成复合物 [1]。C16-神经酰胺(2.5–50 μM;0-48 小时)以浓度和时间依赖的方式显著降低 HCT116 细胞的活力 [2]。 Btf(Bcl-2相关转录因子)是C16-神经酰胺(12 μM;48小时)诱导HCT116细胞凋亡的机制[2]。C16-神经酰胺(12 μM;0-6小时)和Btf的表达均上调p53和BAX的表达。C16-神经酰胺通过Btf抑制Mdm2的表达[2]。体外实验表明,C16-神经酰胺是一种内源性神经酰胺,可作为脂质第二信使调节细胞凋亡和应激信号通路。它能激活神经酰胺活化蛋白激酶,诱导表皮生长因子磷酸化,并激活胞质丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶。在分离的人中性粒细胞中,PPMP或MAPP可增加C16-神经酰胺的水平,且C16-神经酰胺水平的升高与细胞凋亡的增加相关。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
所提供的文献中未报告C16神经酰胺的直接体内数据。然而,细胞中CerS6(神经酰胺合成酶6)的表达可提高内源性C16神经酰胺水平并激活p53。[1] 在体内,C16神经酰胺是一种天然存在的鞘脂,在细胞信号传导和膜结构中发挥着关键作用。神经酰胺水平可用作炎症或特定疾病的生物标志物。C16神经酰胺在细胞凋亡、应激反应和疾病中的作用已被广泛研究。然而,现有文献中尚未详细描述C16神经酰胺作为治疗药物的具体体内疗效数据。
|
| 酶活实验 |
荧光猝灭:在 270 nm 激发波长下记录纯化的 p53 核心结构域 (1.0 μM) 的稳态荧光光谱。通过增加 PC16 或 PC6 (10–2000 nM) 的浓度来测量荧光猝灭。Kd 值通过对 304 nm 处的发射光谱进行非线性拟合来确定。[1]
- 膜结合实验:将神经酰胺 (0.5–4 μg) 点样于 PVDF 膜上,用 3% BSA 封闭,与纯化的 p53 或细胞裂解液在 4°C 下孵育过夜,并用 p53 特异性抗体检测结合的 p53。[1] - 热变性实验:将 p53 DBD (100–300 aa) 与 PAC 或不与 PAC 孵育,并测量熔解温度 (Tm)。 [1] - 体外泛素化实验:反应体系包含 p53、E1、E2、MDM2、Mg²⁺-ATP 和泛素,并添加或不添加 PC16(60、80、100 nM)或 Nutlin 3(80 nM),于 37°C 孵育 1 小时,然后进行 SDS-PAGE/WB 分析。[1] - 夹心 ELISA:将 p53 多克隆抗体包被的 96 孔板与 p53/MDM2 混合物孵育,并添加或不添加 PC16 或 Nutlin 3。使用 MDM2 单克隆抗体和 HRP 标记的二抗检测结合的复合物。 [1] - 鞘脂的液相色谱-串联质谱分析:使用异丙醇/水/乙酸乙酯 (30:10:60) 提取脂质。样品根据蛋白质水平或脂质磷酸盐含量进行标准化。[1] - 二维差异凝胶电泳 (2D-DIGE):将对照组和 C16 神经酰胺处理组 (12 μM,6 h) 的细胞中的蛋白质 (25 μg) 用 Cy3/Cy5 标记,与 Cy2 标记的内标混合,在 pH 3–10 NL IPG 胶条和 12% 丙烯酰胺凝胶上进行分离,扫描后用 DeCyder 软件进行分析。[2] 对于体外生化分析,将 C16 神经酰胺溶解于合适的溶剂中,用于处理细胞或细胞裂解液。神经酰胺激活蛋白激酶活性可通过在ATP存在下,将细胞裂解液与C16神经酰胺和底物(例如髓鞘碱性蛋白)孵育来测定。磷酸化可通过放射自显影或蛋白质印迹法检测。细胞凋亡可通过测定caspase活性或Annexin V染色来评估。 |
| 细胞实验 |
细胞活力测定[2]
细胞类型: HCT116 细胞 测试浓度: 2.5、5、10、12、20、50 µM 孵育时间: 0-48 小时 实验结果: 细胞活力随时间和浓度的增加而显著降低。 蛋白质印迹分析[2] 细胞类型: HCT116 细胞 测试浓度: 12 μM 孵育时间: 1、3 和 6 小时 实验结果: PARP 裂解增加,pro-caspase 3 减少。stratifin 和 stathmin 水平降低,抑制素和 Btw 水平升高。处理后,RNAi 介导的 Btf 耗竭也部分抑制了 BAX 的表达。荧光素酶活性和 Mdm2 蛋白表达水平显著降低。 细胞活力(MTS 法):将 HCT116 细胞接种于 96 孔板中,用 C16-神经酰胺(2.5–50 μM,1.5–48 小时)处理,然后加入 MTS/PMS,于 37°C 孵育 2 小时。在 492 nm 处测量吸光度。[2] - 细胞凋亡检测(Annexin V/PI):用 Annexin V-FLUOS 和碘化丙啶染色 15 分钟,并通过共聚焦显微镜观察。 [2] - 蛋白质印迹:用 1% SDS 或 RIPA 缓冲液裂解细胞,经 SDS-PAGE 电泳分离后转移至 PVDF 膜,用针对 p53、PARP、caspase-3、Btf、Mdm2、BAX、磷酸化 Bcl-2、stratifin、stathmin、prohibitin 和 α-微管蛋白的抗体进行检测。[1][2] - 双分子荧光互补 (BiFC):将共转染 p53-V1 和 MDM2-V2 的 PC-3 细胞用 PC16 (5 μM) 或 Nutlin 3 (50 μM) 处理 18 小时,并进行荧光成像。[1] - siRNA 沉默:使用特异性 siRNA 沉默 CerS6 或 p53;使用随机序列 siRNA 作为对照。使用 ON-TARGETplus SMARTpool siRNA 沉默 Btf 基因。转染采用脂质体转染试剂进行。[1][2] - 瞬时转染和荧光素酶活性检测:将 HCT116 细胞转染 MDM2-LUC 或 TP53-LUC 报告基因构建体和 GFP-Btf 表达载体。转染 24 小时后检测荧光素酶活性,并以蛋白浓度进行标准化。[2] - Caspase 3/7 活性检测:将转染 GFP siRNA 或 Btf siRNA 的细胞用 C16-神经酰胺处理,并使用发光法 Caspase-Glo 3/7 检测试剂盒检测 caspase 3/7 活性。[2] 对于基于细胞的检测,细胞用浓度范围为 1-100 µM 的 C16-神经酰胺处理。细胞凋亡可通过检测半胱天冬酶活性、Annexin V染色或DNA片段化来评估。线粒体通透性可通过使用JC-1等荧光染料测量线粒体膜电位或检测细胞色素c释放来评估。神经酰胺水平可通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)法测定。 |
| 动物实验 |
对于体内研究,通常会使用炎症、细胞凋亡或代谢性疾病的动物模型。组织中C16神经酰胺的水平可以通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术作为生物标志物进行测定。然而,C16神经酰胺通常不作为体内治疗药物使用。它的主要用途是用于研究鞘脂信号传导和细胞凋亡。
|
| 药代性质 (ADME/PK) |
C16神经酰胺可溶于乙醇(5 mg/ml,温热)和DMF(约0.15 mg/ml)。建议在-20°C下储存以保证长期稳定性。该化合物仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全操作规程。
|
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
在HCT116细胞中,C16-神经酰胺(12 μM,6 h)可使细胞活力降低约40%。更高浓度(20–50 μM)则导致更大的毒性。[2] p53缺陷细胞(PC-3)和p53沉默细胞对C16-神经酰胺的毒性不敏感。[1] 由于C16-神经酰胺是一种内源性脂质和研究试剂,而非治疗药物,因此其毒理学数据尚未得到广泛报道。高浓度神经酰胺可诱导细胞凋亡,并可能具有细胞毒性。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。
|
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
C16-神经酰胺是一种由神经酰胺合成酶6 (CerS6) 生成的天然鞘脂。它能直接与p53 DNA结合域结合(Kd ∼60 nM),这是此前未知的生理代谢物激活p53的机制。这种相互作用会破坏p53-MDM2复合物,阻止p53的泛素化和降解,从而导致p53的积累并激活下游靶点。[1] 神经酰胺的结合位点位于p53的Box V基序附近,Box V是MDM2的二级接触区域。神经酰胺酰基链的C10原子靠近Ser240和Ser241。[1] 在表达CerS6的细胞中检测到了与p53结合的内源性C16-神经酰胺,但在对照细胞中未检测到。仅发现C16-神经酰胺(而非其他神经酰胺种类,如C18、C20、C22、C24和dhC16)与p53形成复合物。[1] 血清饥饿或叶酸应激可提高CerS6和C16-神经酰胺的水平,进而激活p53。CerS6的沉默可阻止这种反应。[1] Btf(BCLAF1)是一种核蛋白,可与Bcl-2和Bcl-xL相互作用。它作为转录抑制因子和促凋亡因子发挥作用。在神经酰胺通路中,Btf表达上调并抑制MDM2的转录,从而促进p53的稳定。 [2] N-十六烷酰鞘氨醇是一种N-酰基鞘氨醇,其中神经酰胺的N-酰基被指定为十六烷酰基(棕榈酰基)。它是生殖支原体和人血清的代谢产物。它是一种N-酰基鞘氨醇、Cer(d34:1)和N-棕榈酰鞘氨醇碱基。它在功能上与十六烷酸相关。据报道,N-棕榈酰鞘氨醇存在于日本锥虫和布氏锥虫中,并且有相关数据。C16神经酰胺(N-棕榈酰鞘氨醇)是一种丰富的内源性鞘脂,在细胞凋亡和应激信号传导中作为脂质第二信使发挥作用。它由神经酰胺合成酶6生成,并在线粒体外膜上形成通道。C16神经酰胺是一种用于研究鞘脂信号传导和细胞凋亡的研究工具,尚未获准用于临床。
|
| 分子式 |
C34H67NO3
|
|---|---|
| 分子量 |
537.900691270828
|
| 精确质量 |
537.512
|
| CAS号 |
24696-26-2
|
| 相关CAS号 |
C16-Ceramide-d31;852043-41-5;C16-Ceramide-13C16;C16-Ceramide-d9;2260669-51-8
|
| PubChem CID |
5283564
|
| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
|
| 密度 |
0.919g/cm3
|
| 沸点 |
675.396ºC at 760 mmHg
|
| 熔点 |
94-95ºC
|
| 闪点 |
362.267ºC
|
| 蒸汽压 |
0mmHg at 25°C
|
| 折射率 |
1.48
|
| LogP |
9.953
|
| tPSA |
69.56
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
3
|
| 可旋转键数目(RBC) |
30
|
| 重原子数目 |
38
|
| 分子复杂度/Complexity |
508
|
| 定义原子立体中心数目 |
2
|
| SMILES |
CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@@H](/C=C/CCCCCCCCCCCCC)O
|
| InChi Key |
YDNKGFDKKRUKPY-TURZORIXSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C34H67NO3/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-19-21-23-25-27-29-33(37)32(31-36)35-34(38)30-28-26-24-22-20-18-16-14-12-10-8-6-4-2/h27,29,32-33,36-37H,3-26,28,30-31H2,1-2H3,(H,35,38)/b29-27+/t32-,33+/m0/s1
|
| 化学名 |
N-[(E,2S,3R)-1,3-dihydroxyoctadec-4-en-2-yl]hexadecanamide
|
| 别名 |
C16 Ceramide; C16-ceramide; DTXSID301317974; RefChem:573083; ...; 24696-26-2;
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
Ethanol : ~20 mg/mL (~37.18 mM; warming and heat to 60°C)
DMSO: < 1 mg/mL DMF : 20 mg/mL (~37.18 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (3.72 mM) (饱和度未知) in 10% EtOH + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.0 mg/mL 澄清 EtOH + 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8591 mL | 9.2954 mL | 18.5908 mL | |
| 5 mM | 0.3718 mL | 1.8591 mL | 3.7182 mL | |
| 10 mM | 0.1859 mL | 0.9295 mL | 1.8591 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。