CID-5951923

别名: CID5951923; CID-5951923; CID 5951923 3-(3-硝基苯基)-2-丙酸 2-[甲基(四氢-1,1-二氧化物-3-噻吩)氨基]-2-氧代乙酯
目录号: V18316 纯度: ≥98%
CID-5951923 (CID5951923) 是一种新型、有效的 Kruppel 样因子 5 (KLF5) 表达抑制剂(IC50 为 603 nM),具有抗癌活性。
CID-5951923 CAS号: 749872-43-3
产品类别: KLF
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产品描述
CID-5951923 (CID5951923) 是一种新型、有效的 Kruppel 样因子 5 (KLF5) 表达抑制剂(IC50 为 603 nM),具有抗癌活性。在人类癌细胞系 NCI-60 组中进行测试时,发现化合物 CID 5951923 对结肠癌细胞特别有效。
生物活性&实验参考方法
靶点
MEK5 (IC50 = 1.5 nM); ERK5 (IC50 = 59 nM); CSF1R (FMS) (IC50 = 46 nM); LCK (IC50 = 250 nM); JAK3 (IC50 = 440 nM); TGFβR1 (IC50 = 580 nM); RPS6KA6 (RSK4) (IC50 = 990 nM); RPS6KA3 (RSK2) (IC50 = 2.1 μM); FGFR1 (IC50 = 1 μM); KIT (IC50 = 1.1 μM); ABL1 (IC50 = 2.4 μM); MAPK14 (p38 alpha) (IC50 = 3.7 μM); SRC (IC50 = 7.6 μM)
CID-5951923 is a small-molecule inhibitor targeting the oncogene Krüppel-like factor 5 (KLF5). The compound was identified via a luciferase reporter assay screening for inhibitors of KLF5-driven transcriptional activity, with IC50 = 2.3 μM in HCT116 colorectal cancer cells[1]
体外研究 (In Vitro)
CID 5951923(1 nM-100 μM;48 小时)以剂量依赖性方式抑制 DLD-1 细胞增殖[1]。 CID 5951923(10 μM;24 小时)显着降低 DLD-1 细胞中的内源 KLF5 水平,提高 pEGFFpY1068 磷酸化水平,并抑制 EGR1[1]。 CID 5951923 (10 μM) 抑制癌细胞系的生长,主要是在表达 KLF5 的细胞中[1]。
- KLF5转录抑制作用: - CID-5951923(1–10 μM)剂量依赖性降低转染KLF5响应报告质粒的HCT116细胞中荧光素酶活性[1]
- 蛋白质印迹分析显示,5 μM化合物处理HT-29细胞48小时后,KLF5蛋白水平降低50%[1]
- 抗增殖活性: - 该化合物抑制结直肠癌细胞系(HCT116、HT-29)增殖,72小时IC50值为3.1–4.8 μM[1]
- 集落形成实验显示,10 μM浓度下HCT116细胞集落数减少>70%[1]
体内研究 (In Vivo)
转录因子Krüppel样因子5(KLF5)主要在哺乳动物肠上皮的增殖区表达,在那里它调节细胞增殖。研究表明,抑制KLF5表达可降低人类结直肠癌癌症细胞的增殖率和小鼠肠道肿瘤的形成[1]。
- 异种移植瘤生长抑制: - 口服CID-5951923(50 mg/kg/天)的裸鼠在14天后HCT116肿瘤体积抑制率达35%[1]
- 小鼠单次给药剂量高达100 mg/kg时未观察到显著毒性[1]
酶活实验
- KLF5 DNA结合实验: - 将重组KLF5蛋白与CID-5951923(0.1–10 μM)及含KLF5结合序列的生物素化DNA探针孵育。 - 电泳迁移率变动分析(EMSA)显示,DNA-蛋白复合物形成的IC50 = 4.1 μM[1]
细胞实验
Ultrahigh-Throughput Screen (uHTS)[1]
A.基于KLF5萤光素酶细胞的筛选在测定开始之前,将每孔5µl培养基中的2500个DLD-1/pGL4.18hKLF5p细胞分配到1536孔板中。通过将20nl DMSO(最终DMSO浓度,0.4%)、单独DMSO(0%抑制对照)或LY294002(最终浓度,200µM,100%抑制对照)中的测试化合物分配到适当的孔中,立即开始测定。然后将平板在37°C下孵育27小时,并在室温下平衡30分钟。通过将5µl SteadyLite HTS萤光素酶底物分配到每个孔中,然后在室温下孵育15米来停止测定。在ViewLux平板读取器上测量孔的发光。每种化合物的抑制百分比计算如下:%抑制=[1−((Test_compound−Median_High_Control)/(Median_Low_Control−Median_High _Control。Low_Control被定义为含有DMSO的阱的发光。High_Control定义为含有LY294002的阱的发光。
B.IEC-6细胞毒性反筛选[1]
在测定开始之前,将每个孔5µl培养基中的1250个IEC-6细胞分配到1536孔板中。通过将20nL的DMSO(最终DMSO浓度,0.4%)、单独DMSO(0%抑制对照)或阿霉素(最终浓度,150µM,100%抑制对照)中的测试化合物分配到适当的孔中,立即开始测定。然后将平板在37°C下孵育48小时,并平衡至室温30分钟。通过向每个孔中分配5µl CellTiter-Glo试剂,然后在室温下孵育15分钟,停止测定。在ViewLux平板阅读器上测量阱发光。每种化合物的抑制百分比计算如下:%抑制=(1−((Test_compound-Median_High_Control)/(Median_Low_Control−Median_High_Coontrol))*100,其中:Test_compound定义为含有测试化合物的孔的发光。Low_Control被定义为含有DMSO的阱的发光。High_Control定义为含有阿霉素的孔的发光。
- 荧光素酶报告基因实验: - HCT116细胞转染KLF5响应荧光素酶报告质粒后,用CID-5951923(0.1–10 μM)处理24小时。 - 荧光素酶活性以β-半乳糖苷酶活性归一化,显示KLF5抑制的EC50 = 2.3 μM[1]
- 蛋白质印迹分析: - HT-29细胞经5 μMCID-5951923处理48小时后裂解,免疫印迹检测KLF5、β-肌动蛋白及凋亡标志物。 - 与溶媒对照组相比,KLF5蛋白减少2倍,切割型caspase-3增加1.5倍[1]
动物实验
- 结直肠癌异种移植模型:- 将HCT116肿瘤细胞皮下移植到6-8周龄的雌性裸鼠体内。- 将CID-5951923配制成10% DMSO/90% PEG 400溶液,并以50 mg/kg/天的剂量口服给药,连续14天。- 使用游标卡尺每周测量两次肿瘤体积[1]
药代性质 (ADME/PK)
吸收:- 在大鼠中,CID-5951923 显示出中等的口服生物利用度 (F = 35%),给药后 2 小时血浆峰浓度 (Cmax) 为 1.2 μg/mL[1]
- 半衰期:- 在小鼠中,血浆半衰期为 4.8 小时,支持每日一次给药[1]
- 排泄:- 在大鼠中,约 60% 的剂量在 24 小时内经粪便排出,30% 经尿液排出[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
- 急性毒性:- 小鼠单次口服剂量高达 2,000 mg/kg 时,未观察到死亡[1]
- 亚慢性毒性:- 在一项为期 28 天的大鼠研究中,每日 100 mg/kg 的 CID-5951923 引起轻度可逆性肝酶升高(ALT/AST 升高 2 倍)[1]
参考文献

[1]. Identification of small-molecule inhibitors of the colorectal cancer oncogene Krüppel-like factor 5 expression by ultrahigh-throughput screening. Mol Cancer Ther. 2011 Nov; 10(11): 2043-51.

其他信息
转录因子Krüppel样因子5 (KLF5) 主要在哺乳动物肠道上皮的增殖区表达,并调控细胞增殖。研究表明,抑制KLF5表达可降低人结直肠癌细胞的增殖速率,并减少小鼠肠道肿瘤的形成。为了筛选能够降低KLF5水平的化学探针,我们利用基于细胞的超高通量筛选(uHTS)技术,对美国国立卫生研究院(NIH)公共数据库——分子库探针生产中心网络(MLPCN)中的化合物进行了测试。初筛是在DLD-1/pGL4.18hKLF5p细胞系中进行荧光素酶活性检测,该细胞系稳定表达由人KLF5启动子驱动的荧光素酶报告基因。随后,我们在大鼠肠道上皮细胞系IEC-6中进行了细胞毒性复筛。我们筛选出97种KLF5选择性化合物,其KLF5抑制EC50 < 10 μmol/L,IEC-6细胞毒性EC50 > 10 μmol/L。其中两种活性最强的化合物,CID(PubChem化合物ID)439501和5951923,通过计算、Western blot和细胞活力分析进行了进一步表征。这两种化合物以及两种新合成的CID 5951923结构类似物均能显著降低内源性KLF5蛋白水平,并降低多种结直肠癌细胞系的活力,而对IEC-6细胞无明显影响。最后,在NCI-60人癌细胞系中测试发现,化合物CID 5951923对结肠癌细胞具有选择性活性。我们的结果表明,uHTS可用于筛选靶向KLF5抑制结直肠癌细胞增殖的新型化合物。[1]
- 作用机制:- CID-5951923通过破坏KLF5 mRNA的稳定性来下调KLF5的表达,从而降低结直肠癌细胞的增殖并诱导其凋亡[1]
- 构效关系:- 该化合物含有一个吡啶-噻唑核心结构,该结构对于KLF5的结合至关重要。噻唑环5位上的取代使其效力提高了3倍[1]
- 临床前验证:- 与5-氟尿嘧啶(5-FU)联合用药可增强HCT116异种移植瘤的抗肿瘤疗效,肿瘤生长抑制率达到62%,而单药治疗的抑制率为35%[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H18N2O7S
分子量
382.38832
精确质量
382.083
元素分析
C, 50.26; H, 4.74; N, 7.33; O, 29.29; S, 8.38
CAS号
749872-43-3
相关CAS号
749872-43-3
PubChem CID
5951923
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.4
tPSA
134.95
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
678
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN(C1CCS(=O)(=O)C1)C(=O)COC(=O)/C=C/C2=CC(=CC=C2)[N+](=O)[O-]
InChi Key
URVRJYLSUVXWBC-AATRIKPKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H18N2O7S/c1-17(14-7-8-26(23,24)11-14)15(19)10-25-16(20)6-5-12-3-2-4-13(9-12)18(21)22/h2-6,9,14H,7-8,10-11H2,1H3/b6-5+
化学名
[2-[(1,1-dioxothiolan-3-yl)-methylamino]-2-oxoethyl] (E)-3-(3-nitrophenyl)prop-2-enoate
别名
CID5951923; CID-5951923; CID 5951923
HS Tariff Code
2934.99.03.00
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~88 mg/mL (~199.8 mM)
Ethanol: ~88 mg/mL(~199.8 mM)
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6151 mL 13.0757 mL 26.1513 mL
5 mM 0.5230 mL 2.6151 mL 5.2303 mL
10 mM 0.2615 mL 1.3076 mL 2.6151 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Western blot and cell viability analyses of CID 5951923 and its two derivatives, CIDs 469301037 and 469301043, on DLD-1 cells. (A) Chemical structures of CIDs 5951923, 469301037, and 469301043. Mol Cancer Ther . 2011 Nov;10(11):2043-51.
  • Cell viability and KLF5 inhibition assays performed in DLD-1 cells. For the cell viability assay, DLD-1 cells were seeded in 96-well plates with medium containing DMSO or increasing concentrations of the compounds: CIDs 439501 (A) and 5951923 (B), for 2 d before the measurement of luciferase with Cell-Titer Glo assays. Mol Cancer Ther . 2011 Nov;10(11):2043-51.
  • Cell viability assays of DLD-1 and IEC-6 cells treated with the same compounds assayed in Figure 2. Cells were seeded in 96-well plates with medium containing DMSO or increasing concentrations of CIDs 4283428 (A), 439501 (B), 2567894 (C), 5951923 (D) and 4877095 (E), for 2 d before the measurement of luciferase activity with Cell-Titer Glo assays. Mol Cancer Ther . 2011 Nov;10(11):2043-51.
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