CID-1067700

别名: 2-[[(苯甲酰基氨基)硫代甲酰]氨基]-4,7-二氢-5,5-二甲基-5H-噻吩并[2,3-C]吡喃-3-羧酸
目录号: V30948 纯度: ≥98%
CID-1067700 (CID1067700) 是一种新型、有效的泛 GTP 酶抑制剂,可以竞争性抑制大脑 7 (Rab7) 中的 Ras 相关蛋白,Ki 为 13 nM。
CID-1067700 CAS号: 314042-01-8
产品类别: New2
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产品描述
CID-1067700 (CID1067700) 是一种新型、有效的泛 GTP 酶抑制剂,可以竞争性抑制大脑中 Ras 相关蛋白 7 (Rab7),Ki 为 13 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点

Ki: 13 nM (Rab7)[1]
- Rab7 GTPase (Ki = 1.1 μM)[1]

体外研究 (In Vitro)
CID-1067700 (ML282) 是一种泛 GTP 酶抑制剂,Ki 为 13 nM,以竞争性方式抑制 Rab7。 Rab7 核苷酸结合被 CID-1067700 抑制,BODIPY-GDP 和 BODIPY-GTP 的 Kd 值分别为 40 nM 和 100 nM。随着浓度升高,CID-1067700 显着抑制 BODIPY 连接的核苷酸结合。 BODIPY-GTP 的 EC50 值为 11.22 nM,而 BODIPY-GDP 的 EC50 值为 20.96 ± 1.34 nM。 Ki 的计算值分别为 19.70 和 12.89 nM。 M. 在平衡结合设置下,CID-1067700 (10 μM) 对野生型 Rab7 结合的 BODIPY 连接核苷酸的释放速率没有影响 [1]。在 B 细胞中,CID-1067700 (0–40 μM) 抑制 AID 诱导、NF-κB 激活和 Rab7 活性。此外,CID-1067700 靶向 Rab7,以高亲和力 (EC50=10–20 nM) 与其结合,并防止 B 细胞中的类别转换 DNA 重组 (CSR) [2]。
- Rab7 GTP酶活性抑制:CID-1067700是Rab7的竞争性核苷酸结合抑制剂,抑制GTP水解活性,Ki值为1.1 μM;在浓度高达100 μM时,对其他Rab蛋白(Rab1、Rab5、Rab6、Rab8、Rab11)的GTP酶活性无显著抑制作用[1]
- B细胞类转换重组(CSR)抑制:CID-1067700(1、5、10 μM)以浓度依赖方式抑制LPS + IL-4刺激的小鼠脾B细胞向IgA和IgG1亚型转换,RT-PCR检测显示CSR相关基因(Aicda、Prdm1)表达降低[2]
- 浆细胞存活抑制:CID-1067700(5、10 μM)在体外诱导小鼠原代浆细胞和浆母细胞凋亡,膜联蛋白V/PI双阳性细胞比例增加,抗凋亡蛋白Mcl-1表达降低[2]
- Rab7亚细胞定位破坏:CID-1067700(10 μM)处理可破坏HeLa细胞中Rab7介导的晚期内体-溶酶体融合,导致晚期内体积聚和溶酶体降解功能受损[1]
体内研究 (In Vivo)
通过抑制 Rab7,CID-1067700(ML282;16 mg/kg,腹腔注射)可阻止狼疮易发小鼠疾病的进展,并降低 MRL/Faslpr/lpr 小鼠中的 IgG-IC 沉积。此外,CID-1067700 还专注于 B 细胞,直接损害人体的 CSR 机制 [2]。
- 小鼠狼疮模型(MRL/lpr小鼠):腹腔注射CID-1067700(10 mg/kg,每周3次,持续4周)可显著降低血清抗dsDNA自身抗体和类风湿因子(RF)水平[2]
- 小鼠狼疮模型(MRL/lpr小鼠):CID-1067700处理可减轻狼疮性肾炎,表现为肾小球免疫复合物沉积减少、肾脏组织损伤评分降低、肾功能改善(蛋白尿减少)[2]
- 小鼠狼疮模型(MRL/lpr小鼠):CID-1067700可减少脾脏浆细胞和生发中心B细胞数量,下调脾脏组织中浆细胞分化关键转录因子Blimp-1和IRF4的表达[2]
酶活实验
- Rab7 GTP水解实验:重组Rab7蛋白与不同浓度(0.1-100 μM)的CID-1067700在30℃预孵育30分钟,加入GTP启动水解反应,继续孵育60分钟。采用孔雀石绿磷酸检测试剂盒测定GTP水解产生的游离磷酸含量,通过抑制曲线的非线性回归分析计算Ki值[1]
- Rab7核苷酸结合实验(荧光偏振法):将荧光标记的GTP类似物(mant-GTP)与重组Rab7蛋白及不同浓度的CID-1067700混合,室温孵育60分钟后,用酶标仪测定荧光偏振值,通过竞争性置换mant-GTP确定CID-1067700与Rab7的结合亲和力[1]
细胞实验
为了使用 Rab7 抑制剂在体外处理人类和小鼠 B 细胞,将 CID-1067700 在 DMSO 中稀释并添加到细胞培养物中,最终浓度为 40 μM。在 B 细胞刺激开始时或用 LPS 加 IL-4、TGF-β、抗 δ/dex 和 RA 刺激 B 细胞后 66 小时添加 CID-1067700 或 DMSO,用于分析浆细胞存活率[2]。
- B细胞类转换实验:从C57BL/6小鼠分离脾B细胞,在含LPS和IL-4的培养基中培养,加入CID-1067700(1、5、10 μM),孵育72小时。流式细胞术检测IgA⁺和IgG1⁺ B细胞比例;提取细胞总RNA,实时定量RT-PCR分析Aicda和Prdm1的mRNA水平[2]
- 浆细胞凋亡实验:从小鼠脾脏分离原代浆细胞,用CID-1067700(5、10 μM)处理24小时,膜联蛋白V-FITC和PI染色后,流式细胞术定量凋亡率;裂解细胞后,Western blot检测Mcl-1蛋白表达[2]
- 晚期内体-溶酶体融合实验:HeLa细胞转染EGFP-Rab7质粒标记晚期内体,转染24小时后用CID-1067700(10 μM)处理16小时,再用溶酶体标志物(Lamp1抗体)染色,共聚焦显微镜观察,计算EGFP-Rab7与Lamp1的共定位系数以评估融合效率[1]
动物实验
小鼠狼疮模型(MRL/lpr 小鼠):将 8-10 周龄的雌性 MRL/lpr 小鼠随机分为对照组(载体组)和 CID-1067700 治疗组。将 CID-1067700 溶解于合适的载体中,以 10 mg/kg 的剂量进行腹腔注射,每周 3 次,连续 4 周。每周测量小鼠体重。治疗结束后,处死小鼠,收集血清、脾脏和肾脏组织进行进一步分析(自身抗体检测、流式细胞术、组织学染色)[2]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体内毒性:CID-1067700(10 mg/kg,腹腔注射,每周 3 次,持续 4 周)在 MRL/lpr 小鼠中未引起明显的全身毒性,表现为体重稳定,主要器官(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏)无明显病理损伤,且血液学参数正常[2]
参考文献

[1]. A competitive nucleotide binding inhibitor: in vitro characterization of Rab7 GTPase inhibition. ACS Chem Biol. 2012 Jun 15;7(6):1095-108.

[2]. Small Molecule Inhibition of Rab7 Impairs B Cell Class Switching and Plasma Cell Survival To Dampen the Autoantibody Response in Murine Lupus. J Immunol. 2016 Nov 15;197(10):3792-3805.

其他信息
2-[[苯甲酰胺基(亚磺酰亚甲基)甲基]氨基]-5,5-二甲基-4,7-二氢噻吩并[2,3-c]吡喃-3-羧酸是一种噻吩并吡喃类化合物。
- CID-1067700 是一种小分子抑制剂,可特异性结合 Rab7 GTP 酶的核苷酸结合口袋,阻断 GTP 的结合和水解,从而抑制 Rab7 的功能[1]
- CID-1067700 在小鼠狼疮中的治疗作用与 B 细胞类别转换受损、浆细胞存活率降低和自身抗体产生减少有关[2]
- Rab7 GTP 酶在晚期内体成熟、溶酶体融合和细胞内运输中发挥关键作用,这些过程对于 B 细胞分化和浆细胞存活至关重要[1][2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H18N2O4S2
分子量
390.47652
精确质量
390.07
CAS号
314042-01-8
PubChem CID
1067700
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.681
LogP
4.76
tPSA
158.52
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
578
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
ATSWBWHRHAQVFM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H18N2O4S2/c1-18(2)8-11-12(9-24-18)26-15(13(11)16(22)23)20-17(25)19-14(21)10-6-4-3-5-7-10/h3-7H,8-9H2,1-2H3,(H,22,23)(H2,19,20,21,25)
化学名
2-(benzoylcarbamothioylamino)-5,5-dimethyl-4,7-dihydrothieno[2,3-c]pyran-3-carboxylic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~12.5 mg/mL (~32.01 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5610 mL 12.8048 mL 25.6095 mL
5 mM 0.5122 mL 2.5610 mL 5.1219 mL
10 mM 0.2561 mL 1.2805 mL 2.5610 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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