CID-5951923

别名: CID5951923; CID-5951923; CID 5951923 3-(3-硝基苯基)-2-丙酸 2-[甲基(四氢-1,1-二氧化物-3-噻吩)氨基]-2-氧代乙酯
目录号: V18316 纯度: ≥98%
CID-5951923 (CID5951923) 是一种新型、有效的 Kruppel 样因子 5 (KLF5) 表达抑制剂(IC50 为 603 nM),具有抗癌活性。
CID-5951923 CAS号: 749872-43-3
产品类别: KLF
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
CID-5951923 (CID5951923) 是一种新型、有效的 Kruppel 样因子 5 (KLF5) 表达抑制剂(IC50 为 603 nM),具有抗癌活性。在人类癌细胞系 NCI-60 组中进行测试时,发现化合物 CID 5951923 对结肠癌细胞特别有效。
生物活性&实验参考方法
靶点
MEK5 (IC50 = 1.5 nM); ERK5 (IC50 = 59 nM); CSF1R (FMS) (IC50 = 46 nM); LCK (IC50 = 250 nM); JAK3 (IC50 = 440 nM); TGFβR1 (IC50 = 580 nM); RPS6KA6 (RSK4) (IC50 = 990 nM); RPS6KA3 (RSK2) (IC50 = 2.1 μM); FGFR1 (IC50 = 1 μM); KIT (IC50 = 1.1 μM); ABL1 (IC50 = 2.4 μM); MAPK14 (p38 alpha) (IC50 = 3.7 μM); SRC (IC50 = 7.6 μM)
体外研究 (In Vitro)
CID 5951923(1 nM-100 μM;48 小时)以剂量依赖性方式抑制 DLD-1 细胞增殖[1]。 CID 5951923(10 μM;24 小时)显着降低 DLD-1 细胞中的内源 KLF5 水平,提高 pEGFFpY1068 磷酸化水平,并抑制 EGR1[1]。 CID 5951923 (10 μM) 抑制癌细胞系的生长,主要是在表达 KLF5 的细胞中[1]。
体内研究 (In Vivo)
转录因子Krüppel样因子5(KLF5)主要在哺乳动物肠上皮的增殖区表达,在那里它调节细胞增殖。研究表明,抑制KLF5表达可降低人类结直肠癌癌症细胞的增殖率和小鼠肠道肿瘤的形成[1]。
细胞实验
Ultrahigh-Throughput Screen (uHTS)[1]
A.基于KLF5萤光素酶细胞的筛选在测定开始之前,将每孔5µl培养基中的2500个DLD-1/pGL4.18hKLF5p细胞分配到1536孔板中。通过将20nl DMSO(最终DMSO浓度,0.4%)、单独DMSO(0%抑制对照)或LY294002(最终浓度,200µM,100%抑制对照)中的测试化合物分配到适当的孔中,立即开始测定。然后将平板在37°C下孵育27小时,并在室温下平衡30分钟。通过将5µl SteadyLite HTS萤光素酶底物分配到每个孔中,然后在室温下孵育15米来停止测定。在ViewLux平板读取器上测量孔的发光。每种化合物的抑制百分比计算如下:%抑制=[1−((Test_compound−Median_High_Control)/(Median_Low_Control−Median_High _Control。Low_Control被定义为含有DMSO的阱的发光。High_Control定义为含有LY294002的阱的发光。
B.IEC-6细胞毒性反筛选[1]
在测定开始之前,将每个孔5µl培养基中的1250个IEC-6细胞分配到1536孔板中。通过将20nL的DMSO(最终DMSO浓度,0.4%)、单独DMSO(0%抑制对照)或阿霉素(最终浓度,150µM,100%抑制对照)中的测试化合物分配到适当的孔中,立即开始测定。然后将平板在37°C下孵育48小时,并平衡至室温30分钟。通过向每个孔中分配5µl CellTiter-Glo试剂,然后在室温下孵育15分钟,停止测定。在ViewLux平板阅读器上测量阱发光。每种化合物的抑制百分比计算如下:%抑制=(1−((Test_compound-Median_High_Control)/(Median_Low_Control−Median_High_Coontrol))*100,其中:Test_compound定义为含有测试化合物的孔的发光。Low_Control被定义为含有DMSO的阱的发光。High_Control定义为含有阿霉素的孔的发光。
参考文献

[1]. Identification of small-molecule inhibitors of the colorectal cancer oncogene Krüppel-like factor 5 expression by ultrahigh-throughput screening. Mol Cancer Ther. 2011 Nov; 10(11): 2043-51.

其他信息
The transcription factor Krüppel-like factor 5 (KLF5) is primarily expressed in the proliferative zone of the mammalian intestinal epithelium, where it regulates cell proliferation. Studies showed that inhibition of KLF5 expression reduces proliferation rates in human colorectal cancer cells and intestinal tumor formation in mice. To identify chemical probes that decrease levels of KLF5, we used cell-based ultrahigh-throughput screening (uHTS) to test compounds in the public domain of NIH, the Molecular Libraries Probe Production Centers Network library. The primary screen involved luciferase assays in the DLD-1/pGL4.18hKLF5p cell line, which stably expressed a luciferase reporter driven by the human KLF5 promoter. A cytotoxicity counterscreen was done in the rat intestinal epithelial cell line, IEC-6. We identified 97 KLF5-selective compounds with EC(50) < 10 μmol/L for KLF5 inhibition and EC(50) > 10 μmol/L for IEC-6 cytotoxicity. The two most potent compounds, CIDs (PubChem Compound IDs) 439501 and 5951923, were further characterized on the basis of computational, Western blot, and cell viability analyses. Both of these compounds, and two newly synthesized structural analogs of CID 5951923, significantly reduced endogenous KLF5 protein levels and decreased viability of several colorectal cancer cell lines without any apparent impact on IEC-6 cells. Finally, when tested in the NCI-60 panel of human cancer cell lines, compound CID 5951923 was selectively active against colon cancer cells. Our results show the feasibility of uHTS in identifying novel compounds that inhibit colorectal cancer cell proliferation by targeting KLF5.[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H18N2O7S
分子量
382.38832
精确质量
382.083
元素分析
C, 50.26; H, 4.74; N, 7.33; O, 29.29; S, 8.38
CAS号
749872-43-3
相关CAS号
749872-43-3
PubChem CID
5951923
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.4
tPSA
134.95
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
678
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN(C1CCS(=O)(=O)C1)C(=O)COC(=O)/C=C/C2=CC(=CC=C2)[N+](=O)[O-]
InChi Key
URVRJYLSUVXWBC-AATRIKPKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H18N2O7S/c1-17(14-7-8-26(23,24)11-14)15(19)10-25-16(20)6-5-12-3-2-4-13(9-12)18(21)22/h2-6,9,14H,7-8,10-11H2,1H3/b6-5+
化学名
[2-[(1,1-dioxothiolan-3-yl)-methylamino]-2-oxoethyl] (E)-3-(3-nitrophenyl)prop-2-enoate
别名
CID5951923; CID-5951923; CID 5951923
HS Tariff Code
2934.99.03.00
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~88 mg/mL (~199.8 mM)
Ethanol: ~88 mg/mL(~199.8 mM)
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6151 mL 13.0757 mL 26.1513 mL
5 mM 0.5230 mL 2.6151 mL 5.2303 mL
10 mM 0.2615 mL 1.3076 mL 2.6151 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Western blot and cell viability analyses of CID 5951923 and its two derivatives, CIDs 469301037 and 469301043, on DLD-1 cells. (A) Chemical structures of CIDs 5951923, 469301037, and 469301043. Mol Cancer Ther . 2011 Nov;10(11):2043-51.
  • Cell viability and KLF5 inhibition assays performed in DLD-1 cells. For the cell viability assay, DLD-1 cells were seeded in 96-well plates with medium containing DMSO or increasing concentrations of the compounds: CIDs 439501 (A) and 5951923 (B), for 2 d before the measurement of luciferase with Cell-Titer Glo assays. Mol Cancer Ther . 2011 Nov;10(11):2043-51.
  • Cell viability assays of DLD-1 and IEC-6 cells treated with the same compounds assayed in Figure 2. Cells were seeded in 96-well plates with medium containing DMSO or increasing concentrations of CIDs 4283428 (A), 439501 (B), 2567894 (C), 5951923 (D) and 4877095 (E), for 2 d before the measurement of luciferase activity with Cell-Titer Glo assays. Mol Cancer Ther . 2011 Nov;10(11):2043-51.
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