CY2-SE

别名: 2-[3-[3-[6-[(2,5-二氧代-1-吡咯烷基)氧基]-6-氧代己基]-2(3H)-苯并恶唑亚基]-1-丙烯基]-3-乙基苯并恶唑鎓碘化物;CY2-SE
目录号: V32120 纯度: ≥98%
Cy2-SE 碘是一种 CY 染料。
CY2-SE CAS号: 186205-33-4
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
100mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
Cy2-SE碘是一种CY染料。CY是花菁的缩写,花菁是由两个氮原子通过奇数个甲基单元连接而成的化合物。花菁化合物具有长波长、吸收和发射可调、消光系数高、水溶性好、合成相对简单等特点。CY染料常用于标记蛋白质、抗体和小分子化合物。对于蛋白质抗体的标记,可通过简单的混合反应完成结合。下面我们将介绍蛋白质抗体的标记方法,具有一定的参考意义。
CY2-SE(CAS号:186205-33-4)是一种胺反应性荧光探针,属于花菁染料家族,具体来说是Cy2系列。它是一种琥珀酰亚胺酯(NHS酯)衍生物,可与伯胺反应形成稳定的共价酰胺键。CY2-SE常用于各种生物化学和细胞生物学应用中蛋白质、抗体、肽和寡核苷酸的荧光标记。该化合物的分子式为C29H30IN3O6,分子量为643.47。
生物活性&实验参考方法
靶点
CY2-SE is a fluorescent labeling reagent that targets primary amine groups (-NH2) present in proteins, peptides, and oligonucleotides. The N-hydroxysuccinimidyl (NHS) ester moiety reacts with nucleophilic primary amines under mild alkaline conditions (pH 7-9) to form stable, covalent amide bonds. This reaction mechanism enables the covalent attachment of the Cy2 fluorophore to target biomolecules, facilitating their detection, tracking, and quantification in various experimental systems.
体外研究 (In Vitro)
方案一:最佳蛋白制备:1)请将蛋白(抗体)浓度配制至 2 mg/mL 以获得标记效果。2)蛋白溶液的 pH 值为 8.5±0.5。3)如果 pH 值低于 8.0,则应使用 1M 蛋白溶液。如果蛋白浓度低于 2 mg/mL,标记效率将显著降低。建议最终蛋白浓度范围为 2–10 mg/mL,以获得最佳标记效率。4)伯明翰 2 号溶液必须对蛋白透明。染料的制备(以 CY3-NHS 酯为例):将 10 倍体积的无水 DMSO 倒入 CY3-NHS 酯小瓶中。反应所需的染料(CY3-NHS 酯)用量取决于 CY3-NHS 与蛋白的理想摩尔比以及标记蛋白的量。例如:假设所需的标记蛋白为 500 μL 浓度为 2 mg/mL 的 IgG(MW=150,000),则将 1 mg CY3-NHS 酯溶解于 100 μL DMSO 中。这样即可得到所需体积的 CY3-NHS 酯,即 5.05 μL。计算步骤如下:1) mmol (IgG) = mg/mL (IgG) × mL (IgG)/MW (IgG) = 2 mg/mL × 0.5 mL/150,000 mg/mmol = 6.7×10⁻⁶ mmol 2) mmol (CY3-NHS酯) = mmol (IgG) × 10 = 6.7×10⁻⁶ mmol × 10 = 6.7 × 10⁻⁵ mmol 3) μL (CY3-NHS酯) = mmol (CY3-NHS酯) × MW (CY3-NHS酯)/mg/μL (CY3-NHS酯) = 6.7 × 10⁻⁵ mmol × 753.88 mg/mmol/0.01 mg/μL = 5.05 μL (CY3-NHS酯) 4. 执行偶联反应 1:逐步加入新合成的 10将 mg/mL CY3-NHS 酯加入 0.5 mL 蛋白质样品溶液中,轻轻摇晃使其混合均匀,快速离心,并从反应管底部取出样品。2) 在接下来的 60 分钟内,将反应管置于黑暗处并轻轻翻转。10 至 15 分钟后,逐渐逆转反应步骤 5。偶联物:使用 SepHadex G-25 色谱柱,以下方法演示了如何封闭染料-偶联物。1) 根据制造商的指南组装 SepHadex G-25 色谱柱。2) 将反应混合物(来自“运行偶联反应”)填充到 SepHadex G-25 色谱柱中。3) 当样品流出至树脂表面以下时,立即加入 PBS(pH 7.2–7.4)。4) 为完成柱挤出,向相应的样品中加入额外的 PBS(pH 7.2–7.4)。混合含有所需染料-蛋白质偶联物的馏分。
CY2-SE 的激发波长和发射波长最大值分别为 473 nm 和 510 nm。该化合物为结晶固体,纯度≥98%,可溶于 DMF、DMSO 和 DMF:PBS 混合溶剂。作为一种胺反应探针,CY2-SE 可通过 NHS 酯化学反应高效标记靶生物分子上的氨基,形成稳定的共价键。CY2-SE 染料与蛋白质的最佳标记摩尔比约为 10:1。
体内研究 (In Vivo)
由于CY2-SE具有反应活性的NHS酯化学性质,会非特异性地标记多种蛋白质,因此通常不用于体内应用。该化合物主要用于体外标记纯化的蛋白质、抗体和其他生物分子,以用于下游应用,包括荧光显微镜、流式细胞术、蛋白质印迹法和其他检测方法。
酶活实验
CY2-SE标记蛋白质:将蛋白质(抗体)配制成浓度为2 mg/mL的缓冲液,pH值为8.5+/-0.5。将CY2-SE溶解于无水DMF或DMSO中,配制成适当浓度。将染料溶液以约10:1的摩尔比(染料:蛋白质)加入蛋白质溶液中。将反应混合物在室温下轻柔搅拌孵育1-2小时。通过透析、凝胶过滤或尺寸排阻色谱法去除未反应的染料。通过测量280 nm(蛋白质)和486 nm(Cy2)处的吸光度来确定标记效率。
细胞实验
CY2-SE 用于体外实验中蛋白质和抗体的标记。将细胞或组织与 CY2-SE 标记的探针孵育,然后通过荧光显微镜或流式细胞术进行检测。对于抗体标记,将纯化的抗体在与蛋白质标记相同的条件下与 CY2-SE 孵育。标记后的抗体随后用于固定细胞或组织切片的免疫荧光染色。对于寡核苷酸标记,将胺基修饰的寡核苷酸在合适的缓冲液中与 CY2-SE 反应。
动物实验
由于CY2-SE具有反应活性,因此不适用于体内动物实验。该化合物严格来说是一种体外标记试剂。在动物实验中,可使用预先标记的生物分子(例如,CY2-SE标记的抗体或肽)来追踪其分布或靶点结合情况,但染料本身不会直接注射到动物体内。标记探针通常通过静脉注射或腹腔注射给药,剂量根据具体的实验需求而定。
药代性质 (ADME/PK)
CY2-SE并非治疗性化合物,其药代动力学数据不适用。该化合物是一种用于体外标记生物分子的研究试剂。一旦与蛋白质或抗体偶联,标记探针的药代动力学将由载体分子而非染料本身决定。CY2-SE不适用于以游离化合物形式进行体内给药。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
CY2-SE 是一种胺反应性荧光探针,不适用于治疗用途。由于该化合物仅用作标记试剂而非治疗剂,因此其毒性数据有限。处理 CY2-SE 时应遵循标准实验室安全操作规程,包括使用适当的个人防护装备。该化合物应在通风橱内操作,并避免接触皮肤和眼睛。处置应遵循机构化学废弃物处理指南。
参考文献

[1]. Ptaszek M. Rational design of fluorophores for in vivo applications. Prog Mol Biol Transl Sci. 2013;113:59-108.

[2]. Shindy, H. A. (2017). Fundamentals in the chemistry of cyanine dyes: A review. Dyes and Pigments, 145, 505–513. doi:10.1016/j.dyepig.2017.06.029.

其他信息
CY2-SE(花菁2琥珀酰亚胺酯)是一种荧光标记试剂,用于蛋白质、肽和寡核苷酸上伯胺的共价修饰。其激发/发射波长最大值分别为473/510 nm。NHS酯基团使其能够在温和条件下高效标记。CY2-SE广泛应用于生物化学研究中的荧光检测和成像。该化合物仅供研究使用,未获准用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H30IN3O6
分子量
643.469480037689
精确质量
643.117
CAS号
186205-33-4
PubChem CID
121596142
外观&性状
Orange to red solid powder
tPSA
93.2
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
919
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCN\1C2=CC=CC=C2O/C1=C\C=C\C3=[N+](C4=CC=CC=C4O3)CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O.[I-]
InChi Key
RQYPAAVMQSMNBY-UHFFFAOYSA-M
InChi Code
InChI=1S/C29H30N3O6.HI/c1-2-30-21-11-5-7-13-23(21)36-27(30)15-10-16-28-31(22-12-6-8-14-24(22)37-28)20-9-3-4-17-29(35)38-32-25(33)18-19-26(32)34;/h5-8,10-16H,2-4,9,17-20H2,1H3;1H/q+1;/p-1
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[2-[(E,3Z)-3-(3-ethyl-1,3-benzoxazol-2-ylidene)prop-1-enyl]-1,3-benzoxazol-3-ium-3-yl]hexanoate;iodide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~62.5 mg/mL (~97.13 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 3.13 mg/mL (4.86 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 31.3mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5541 mL 7.7704 mL 15.5407 mL
5 mM 0.3108 mL 1.5541 mL 3.1081 mL
10 mM 0.1554 mL 0.7770 mL 1.5541 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们