CDK9-IN-2

别名: CDK9-In-2; CDK9 Inhibitor 2; CDK9 Inhibitor II N2'-(反式-4-氨基环己基)-5'-氯-N6-[(3-氟苯基)甲基]-[2,4'-联吡啶]-2',6-二胺;CDK9-IN-2
目录号: V17783 纯度: ≥98%
CDK9-IN-2 是一种特异性 CDK9 抑制剂。
CDK9-IN-2 CAS号: 1263369-28-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
CDK9-IN-2 是一种特异性 CDK9 抑制剂。更多详情,请查阅专利 WO/2012131594A1 中的化合物 CDKI(8)。CDK9-IN-2 对 H929 多发性骨髓瘤 (MM) 细胞系(72 小时)和 A2058 黑色素瘤细胞系(72 小时)的 IC50 值分别为 5 nM 和 7 nM。
CDK9-IN-2 是细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (CDK9) 的特异性抑制剂。它在 H929 多发性骨髓瘤细胞中的 IC50 值为 5 nM,在 A2058 黑色素瘤细胞中的 IC50 值为 7 nM(72 小时)。该化合物提取自专利 WO/2012131594A1(化合物 CDKI(8))。通过靶向 CDK9,它破坏了 CDK9 与细胞周期蛋白 T1 之间的相互作用,导致 RNA 聚合酶 II C 端结构域的磷酸化减少。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK9-IN-2 targets cyclin-dependent kinase 9 (CDK9), a key regulator of transcription elongation. CDK9 forms a complex with cyclin T1 (P-TEFb) and phosphorylates the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II, which is essential for productive transcription elongation. By inhibiting CDK9, the compound disrupts this process, leading to decreased transcription of genes, including those critical for cancer cell survival.
体外研究 (In Vitro)
CDK9-IN-2 (200 nM) 可降低 MEPCE 的表达,提示 MEPCE 可作为所有 CDK9 抑制剂的药效学 (PD) 标志物。治疗后,MCL1 蛋白表达在两小时内下降,且在暴露于 500 nM CDK9-IN-2 后,这种下降持续了 16 小时 [1]。
CDK9-IN-2 是一种特异性 CDK9 抑制剂,在多种癌细胞系中均具有强效活性。其在 H929 多发性骨髓瘤细胞中的 IC50 为 5 nM,在 A2058 黑色素瘤细胞中的 IC50 为 7 nM(72 小时)。该化合物可抑制 CDK9 介导的 RNA 聚合酶 II 磷酸化,从而导致转录减少和细胞死亡。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中关于 CDK9-IN-2 的具体体内活性数据并不详尽。作为一种强效的 CDK9 抑制剂,它在多发性骨髓瘤和黑色素瘤细胞系中均显示出活性,因此具有治疗这些癌症的潜力。需要开展进一步的研究来评估其体内疗效和药代动力学特性。
酶活实验
CDK9-IN-2 作为 CDK9 抑制剂的活性通过体外激酶活性测定进行评估。这些测定测量化合物抑制 CDK9/cyclin T1 磷酸化活性的能力。IC50 值由剂量反应曲线确定。此外,还进行了针对其他激酶的选择性分析,以评估其特异性。
细胞实验
CDK9-IN-2 的细胞活性检测包括用该化合物处理癌细胞系(例如 H929、A2058),并测量细胞增殖和活力。该化合物抑制 CDK9 介导的 RNA 聚合酶 II 磷酸化的能力通过蛋白质印迹分析进行评估。
动物实验
CDK9-IN-2的体内动物模型研究方案包括将其给药于荷瘤小鼠,特别是多发性骨髓瘤和黑色素瘤模型小鼠。研究将评估该化合物的抗肿瘤疗效、对转录的影响以及药代动力学特性。
药代性质 (ADME/PK)
CDK9-IN-2 的分子量为 425.9,分子式为 C23H25ClFN5,为浅黄色固体。现有文献中关于其具体药代动力学数据尚不详尽。作为一种小分子抑制剂,其药代动力学性质需要在临床前研究中进行评估。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
CDK9-IN-2 的毒理学特征尚未得到充分阐明。作为一种研究化合物,它仅供研究用途,不得用于人体。临床开发需要进行标准的安全性评估。
参考文献

[1]. Pharmacodynamic markers associated with cyclin-dependent kinase inhibitors. From PCT Int. Appl. (2012), WO 2012131594A1.

其他信息
CDK9-IN-2(CAS号:1263369-28-3)是一种用于研究CDK9在转录和癌症中作用的研究化合物。它是一种特异性CDK9抑制剂,对多发性骨髓瘤和黑色素瘤细胞系具有强效活性。该化合物尚未获准用于临床,仅作为研究用化学品供应。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H25CLFN5
分子量
425.9364
精确质量
425.178
CAS号
1263369-28-3
PubChem CID
49855228
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
6.076
tPSA
75.86
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
518
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
XKHXPTSUVPZYDW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H25ClFN5/c24-20-14-28-23(29-18-9-7-17(26)8-10-18)12-19(20)21-5-2-6-22(30-21)27-13-15-3-1-4-16(25)11-15/h1-6,11-12,14,17-18H,7-10,13,26H2,(H,27,30)(H,28,29)
化学名
4-N-[5-chloro-4-[6-[(3-fluorophenyl)methylamino]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl]cyclohexane-1,4-diamine
别名
CDK9-In-2; CDK9 Inhibitor 2; CDK9 Inhibitor II
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~117.39 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3477 mL 11.7387 mL 23.4775 mL
5 mM 0.4695 mL 2.3477 mL 4.6955 mL
10 mM 0.2348 mL 1.1739 mL 2.3477 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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