CeMMEC13

别名: CeMMEC-13; CeMMEC 13; CeMMEC13
目录号: V17878 纯度: ≥98%
CeMMEC13 是 TAF1 的选择性抑制剂。
CeMMEC13 CAS号: 1790895-25-8
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
CeMMEC13 是一种选择性 TAF1 抑制剂。CeMMEC13 作用于 TAF1 的溴结构域,但不与 BRD4、BRD9 或 CREBBP 的溴结构域结合。CeMMEC13 和 (+)-JQ1 可抑制 THP-1 和 H23 肺腺癌细胞的增殖。
CeMMEC13 是一种高效且选择性的小分子抑制剂,可抑制 TATA 盒结合蛋白相关因子 1 (TAF1) 的第二个溴结构域 (BD2)。TAF1 是通用转录因子 IID (TFIID) 的关键组成部分,在转录起始调控中发挥着重要作用。CeMMEC13 是一种异喹啉酮类化合物,可作为一种有价值的化学探针,用于阐明 TAF1 溴结构域的生物学功能并探索其治疗潜力。TAF1 的异常表达与多种疾病相关,包括癌症。 CeMMEC13 提供了一种剖析非 BET 溴结构域生物学的工具,从而能够开展与 BRD4 靶向药物不同的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
TAF1 ( IC50 = 2.1 μM )
TAF1 (TATA-box binding protein-associated factor 1). CeMMEC13 selectively targets the second bromodomain (BD2) of TAF1. Bromodomains are protein modules that recognize and bind to acetylated lysine residues on histones and other proteins, recruiting regulatory complexes to chromatin and influencing gene expression. By binding to TAF1-BD2, CeMMEC13 competitively inhibits its interaction with acetylated histones, leading to the disruption of TAF1-dependent transcriptional programs. CeMMEC13 shows little or no effects on other bromodomains such as BRD4, BRD9, CREBBP, or EP300.
体外研究 (In Vitro)
CeMMEC13 的 IC50 值为 2.1 μM,是 TAF1(2) 溴结构域的新型抑制剂。CeMMEC13 对 BRD4、CREBBP 和 REDNESS 的影响可忽略不计或无影响。CeMMEC13 (0–20 μM) 与 (S)–JQ1 联用可有效降低 H23 和 THP1 细胞的活力,同时增加 REDS3 细胞中 RFP 的表达,其效果优于单独使用 CeMMEC13[1]。体外实验表明,CeMMEC13 是 TAF1(2) 溴结构域的强效抑制剂,IC50 值为 2.1 μM。等温滴定量热法 (ITC) 测定其 Kd 值约为 0.160 μM。该化合物对 REDNESS、BRD4 和 CREBBP 的影响很小或无影响。 CeMMEC13 (0-20 μM) 与 (S)-JQ1 联合使用可增加 REDS3 细胞中 RFP 的表达,并能有效降低 H23 和 THP1 细胞的活力,其效果优于单独治疗。
体内研究 (In Vivo)
CeMMEC13的体内活性数据正在不断涌现。一项全基因组CRISPR筛选发现TAF1C是脂质沉积的表观遗传决定因子,而CeMMEC13作为TAF1抑制剂,可显著减轻体内肝脂肪变性。敲低TAF1C也能改善体外和体内脂肪变性肝细胞中的脂质积累。这些发现表明,CeMMEC13在代谢功能障碍相关脂肪肝(MASLD)模型中具有潜在的体内疗效。
酶活实验
CeMMEC13的抑制活性和选择性已通过多种生化分析方法进行了表征。用于测定其效力的主要方法是均相时间分辨荧光(HTRF)分析,该方法测得其IC50值为2.1 μM。采用等温滴定量热法(ITC)测定了CeMMEC13与TAF1-BD2的结合亲和力(Kd),结果约为0.160 μM。针对其他溴结构域(例如BRD4和CREBBP)的选择性分析通常使用类似的HTRF或其他竞争性结合分析方法,以确认其对TAF1的特异性(2)。
细胞实验
CeMMEC13 的细胞活性检测包括用该化合物处理多种细胞系,以评估其对基因表达和细胞活力的影响。在 H23(肺腺癌)和 THP-1(急性单核细胞白血病)细胞中,CeMMEC13 已被证实能够降低细胞活力,尤其是在与 BET 抑制剂 JQ1 联合使用时。该化合物调节 TAF1 依赖性转录程序的能力可以通过 qRT-PCR 或 RNA-seq 检测靶基因的表达来研究。染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验可用于评估 CeMMEC13 对 TAF1 在基因启动子上的结合情况的影响。
动物实验
CeMMEC13的体内动物模型方案仍在开发中。一项研究利用CeMMEC13探讨了TAF1C在肝脂肪变性中的作用。在该模型中,研究人员可能给小鼠服用CeMMEC13以评估其缓解脂质积累的效果。然而,现有文献并未详细说明具体的给药方案、给药途径和治疗持续时间。因此,需要开展进一步的研究来建立CeMMEC13的标准化体内实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献中关于CeMMEC13的具体药代动力学数据并不详尽。作为一种研究用化学探针,其药代动力学性质可能尚未针对体内应用进行充分优化。该化合物在DMSO中的溶解度为62 mg/mL (184.33 mM),但不溶于水。通常以粉末形式储存于-20°C,保质期长达3年。该化合物的分子量为336.34。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
CeMMEC13的毒理学特性尚未得到充分研究。作为一种研究用化学探针,其安全性尚未得到充分表征。该化合物仅供研究使用,未经批准用于人体。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Mapping the chemical chromatin reactivation landscape identifies BRD4-TAF1 cross-talk. Nat Chem Biol. 2016 Jul;12(7):504-10.

其他信息
CeMMEC13(CAS号:1790895-25-8)是一种高效且选择性的小分子TAF1第二溴结构域抑制剂。它是一种异喹啉酮类化合物,分子量为336.34。CeMMEC13可作为一种重要的化学探针,用于阐明TAF1溴结构域的生物学功能,并探索其在癌症和代谢功能障碍相关性脂肪肝(MASLD)等疾病中的治疗潜力。本品为白色至类白色固体粉末,仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H16N2O4
分子量
336.35
精确质量
336.11
元素分析
C, 67.85; H, 4.80; N, 8.33; O, 19.03
CAS号
1790895-25-8
相关CAS号
1790895-25-8
PubChem CID
110694558
外观&性状
Solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
541.4±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
281.2±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.4 mmHg at 25°C
折射率
1.673
LogP
2.69
tPSA
67.9
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
576
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O1CCOC2C=CC(=CC1=2)NC(C1=CC(N(C)C2C=CC=CC=21)=O)=O
InChi Key
NXKBPGZQDHACPZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H16N2O4/c1-21-15-5-3-2-4-13(15)14(11-18(21)22)19(23)20-12-6-7-16-17(10-12)25-9-8-24-16/h2-7,10-11H,8-9H2,1H3,(H,20,23)
化学名
N-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-1-methyl-2-oxoquinoline-4-carboxamide
别名
CeMMEC-13; CeMMEC 13; CeMMEC13
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 16.7~67 mg/mL(49.6~199.2 mM)
Ethanol : 6 mg/mL (~17.8 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9731 mL 14.8655 mL 29.7309 mL
5 mM 0.5946 mL 2.9731 mL 5.9462 mL
10 mM 0.2973 mL 1.4865 mL 2.9731 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们