| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CDK12-IN-2 targets cyclin-dependent kinase 12 (CDK12), a kinase that regulates transcription elongation and RNA processing by phosphorylating Ser2 of the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II. CDK12 also plays a critical role in the expression of genes involved in DNA damage response and homologous recombination repair. CDK12-IN-2 is a potent inhibitor with an IC50 of 52 nM for CDK12. It also inhibits CDK13, the closest homologue of CDK12, and shows selectivity over CDK2 (>100 μM), CDK7 (>10 μM), and CDK9 (16 μM). By inhibiting CDK12, the compound suppresses transcription of DNA repair genes and induces synthetic lethality in cancer cells with homologous recombination defects.
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| 体外研究 (In Vitro) |
在亚微摩尔浓度下，CDK12-IN-2 可抑制 SK-BR-3 细胞中 CTD Ser2 的磷酸化。其 IC50 值为 185 nM，可抑制 C-rest 结构域 Ser2 的磷酸化。与 SK-CDK12-IN-2 相比，CDK12-IN-2 可抑制 BR-3 细胞的增殖，其 IC50 值为 0.8 μM [1]。CDK12-IN-2 对 CDK12 的抑制作用具有时间特异性。其 IC50 值分别为 0.0078 μM、0.042 μM、0.057 μM 和 0.059 μM，对应 0 小时、1 小时、2 小时和 5 小时 [1]。
CDK12-IN-2 是一种高效且选择性的纳摩尔级 CDK12 抑制剂，其 IC50 值为 52 nM。它也是一种强效的 CDK13 抑制剂。该化合物对 CDK2、9、8 和 7 具有优异的激酶选择性。CDK12-IN-2 可抑制 RNA 聚合酶 II C 端 Ser2 位点的磷酸化。它可用作化学探针，用于研究 CDK12 在转录调控、DNA 修复通路和合成致死性实验中的功能。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
CDK12-IN-2在体内有望通过抑制CDK12介导的DNA修复基因转录发挥抗肿瘤活性，从而导致同源重组修复受损，并增加细胞对DNA损伤剂的敏感性。该化合物可能诱导DNA修复通路存在缺陷的癌细胞发生合成致死。然而，由于CDK12-IN-2主要是一种体外研究工具，因此其详细的体内疗效数据有限。该化合物在癌症研究中被广泛用于研究转录调控和DNA修复通路。
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| 酶活实验 |
CDK12-IN-2 激酶抑制活性测定采用重组 CDK12/细胞周期蛋白 K 酶复合物和合适的肽底物。该测定通常采用荧光或放射性测定法来测量激酶活性。将 CDK12-IN-2 与酶、底物和 ATP（浓度为 Km）在测定缓冲液中孵育 30-60 分钟。终止反应后，定量分析产物生成量。IC50 值由浓度-效应曲线计算得出。通过筛选 CDK12-IN-2 对一系列相关激酶（包括 CDK2、CDK7、CDK8、CDK9 和 CDK13）的抑制活性来评估其选择性。
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| 细胞实验 |
CDK12抑制的细胞实验通常采用癌细胞系。细胞用不同浓度的CDK12-IN-2处理24-72小时。使用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。采用磷酸化特异性抗体（anti-RNA Pol II Ser2P）通过Western blot检测RNA聚合酶II CTD Ser2的磷酸化水平。通过qPCR或RNA-seq分析基因表达变化，重点关注参与DNA修复的CDK12靶基因（例如BRCA1、FANCI、ATM）。通过测量γ-H2AX灶的形成来评估DNA损伤。细胞周期分析采用碘化丙啶染色法。
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| 动物实验 |
CDK12-IN-2 的体内疗效研究通常包括对荷瘤小鼠进行给药（口服或腹腔注射）。肿瘤生长抑制情况在异种移植模型中进行评估。药效学标志物，例如 RNA 聚合酶 II Ser2 磷酸化和 CDK12 靶基因的表达，会在肿瘤组织中进行检测。然而，由于 CDK12-IN-2 主要是一种用于体外研究的工具，因此已发表的详细体内研究方案有限。动物模型中激酶抑制剂评估的标准方案适用。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
CDK12-IN-2 的分子量为 532.6 g/mol，分子式为 C28H29ClN8O？（确切分子式可能有所不同）。该化合物具有良好的理化性质，可用作化学探针。它可溶于 DMSO，长期稳定性应储存于 -20°C。在细胞实验中，该化合物的常用浓度为 0.1-10 μM。对于体内研究，则需要使用合适的制剂。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于 CDK12-IN-2 仍处于研究阶段，其毒理学数据有限。作为一种靶向转录调控的激酶抑制剂，其潜在毒性可能包括对正常细胞增殖和基因表达的影响。该化合物应在实验室中采取适当的安全预防措施进行操作。在细胞培养中，CDK12-IN-2 的常用浓度为 10 μM 以下，短期实验中通常耐受性良好。任何治疗性药物的开发都需要进行标准的临床前安全性评估。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
CDK12-IN-2 是一种高效、选择性极强的纳摩尔级 CDK12 抑制剂，具有良好的理化性质。它同时也是一种强效的 CDK13 抑制剂。该化合物对 CDK2、9、8 和 7 具有优异的激酶选择性。CDK12-IN-2 广泛应用于癌症研究，用于研究转录调控、DNA 修复通路和合成致死策略。它为肿瘤学和治疗靶点验证研究提供了一种有价值的化学探针。
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| 分子式 |
C32H32N6O2
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|---|---|
| 分子量 |
532.635486602783
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| 精确质量 |
532.258
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| CAS号 |
2244987-03-7
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| PubChem CID |
134813906
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
4.2
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| tPSA |
101
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
7
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| 重原子数目 |
40
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| 分子复杂度/Complexity |
979
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O=C(NCC1C=CC=CC=1)N(C1C=CC(C2C=CC(N(C)C=2)=O)=CC=1)C1CCC(CC1)NC1C=CC(C#N)=CN=1
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| InChi Key |
HDJBGURZVALLMD-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C32H32N6O2/c1-37-22-26(10-18-31(37)39)25-8-13-28(14-9-25)38(32(40)35-20-23-5-3-2-4-6-23)29-15-11-27(12-16-29)36-30-17-7-24(19-33)21-34-30/h2-10,13-14,17-18,21-22,27,29H,11-12,15-16,20H2,1H3,(H,34,36)(H,35,40)
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| 化学名 |
3-benzyl-1-[4-[(5-cyanopyridin-2-yl)amino]cyclohexyl]-1-[4-(1-methyl-6-oxopyridin-3-yl)phenyl]urea
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~50 mg/mL (~93.87 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.69 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.69 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8774 mL | 9.3872 mL | 18.7744 mL | |
| 5 mM | 0.3755 mL | 1.8774 mL | 3.7549 mL | |
| 10 mM | 0.1877 mL | 0.9387 mL | 1.8774 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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